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甲醇/山梨醇共混流加下Mut~+型毕赤酵母高效表达HSA-GCSF~m及转录组学机理分析

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第8-17页
    1.1 人血清白蛋白-粒细胞集落刺激因子融合蛋白概述第8-9页
        1.1.1 粒细胞集落刺激因子简介第8页
        1.1.2 研究进展第8页
        1.1.3 融合蛋白简介第8-9页
    1.2 毕赤酵母表达系统概述第9-10页
    1.3 毕赤酵母诱导期优化控制策略第10-12页
        1.3.1 供氧条件的优化与控制第10-11页
        1.3.2 甲醇浓度的优化与控制第11-12页
        1.3.3 混合碳源流加诱导策略第12页
    1.4 转录组学概述第12-15页
        1.4.1 基因芯片技术第13-14页
        1.4.2 基因表达系列分析技术第14页
        1.4.3 RNA测序技术第14-15页
    1.5 论文立题意义及主要内容第15-17页
        1.5.1 本论文立题意义第15-16页
        1.5.2 本论文主要内容第16-17页
第二章 材料与方法第17-22页
    2.1 实验仪器与设备第17页
    2.2 实验菌株第17-18页
    2.3 培养基第18页
    2.4 发酵培养方法第18-19页
        2.4.1 种子培养方法第18页
        2.4.2 分批补料法培养毕赤酵母表达HSA-GCSF~m第18-19页
    2.5 分析方法第19-20页
        2.5.1 细胞浓度及干重测定第19页
        2.5.2 甲醇浓度测定第19页
        2.5.3 乙醇浓度测定第19页
        2.5.4 山梨醇浓度测定第19页
        2.5.5 O_2利用速率,CO_2释放速率的计算第19页
        2.5.6 HSA-GCSF~m含量的测定第19页
        2.5.7 总蛋白浓度测定第19页
        2.5.8 酶活力测定第19-20页
    2.6 基于RNAseq技术的转录组学分析第20-22页
        2.6.1 建库测序第20-21页
        2.6.2 基因表达水平分析第21页
        2.6.3 差异基因筛选第21-22页
第三章 结果与讨论第22-38页
    3.1 不同甲醇/山梨醇共混流加条件下的发酵性能比较第22-27页
        3.1.1 不同甲醇/山梨醇共混流加策略的控制性能第22-23页
        3.1.2 不同甲醇/山梨醇共混流加策略下的蛋白表达性能第23-24页
        3.1.3 不同甲醇/山梨醇共混流加策略下的呼吸特征差异第24-25页
        3.1.4 不同甲醇/山梨醇共混流加策略下的碳代谢关键酶活性第25-27页
    3.2 转录组学分析质量评估第27-28页
        3.2.1 RNA测序错误率分布第27页
        3.2.2 RNA测序数据质量控制第27-28页
        3.2.3 RNA-Seq相关性检查第28页
    3.3 不同诱导策略下基因的差异表达分析第28-31页
        3.3.1 差异化表达基因的筛选第28-29页
        3.3.2 DEGs的GO功能富集分析第29-30页
        3.3.3 DEGs的KEGG Pathway代谢途径分析第30-31页
    3.4 不同诱导策略影响HSA-GCSF~m表达的转录组学机理第31-35页
        3.4.1 甲醇代谢相关基因转录水平变化第31-32页
        3.4.2 山梨醇代谢相关基因转录水平变化第32-33页
        3.4.3 蛋白酶体代谢相关基因转录水平变化第33-34页
        3.4.4 过氧化物代谢相关基因转录水平变化第34页
        3.4.5 氨基酸代谢相关基因转录水平变化第34-35页
    3.5 Mut~+型毕赤酵母的碳源(甲醇和山梨醇)消耗特性第35-38页
        3.5.1 山梨醇浓度恒定条件下Mut~+型毕赤酵母的碳源消耗特性第35-38页
主要结论与展望第38-40页
    主要结论第38-39页
    展望第39-40页
致谢第40-41页
参考文献第41-46页
附录 作者在攻读硕士学位期间发表的论文第46页
    一、作者申请学位的论文或科研成果第46页
    二、作者其他论文或科研成果第46页

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