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基于复杂网络理论和分子动力学模拟的脂肪酶热稳定性的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第9-14页
    1.1 蛋白质的热稳定性研究进展第9-10页
    1.2 脂肪酶的热稳定性研究第10-12页
        1.2.1 脂肪酶概述第10页
        1.2.2 脂肪酶的热稳定性第10-11页
        1.2.3 脂肪酶热稳定性的研究进展第11-12页
    1.3 本文的研究意义第12页
    1.4 本文的研究目标和内容第12-14页
第二章 脂肪酶的分子动力学模拟第14-20页
    2.1 引言第14页
    2.2 数据的预处理第14-17页
    2.3 脂肪酶分子动力学模拟第17-19页
        2.3.1 脂肪酶分子动力学模拟软件第17-18页
        2.3.2 脂肪酶分子动力学模拟过程第18-19页
    2.4 本章小结第19-20页
第三章 氢键动力学与脂肪酶热稳定性的关系研究第20-30页
    3.1 引言第20页
    3.2 氢键动力学第20-21页
    3.3 氢键稳定性第21-22页
    3.4 脂肪酶的热稳定性与氢键动力学关系第22-24页
        3.4.1 野生型氢键稳定性随时间变化分析第22页
        3.4.2 突变体 2D9氢键稳定性随时间变化分析第22-23页
        3.4.3 突变体 6B氢键稳定性随时间变化分析第23-24页
        3.4.4 氢键稳定性与模拟温度的关系第24页
    3.5 突变点氢键稳定性对脂肪酶热稳定性的影响第24-28页
    3.6 非突变位点氢键稳定性对脂肪酶热稳定性的影响第28-29页
    3.7 本章小结第29-30页
第四章 氢键网络与脂肪酶热稳定性的关系研究第30-38页
    4.1 引言第30页
    4.2 氢键网络的构建第30-33页
        4.2.1 氢键网络第30页
        4.2.3 氢键网络的构建第30-33页
    4.3 氢键网络与脂肪酶二级结构关系第33-36页
    4.4 氢键网络与脂肪酶热稳定性的关系第36-37页
    4.5 本章小结第37-38页
第五章 盐桥与脂肪酶热稳定性的关系研究第38-44页
    5.1 引言第38页
    5.2 盐桥稳定性第38页
    5.3 野生型脂肪酶和突变体之间盐桥稳定性比较第38-40页
    5.4 野生型脂肪酶和突变体盐桥网络稳定性比较第40-43页
    5.5 本章小结第43-44页
第六章 基于复杂网络理论的脂肪酶热稳定性研究第44-57页
    6.1 引言第44-45页
    6.2 网络拓扑属性第45-46页
    6.3 脂肪酶的网络拓扑属性分析第46-56页
    6.4 本章小结第56-57页
第七章 时间序列算法和神经网络预测脂肪酶耐热性第57-80页
    7.1 引言第57页
    7.2 时间序列算法第57-59页
        7.2.1 指数平滑法第58页
        7.2.2 ARMA模型第58-59页
    7.3 神经网络算法第59-60页
    7.4 基于时间序列算法的脂肪酶拓扑属性的分析第60-75页
        7.4.1 基于指数平滑的脂肪酶拓扑属性分析第60-63页
        7.4.2 基于ARMA模型的脂肪酶拓扑属性分析第63-75页
    7.5 基于神经网络的脂肪酶拓扑属性分析第75-78页
    7.6 指数平滑法、ARMA模型与神经网络的预测准确率比较第78页
    7.7 本章小结第78-80页
第八章 主要结论及展望第80-82页
    8.1 主要结论第80-81页
    8.2 展望第81-82页
致谢第82-83页
参考文献第83-88页
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第88页

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