| 缩略词表 | 第6-10页 |
| 摘要 | 第10-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 第一章 前言 | 第16-34页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第16-20页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第16-18页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第18-20页 |
| 1.2 肝癌肿瘤标志物的研究现状 | 第20-23页 |
| 1.3 肝癌蛋白质组学和激酶组学研究现状 | 第23-31页 |
| 1.3.1 蛋白质组学概述 | 第23-25页 |
| 1.3.2 蛋白质组学研究方法 | 第25-27页 |
| 1.3.3 蛋白激酶是肝癌发生发展进程中的关键调节因子 | 第27-30页 |
| 1.3.4 激酶组学研究方法 | 第30-31页 |
| 1.4 本文研究内容 | 第31-34页 |
| 1.4.1 立题依据和研究目的 | 第31页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第31-32页 |
| 1.4.3 研究内容 | 第32-34页 |
| 第二章 肝癌组织差异蛋白质组学研究 | 第34-62页 |
| 2.1 实验材料 | 第34-37页 |
| 2.1.1 组织收集 | 第34-35页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第35-36页 |
| 2.1.3 实验设备 | 第36-37页 |
| 2.2 实验方法 | 第37-40页 |
| 2.2.1 肝癌及癌旁组织中蛋白质的提取 | 第37页 |
| 2.2.2 应用Bradford法对肝癌及癌旁组织蛋白质进行定量 | 第37-38页 |
| 2.2.3 总蛋白的FASP酶切方法 | 第38页 |
| 2.2.4 nanoLC-MS/MS分析 | 第38-39页 |
| 2.2.5 参考质谱数据库建立 | 第39页 |
| 2.2.6 SWATH-MS数据处理方法 | 第39页 |
| 2.2.7 生物信息学分析 | 第39-40页 |
| 2.2.8 Western Blot验证 | 第40页 |
| 2.3 结果 | 第40-52页 |
| 2.3.1 基于SWATH-MS的肝癌非标记定量蛋白质组学分析 | 第40-42页 |
| 2.3.2 肝癌和癌旁组织差异蛋白质筛选 | 第42-45页 |
| 2.3.3 基于SWATH-MS的肝癌和癌旁差异蛋白质组数据评价 | 第45-46页 |
| 2.3.4 肝癌和癌旁差异蛋白质组生物信息学分析 | 第46-50页 |
| 2.3.5 关键差异蛋白质Western Blot验证 | 第50-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-60页 |
| 2.4.1 磷酸戊糖途径 | 第54页 |
| 2.4.2 己糖胺生物合成途径 | 第54-55页 |
| 2.4.3 丝氨酸、甘氨酸和肌氨酸生物合成/代谢途径 | 第55-57页 |
| 2.4.4 脂肪酸合成通路 | 第57-58页 |
| 2.4.5 脂肪酸氧化代谢 | 第58-59页 |
| 2.4.6 糖酵解和糖异生通路 | 第59-60页 |
| 2.5 小结 | 第60-62页 |
| 第三章 基于化学蛋白质组学技术的肝癌差异激酶组研究 | 第62-96页 |
| 3.1 材料和方法 | 第62-66页 |
| 3.1.1 组织收集 | 第62-64页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第64-66页 |
| 3.1.3 实验设备 | 第66页 |
| 3.2 实验方法 | 第66-68页 |
| 3.2.1 肝癌及癌旁组织中蛋白质的提取 | 第66-67页 |
| 3.2.2 应用Bradford法对肝癌及癌旁组织蛋白质进行定量 | 第67页 |
| 3.2.3 肝癌及癌旁组织激酶组富集方法 | 第67-68页 |
| 3.2.4 激酶洗脱液的FASP酶切方法 | 第68页 |
| 3.2.5 nanoLC-MS/MS分析条件的优化 | 第68页 |
| 3.2.6 参考质谱数据库建立 | 第68页 |
| 3.2.7 SWATH-MS数据处理方法 | 第68页 |
| 3.2.8 生物信息学分析 | 第68页 |
| 3.3 结果 | 第68-81页 |
| 3.3.1 基于化学蛋白质组的肝癌差异激酶组研究 | 第68-70页 |
| 3.3.2 肝癌非标记定量差异激酶筛选 | 第70-74页 |
| 3.3.3 肝癌和癌旁差异蛋白激酶分类 | 第74-76页 |
| 3.3.4 肝癌和癌旁差异激酶组生物信息学分析 | 第76-78页 |
| 3.3.5 关键差异激酶Western Blot验证 | 第78-81页 |
| 3.4 讨论 | 第81-87页 |
| 3.4.1 MAPK信号通路 | 第82-83页 |
| 3.4.2 PI3K/Akt/mTOR信号通路 | 第83-84页 |
| 3.4.3 VEGF信号通路 | 第84页 |
| 3.4.4 Wnt信号通路 | 第84-86页 |
| 3.4.5 Hedgehog信号通路 | 第86-87页 |
| 3.5 差异激酶组研究对肝癌治疗的意义 | 第87-94页 |
| 3.5.1 为探索有可能成为潜在的肝癌治疗药物提供线索 | 第87-90页 |
| 3.5.2 为肝癌抑制剂的开发提供研究基础 | 第90-94页 |
| 3.5.3 为肝癌潜在靶点和标志物的发现提供线索 | 第94页 |
| 3.6 小结 | 第94-96页 |
| 第四章 结论与不足 | 第96-98页 |
| 4.1 结论 | 第96-97页 |
| 4.2 不足 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-112页 |
| 附录 | 第112-190页 |
| 个人简历 | 第190-192页 |
| 致谢 | 第192-193页 |
