| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-37页 |
| 1.1 大豆优异种质资源发掘、创新与利用研究概况 | 第13-20页 |
| 1.1.1 大豆种质资源保存与研究意义 | 第13-14页 |
| 1.1.2 国外大豆优异种质资源发掘、创新与利用概况 | 第14-15页 |
| 1.1.3 国内大豆优异种质资源发掘、创新与利用概况 | 第15-18页 |
| 1.1.4 我国江淮地区优异种质资源发掘、创新与利用概况 | 第18-20页 |
| 1.2 作物数量性状QTL定位主要方法与策略 | 第20-29页 |
| 1.2.1 作物连锁定位方法 | 第20-22页 |
| 1.2.2 作物关联分析方法 | 第22-29页 |
| 1.2.2.1 关联分析研究的群体 | 第22-23页 |
| 1.2.2.2 关联分析方法的分类 | 第23页 |
| 1.2.2.3 连锁不平衡 | 第23-25页 |
| 1.2.2.4 关联分析中处理群体结构的方法 | 第25-26页 |
| 1.2.2.5 关联分析的其他模型 | 第26-27页 |
| 1.2.2.6 多重测验问题的矫正 | 第27页 |
| 1.2.2.7 关联分析使用的软件 | 第27-28页 |
| 1.2.2.8 关联分析在近交作物应用存在的问题 | 第28-29页 |
| 1.3 SNP标记开发及其在大豆遗传育种研究中的应用 | 第29-32页 |
| 1.3.1 SNP标记的简介 | 第29页 |
| 1.3.2 SNP标记的开发 | 第29-31页 |
| 1.3.3 以分子标记为基础的大豆分子育种研究进展 | 第31页 |
| 1.3.4 SNP标记在大豆中的应用 | 第31-32页 |
| 1.4 大豆重要农艺、品质性状QTL关联分析研究进展 | 第32-35页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第35-37页 |
| 第二章 材料和方法 | 第37-45页 |
| 2.1 试验材料 | 第37-41页 |
| 2.2 田间试验设计及表型调查 | 第41页 |
| 2.3 SNP分子标记开发与基因型分析 | 第41页 |
| 2.4 统计分析方法 | 第41-45页 |
| 2.4.1 群体SNP标记遗传多样性分析 | 第41-42页 |
| 2.4.2 群体结构分析 | 第42-43页 |
| 2.4.2.1 ADMIXTURE群体结构分析 | 第42页 |
| 2.4.2.2 群体主成分分析 | 第42页 |
| 2.4.2.3 材料间基于标记的亲缘系数(Kinship)计算 | 第42页 |
| 2.4.2.4 遗传关系对表型贡献的估计 | 第42-43页 |
| 2.4.3 群体连锁不平衡分析 | 第43页 |
| 2.4.4 农艺、品质性状表型数据统计分析 | 第43页 |
| 2.4.5 全基因组关联分析 | 第43-44页 |
| 2.4.6 育种性状QTL优异等位变异筛选与种质鉴定 | 第44-45页 |
| 第三章 YHSBLP群体SNP标记遗传多样性和群体结构分析 | 第45-53页 |
| 3.1 群体SNP标记的遗传多样性分析 | 第45-46页 |
| 3.2 573份材料基于SNP标记的聚类分析 | 第46-47页 |
| 3.3 群体结构分析 | 第47-48页 |
| 3.4 群体主成分分析 | 第48-49页 |
| 3.5 基于SNP标记对材料间的亲缘关系估计 | 第49-50页 |
| 3.6 遗传关系对表型贡献分析 | 第50页 |
| 3.7 群体连锁不平衡分析 | 第50-51页 |
| 3.8 讨论 | 第51-53页 |
| 第四章 YHSBLP群体农艺、品质性状QTL的全基因组关联分析 | 第53-79页 |
| 4.1 农艺、品质性状的遗传变异 | 第53-55页 |
| 4.2 农艺、品质性状QTL关联定位结果汇总 | 第55页 |
| 4.3 质量性状基因的关联分析 | 第55-58页 |
| 4.3.1 花色 | 第55-56页 |
| 4.3.2 茸毛颜色 | 第56-57页 |
| 4.3.3 叶形 | 第57-58页 |
| 4.3.4 与前人基因克隆结果的比较 | 第58页 |
| 4.4 农艺性状的全基因组关联分析定位结果 | 第58-70页 |
| 4.4.1 株型性状 | 第58-66页 |
| 4.4.1.1 倒伏性 | 第58-60页 |
| 4.4.1.2 株高 | 第60-64页 |
| 4.4.1.3 主茎节数 | 第64-66页 |
| 4.4.2 生育期性状 | 第66-70页 |
| 4.4.2.1 始花期 | 第66-69页 |
| 4.4.2.2 全生育期 | 第69-70页 |
| 4.5 籽粒性状的全基因组关联分析定位结果 | 第70-76页 |
| 4.5.1 百粒重 | 第70-72页 |
| 4.5.2 蛋白质含量 | 第72-74页 |
| 4.5.3 油脂含量 | 第74-76页 |
| 4.6 讨论 | 第76-79页 |
| 第五章 育种性状QTL优异等位变异筛选与种质鉴定 | 第79-87页 |
| 5.1 农艺性状优异等位变异的筛选及优异种质鉴定 | 第79-81页 |
| 5.1.1 株高 | 第79-80页 |
| 5.1.2 主茎节数 | 第80页 |
| 5.1.3 始花期 | 第80页 |
| 5.1.4 全生育期 | 第80-81页 |
| 5.1.5 百粒重 | 第81页 |
| 5.2 品质性状优异等位变异的筛选及优异种质鉴定 | 第81-86页 |
| 5.2.1 油脂含量 | 第81-86页 |
| 5.3 讨论 | 第86-87页 |
| 全文结论与创新之处 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-101页 |
| 致谢 | 第101页 |
