| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| ·研究背景和意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状及发展趋势 | 第10-11页 |
| ·本文主要研究内容 | 第11-13页 |
| 第2章 RNA二级结构图形表示法及进化树构建方法 | 第13-23页 |
| ·RNA二级结构的定义 | 第13-14页 |
| ·RNA二级结构 | 第13页 |
| ·RNA二级结构的子结构 | 第13-14页 |
| ·RNA二级结构表示方法 | 第14-18页 |
| ·RNA二级结构的图形表示 | 第14-15页 |
| ·RNA二级结构模型的抽象化 | 第15-18页 |
| ·图形的特征不变量分析 | 第18-20页 |
| ·图形的特征矩阵 | 第18-19页 |
| ·常用的不变量 | 第19-20页 |
| ·系统发育树的构建 | 第20-21页 |
| ·系统发育树构建方法 | 第20-21页 |
| ·本章小结 | 第21-23页 |
| 第3章 一种新的RNA二级结构3D图形表示方法及相似性分析 | 第23-31页 |
| ·RNA二级结构3D图形表示方法 | 第23-26页 |
| ·函数定义 | 第23-25页 |
| ·3D图形表示的性质 | 第25-26页 |
| ·特征向量提取 | 第26-28页 |
| ·9种病毒RNA二级结构相似性分析 | 第28-30页 |
| ·数据 | 第28页 |
| ·9种病毒的RNA二级结构特征序列及距离矩阵 | 第28-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第4章 3D图形表示方法应用及算法之间的比较 | 第31-45页 |
| ·RNA二级结构3D图形表示方法及相似性分析的应用 | 第31-34页 |
| ·33个比较复杂的RNA二级结构相似性分析 | 第31-34页 |
| ·60个ncRNA二级结构相似性分析 | 第34页 |
| ·与其他九种算法的比较 | 第34-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 结论 | 第45-47页 |
| 附录 | 第47-58页 |
| 附录A | 第47-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的论文 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |