| 中文摘要 | 第3-6页 |
| 英文摘要 | 第6-9页 |
| 1 绪论 | 第14-16页 |
| 2 文献综述 | 第16-26页 |
| 2.1 芽孢杆菌的分类地位和生防应用 | 第16-17页 |
| 2.2 芽孢杆菌的生防机理 | 第17-18页 |
| 2.2.1 外分泌抗菌物质 | 第17-18页 |
| 2.2.2 相互竞争作用 | 第18页 |
| 2.2.3 促进生长作用 | 第18页 |
| 2.2.4 诱导植物抗性 | 第18页 |
| 2.3 手性化合物，天然与合成的，历史发现作用 | 第18-26页 |
| 2.3.1 D型氨基酸的细胞内分布和作用 | 第20-21页 |
| 2.3.2 微生物中D型氨基酸的合成途径 | 第21-23页 |
| 2.3.3 微生物细胞壁中的D型氨基酸分布 | 第23-26页 |
| 3 解淀粉芽孢杆菌CQBA03基因组文库的构建 | 第26-50页 |
| 3.1 Fosmid库简介、背景和方法 | 第26页 |
| 3.2 研究内容 | 第26-27页 |
| 3.2.1 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株基因组文库的构建 | 第26-27页 |
| 3.2.2 抗菌基因组文库克隆的筛选 | 第27页 |
| 3.2.3 抗菌克隆的测序、信息学分析、大量筛选 | 第27页 |
| 3.2.4 相关基因序列的获得和信息学研究 | 第27页 |
| 3.2.5 相关抗Xcc菌基因功能验证和表达 | 第27页 |
| 3.3 研究技术路线 | 第27-28页 |
| 3.4 试验材料 | 第28-30页 |
| 3.4.1 主要仪器设备 | 第28页 |
| 3.4.2 主要试剂、培养基 | 第28-30页 |
| 3.5 实验步骤 | 第30-41页 |
| 3.5.1 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株和EPI300菌株的兼容性实验 | 第30-31页 |
| 3.5.2 Fosmid文库构建方法 | 第31页 |
| 3.5.3 总DNA提取方法的优化及解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株高质量DNA的获得 | 第31-33页 |
| 3.5.4 高质量基因组DNA的回收 | 第33页 |
| 3.5.5 随机切割插入DNA片段 | 第33-34页 |
| 3.5.6 插入DNA的末端修复 | 第34页 |
| 3.5.7 末端修复DNA大小的选择 | 第34-35页 |
| 3.5.8 回收已分离大小的DNA | 第35-36页 |
| 3.5.9 Copycontrol Fosmid克隆的包装 | 第36-37页 |
| 3.5.10 Fosmid克隆质粒的提取 | 第37-38页 |
| 3.5.11质粒的酶切 | 第38页 |
| 3.5.12蛋白酶克隆子的筛选和获得 | 第38-39页 |
| 3.5.13含有抗溃疡病基因的文库克隆筛选 | 第39页 |
| 3.5.14文库克隆的测序和分析,抗微生物基因相关基因筛选 | 第39-40页 |
| 3.5.15抗柑橘溃疡病病菌基因的筛选、克隆、表达 | 第40-41页 |
| 3.6 结果与分析 | 第41-50页 |
| 3.6.1 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株和EPI300菌的混合培养实验 | 第41-42页 |
| 3.6.2 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株总DNA的提取条件的摸索 | 第42-43页 |
| 3.6.3 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株基因组DNA的优化 | 第43-44页 |
| 3.6.4 补平末端和合适大小片段的回收 | 第44页 |
| 3.6.5 文库效价 | 第44-45页 |
| 3.6.6 文库容量 | 第45-46页 |
| 3.6.7 蛋白酶克隆子的筛选 | 第46-47页 |
| 3.6.8 蛋白酶克隆的复筛 | 第47-48页 |
| 3.6.9 抗菌克隆子的获得 | 第48-50页 |
| 4 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株基因组Fosmid文库06号克隆分析 | 第50-76页 |
| 4.1 06号文库克隆ORF注释信息 | 第50-52页 |
| 4.2 ORF功能归类 | 第52-53页 |
| 4.3 解淀粉芽孢杆菌菌株CQBA03菌株生理相关基因注释 | 第53-57页 |
| 4.4 解淀粉芽孢杆菌菌株CQBA03菌株抗微生物相关基因注释 | 第57-60页 |
| 4.5 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株未知基因注释 | 第60-63页 |
| 4.6 解淀粉芽孢杆菌株CQBA03昆虫毒性蛋白 | 第63页 |
| 4.7 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株Fosmid文库06号克隆KEGG分析 | 第63-74页 |
