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香蕉SOD基因家族的全基因组鉴定及功能分析

缩写词第1-10页
摘要第10-14页
Abstract第14-19页
第一章 引言第19-31页
 1 植物超氧化物歧化酶研究进展第20-21页
 2 植物SOD基因的分子克隆研究进展第21-22页
 3 植物SOD基因的表达调控研究进展第22-24页
 4 逆境胁迫与植物SOD基因的表达研究进展第24-25页
 5 SOD基因过表达对植物抗逆性的影响第25-26页
 6 植物启动子研究进展第26-28页
 7 香蕉抗逆分子生物学研究进展第28-29页
 8 本项目研究的意义及主要内容第29-31页
   ·本项目研究的意义第29-30页
   ·本项目主要研究内容第30-31页
第二章 香蕉SOD家族基因的全基因组分析与克隆第31-71页
 第一节 基于基因组数据库的野生蕉SOD基因的分析第31-38页
  1 数据检索与收集第31-32页
  2 数据分析方法第32页
  3 结果与分析第32-37页
   ·小果野蕉‘DH-Pahang’SOD候选基因的获得与分析第32-33页
   ·野蕉‘PKW’SOD候选基因的获得与分析第33-35页
   ·两个野生蕉SOD家族基因的比较与聚类分析第35-37页
  4 讨论第37-38页
   ·野蕉PKW中两条含Cu/ZnSOD序列的嵌合基因是否仍具有SOD功能第37页
   ·香蕉可能含有11~13个具有SOD功能的基因第37-38页
 第二节 福建天宝蕉超氧化物歧化酶SOD基因家族的克隆第38-63页
  1 材料第38-39页
  2 方法第39-42页
   ·福建天宝蕉DNA和总RNA的提取及cDNA的合成第39页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族的引物设计与克隆第39-41页
   ·目的片段的回收与测序第41-42页
   ·序列分析第42页
  3 结果与分析第42-61页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族cDNA全长序列的获得第42-52页
     ·Cu/ZnSOD(MaCSD)基因亚家族不同成员cDNA全长序列的获得第42-46页
     ·MnSOD(MaMSD)基因亚家族不同成员cDNA全长序列的获得第46-49页
     ·FeSOD(MaFSD)基因亚家族不同成员cDNA全长序列的获得第49-52页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族DNA序列的获得第52-54页
     ·Cu/ZnSOD(MaCSD)基因亚家族不同成员DNA序列的获得第52-53页
     ·MnSOD(MaMSD)基因亚家族不同成员DNA序列的获得第53页
     ·FeSOD(MaFSD)基因亚家族不同成员DNA序列的获得第53-54页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族不同转录本的成因分析第54-55页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族核酸序列的特征分析第55-59页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族的基因结构分析第59页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族在染色体上的分布第59-61页
  4 讨论第61-63页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族具有12个不同成员第61-62页
   ·福建天宝蕉SOD基因家族转录本的多样性第62-63页
 第三节 香蕉不同基因组类型SOD基因的比较分析第63-71页
  1 材料第63页
  2 方法第63-64页
   ·福州野生蕉SOD基因家族的克隆第63-64页
   ·SOD基因家族序列的比较分析第64页
   ·共线性分析与复制时间的计算第64页
  3 结果与分析第64-69页
   ·福州野生蕉SOD基因家族cDNA序列的获得第64-65页
   ·香蕉不同基因组类型SOD基因的比较分析第65-67页
   ·香蕉SOD基因的扩张模式分析第67-69页
  4 讨论第69-71页
   ·香蕉不同基因组类型的SOD基因存在差异第69-70页
   ·香蕉的SOD家族基因随着香蕉进化发生数量扩张第70-71页
第三章 香蕉SOD基因家族的生物信息学分析第71-86页
 1 材料第71页
 2 方法第71-72页
   ·生物信息学分析方法第71-72页
   ·亚细胞定位表达载体的构建与瞬时表达第72页
 3 结果与分析第72-84页
   ·香蕉SOD蛋白的基本理化性质比较分析第72-73页
   ·香蕉SOD蛋白的信号肽、跨膜结构及亚细胞定位的预测分析第73-76页
   ·香蕉SOD家族部分成员的亚细胞定位验证第76-77页
   ·香蕉SOD蛋白的磷酸化位点预测与分析第77-78页
   ·香蕉SOD蛋白的同源性和结构域分析第78-81页
     ·香蕉Cu/ZnSOD蛋白的同源性与结构域分析第78-79页
     ·香蕉MnSOD蛋白的同源性与结构域分析第79-80页
     ·香蕉FeSOD蛋白的同源性与结构域分析第80-81页
   ·香蕉SOD家族的系统进化分析第81-84页
 4 讨论第84-86页
   ·香蕉SOD家族蛋白亚细胞定位的差异第84-85页
   ·香蕉SOD家族蛋白可能由不同磷酸化修饰调控第85-86页
