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马铃薯二倍体自交系群体建立与初步研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
第1章 绪论第8-17页
    1.1 马铃薯种质资源第8-10页
        1.1.1 马铃薯的起源第8页
        1.1.2 马铃薯种质资源系统分类简介第8-10页
    1.2 马铃薯细胞质遗传背景第10-13页
    1.3 马铃薯育种情况第13-15页
        1.3.1 马铃薯二倍体育种情况第14页
        1.3.2 马铃薯实生种第14-15页
    1.4 本研究的目的及意义第15-17页
第2章 二倍体自交系自交亲和性研究第17-22页
    2.1 引言第17-18页
    2.2 试验材料第18页
        2.2.1 植物材料第18页
        2.2.2 主要试验材料第18页
    2.3 试验方法第18-19页
        2.3.1 材料种植第18页
        2.3.2 植株长势观察第18页
        2.3.3 授粉第18页
        2.3.4 收获记载第18-19页
    2.4 结果与分析第19-21页
        2.4.1 观察结果第19-20页
        2.4.2 现蕾期第20页
        2.4.3 形态学第20页
        2.4.4 授粉情况(见附录)第20-21页
        2.4.5 部分种子发芽情况第21页
    2.5 讨论第21-22页
第3章 自交系群体细胞质遗传第22-32页
    3.1 引言第22页
    3.2 实验材料第22-23页
        3.2.1 植物材料第22-23页
        3.2.2 主要试剂和仪器第23页
    3.3 实验方法第23-26页
        3.3.1 DNA提取第23-24页
        3.3.2 单引物PCR扩增第24-25页
        3.3.3 酶切反应第25-26页
        3.3.4 电泳第26页
    3.4 结果与分析第26-30页
        3.4.1 扩增位点多态性第26-28页
        3.4.2 二倍体自交系细胞质遗传结果第28页
        3.4.3 普通栽培种细胞质类型第28-30页
    3.5 讨论第30-32页
第4章 全基因组重测序第32-48页
    4.1 引言第32-33页
    4.2 实验材料第33-34页
        4.2.1 植物材料第33-34页
        4.2.2 主要仪器及设备第34页
    4.3 实验方法第34-42页
        4.3.1 测序材料DNA提取第34页
        4.3.2 上机测序(10X )第34-36页
        4.3.3 数据分析第36-42页
    4.4 结果分析第42-45页
        4.4.1 测序结果(10X)第42页
        4.4.2 flagstat给出BAM文件的比对结果第42-43页
        4.4.3 SNP查找结果格式及统计结果第43-44页
        4.4.4 SNP过滤结果表示第44页
        4.4.5 计算结果表示第44-45页
    4.5 SNP杂合度结果第45-47页
    4.6 讨论第47-48页
第5章 小结第48-49页
参考文献第49-55页
附录第55-82页
攻读学位期间发表的学术论文和研究成果第82-83页
致谢第83页

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