| 小结 | 第74-76页 |
| 5 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株抗菌小肽基因的筛选和表达 | 第76-90页 |
| 5.1 研究内容 | 第76页 |
| 5.1.1 相关基因序列的获得和信息学研究 | 第76页 |
| 5.1.2 相关抗菌基因功能验证和表达 | 第76页 |
| 5.2 研究技术路线 | 第76-77页 |
| 5.3 材料 | 第77-79页 |
| 5.3.1 供试材料及菌株 | 第77页 |
| 5.3.2 主要仪器设备 | 第77-78页 |
| 5.3.3 主要试剂及配方 | 第78-79页 |
| 5.4 实验步骤 | 第79-83页 |
| 5.4.1 抗柑橘溃疡溃疡病菌基因的筛选和克隆 | 第79-80页 |
| 5.4.2 基因生物信息学分析 | 第80页 |
| 5.4.3 抗柑橘溃疡溃疡病菌基因的克隆、表达、纯化和分析 | 第80-83页 |
| 5.4.4 蛋白样品浓度测定 | 第83页 |
| 5.5 结果 | 第83-87页 |
| 5.5.1 抗柑橘溃疡病病菌的可能外分泌基因的筛选和分析 | 第83-85页 |
| 5.5.2 抗柑橘溃疡病病菌的基因的克隆 | 第85-86页 |
| 5.5.3 抗柑橘溃疡病病菌的基因的表达、纯化和活性 | 第86-87页 |
| 5.6 小结 | 第87页 |
| 5.7 讨论 | 第87-90页 |
| 6 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株分泌D型氨基酸的抗菌/杀菌机制初步研究 | 第90-124页 |
| 6.1 引言 | 第90页 |
| 6.2 研究内容 | 第90-91页 |
| 6.3 研究技术路线 | 第91-92页 |
| 6.4 材料 | 第92-93页 |
| 6.4.1 供试材料及菌株 | 第92页 |
| 6.4.2 试剂及配方 | 第92页 |
| 6.4.3 仪器设备 | 第92-93页 |
| 6.5 研究方法 | 第93-103页 |
| 6.5.1 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株 1-15d分泌型氨基酸的分析 | 第93-94页 |
| 6.5.2 样本前处理 | 第94页 |
| 6.5.3 实验参数 | 第94-97页 |
| 6.5.4 D型氨基酸和L型氨基酸对Xcc菌体的抑制作用 | 第97页 |
| 6.5.5 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株中D型氨基酸的测定 | 第97-100页 |
| 6.5.6 D-aas和L-aas对Xcc菌体的最小抑制浓度 | 第100页 |
| 6.5.7 D型氨基酸对Xcc菌体形态的改变作用 | 第100-101页 |
| 6.5.8 D-亮氨酸对Xcc致病能力的改变 | 第101页 |
| 6.5.9 Xcc菌体细胞壁肽聚糖中氨基酸的测定 | 第101-102页 |
| 6.5.10 D-leu作用后Xcc细胞活力的改变 | 第102页 |
| 6.5.11实验室条件下， D-leu对对柑橘溃疡病(CBCD)的防治作用 | 第102-103页 |
| 6.6 研究结果 | 第103-121页 |
| 6.6.1 分泌的氨基酸种类 | 第103-104页 |
| 6.6.2 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株 1-15天分泌型氨基酸的含量 | 第104-105页 |
| 6.6.3 解淀粉芽孢杆菌CQBA03菌株培养液游离氨基酸含量变化 | 第105-107页 |
| 6.6.4 DL-亮氨酸的测定结果 | 第107-108页 |
| 6.6.5 D-aas和L-aas对Xcc菌体的最小抑制浓度 | 第108-109页 |
| 6.6.6 D-Leu对Xcc菌体形态的改变作用 | 第109-112页 |
| 6.6.7 低浓度D型亮氨酸酸对Xcc的影响 | 第112-113页 |
| 6.6.8 链状菌体的显微结构 | 第113-114页 |
| 6.6.9 D-Leu处理Xcc菌后，不同时期的菌体活力变化 | 第114-116页 |
| 6.6.10 D-Leu处理后Xcc菌后致病能力的变化 | 第116-117页 |
| 6.6.11实验室条件下， D-leu对对柑橘溃疡病(CBCD)的防治作用 | 第117-118页 |
| 6.6.12 D-leu对Xcc菌侵染能力的影响 | 第118-119页 |
| 6.6.13 D-Leu处理后Xcc菌细胞壁肽聚糖中氨基酸变化 | 第119-121页 |
| 6.7 小结 | 第121-122页 |
| 6.8 讨论 | 第122-124页 |
| 7 主要结论与后续工作建议 | 第124-126页 |
| 7.1 主要结果 | 第124页 |
| 7.2 创新点 | 第124页 |
| 7.3 后续工作建议 | 第124-126页 |
| 致谢 | 第126-128页 |
| 参考文献 | 第128-144页 |
| 附录 | 第144页 |
| A. 攻读博士期间主要个人成果及专利: | 第144页 |