第四章 香蕉SOD基因家族启动子的克隆与分析第86-106页
 1 材料第86页
 2 方法第86-87页
   ·引物设计与启动子克隆第86页
   ·启动子序列分析方法第86-87页
 3 结果与分析第87-104页
   ·MaSOD基因家族启动子序列的获得第87-88页
   ·MaSOD基因家族核心启动子区及转录起始位点的预测分析第88-97页
   ·MaSOD基因家族启动子顺式元件的功能预测分析第97-104页
     ·MaSOD基因家族不同成员启动子中核心元件分析第98页
     ·MaSOD基因家族不同成员启动子中光反应元件的比较第98-99页
     ·MaSOD基因家族不同成员启动子中胁迫应答元件的比较第99页
     ·MaSOD基因家族不同成员启动子中激素应答元件的比较第99-100页
     ·MaSOD基因家族不同成员启动子中其他顺式元件的分析第100-104页
 4 讨论第104-106页
   ·香蕉SOD基因家族不同成员的启动子序列具有较大差异第104页
   ·香蕉SOD基因家族启动子活性可能受光、逆境胁迫和不同激素的诱导第104-106页
第五章 香蕉SOD基因家族在非生物胁迫和激素处理下的表达分析第106-117页
 1 材料与胁迫处理第106页
 2 方法第106-108页
   ·RNA的提取及cDNA合成第107页
   ·MaSOD不同成员qRT-PCR特异引物的设计第107-108页
 3 结果与分析第108-115页
   ·MaSOD基因不同成员qRT-PCR引物的特异性和扩增效率分析第108页
   ·MaSOD基因家族各成员在不同组织部位的表达分析第108-109页
   ·MaSOD基因不同成员在非生物胁迫下的表达分析第109-112页
     ·MaSOD基因家族不同成员在低温胁迫下的表达模式第109-110页
     ·MaSOD基因家族不同成员在高温胁迫下的表达模式第110页
     ·MaSOD基因家族不同成员在干旱胁迫下的表达模式第110-111页
     ·MaSOD基因家族不同成员在盐胁迫下的表达模式第111-112页
   ·MaSOD基因家族不同成员在激素处理下的表达分析第112-115页
     ·MaSOD基因家族不同成员在ABA处理下的表达模式第112-113页
     ·MaSOD基因家族不同成员在GA_3处理下的表达模式第113-114页
     ·MaSOD基因家族不同成员在IAA处理下的表达模式第114页
     ·MaSOD基因家族不同成员在SA处理下的表达模式第114-115页
 4 讨论第115-117页
   ·香蕉MaSOD家族不同成员对不同非生物胁迫的特异性响应第115-116页
   ·香蕉MaSOD基因在激素处理下的差异表达第116-117页
第六章 香蕉铜锌超氧化物歧化酶MaCSD1D基因的功能分析第117-131页
 1 材料与试剂第117页
   ·材料第117页
   ·试剂第117页
   ·培养基第117页
 2 方法第117-121页
   ·中间表达载体pCAMBIA1301SN的构建第117-119页
   ·香蕉MaCSD1D基因过表达载体的构建第119页
   ·重组质粒P1301-MaCSD1D转化农杆菌第119页
   ·烟草无菌苗的培养及遗传转化第119-120页
   ·转MaCSD1D基因烟草T0代植株的分子检测第120页
   ·转MaCSD1D基因烟草的抗寒性分析第120-121页
 3 结果与分析第121-129页
   ·香蕉MaCSD1D基因过表达植物载体的获得第121-123页
   ·转MaCSD1D基因烟草T0代植株的获得及分子检测第123页
   ·转MaCSD1D基因烟草种子在低温下的萌发第123-126页
   ·转MaCSD1D基因烟草在低温胁迫下的表达分析第126-129页
   ·转MaCSD1D基因烟草在低温胁迫下的酶活性分析第129页
 4 讨论第129-131页
第七章 香蕉Cu/ZnSOD分子伴侣蛋白基因MaCCS的克隆与表达分析第131-148页
 1 材料与胁迫处理第131-132页
 2 方法第132-135页
   ·香蕉核酸的提取与cDNA合成第132页
   ·香蕉MaCCS基因PCR引物设计与克隆第132-133页
   ·香蕉MaCCS基因的序列分析第133-134页
   ·香蕉MaCCS基因的亚细胞定位第134页
   ·香蕉MaCCS基因的实时荧光定量PCR第134-135页
 3 结果与分析第135-146页
   ·香蕉MaCCS基因开放阅读框的获得与分析第135-139页
   ·香蕉MaCCS基因的基因结构与系统进化分析第139页
   ·香蕉MaCCS基因的亚细胞定位分析第139-141页
   ·香蕉MaCCS基因的转录起始位点与3’非编码区分析第141-142页
   ·香蕉MaCCS基因启动子序列的克隆与顺式元件分析第142-143页
   ·香蕉MaCCS基因的表达分析第143-145页
   ·香蕉MaCCS基因与MaCSD家族基因间的相互关系第145-146页
 4 讨论第146-148页
   ·香蕉中存在单个CCS基因和多种转录本第146页
   ·香蕉MaCCS基因在不同组织部位的差异表达第146-147页
   ·香蕉MaCCS基因参与非生物胁迫和激素应答第147-148页
第八章 结论与展望第148-152页
参考文献第152-166页
附录1 香蕉SOD家族基因和CCS基因的cDNA序列信息第166-176页
附录2 香蕉SOD家族基因和CCS基因的DNA序列信息第176-193页
在学博士期间发表论文情况与参加学术会议情况第193-194页
致谢第194页

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