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菠菜Y染色体特异EST序列的快速克隆及生物信息学分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略语表第8-9页
目录第9-12页
1 前言第12-26页
   ·植物性别分化研究概况第12-17页
     ·性别决定基因的相关研究第12-13页
     ·性染色体演化研究进展第13-15页
     ·环境因素对性别分化的调控第15-16页
     ·菠菜性别分化研究概况第16-17页
   ·杂交特异性扩增技术研究概况第17-23页
     ·染色体显微分离、微切割与微克隆第18-20页
     ·SSH 技术研究概况第20-21页
     ·HSA 体系建立及应用第21-23页
   ·ESTs 的研究概况第23-24页
   ·本研究的目的及意义第24-26页
2 实验方法第26-40页
   ·实验材料、试剂及仪器设备第26-27页
     ·实验材料第26页
     ·主要试剂第26-27页
   ·合成引物和接头第27-28页
   ·菠菜 Y 染色体的显微分离、DOP-PCR 扩增和检测第28-31页
     ·染色体标本制备第28-29页
     ·菠菜 Y 染色体的显微分离第29页
     ·微分离染色体的体外扩增第29页
     ·微分离染色体 DOP-PCR 产物来源鉴定第29-31页
   ·开花期雌雄菠菜基因组 DNA、RNA 的提取及 cDNA 的合成第31-34页
     ·菠菜开花期雄性及雌性基因组 DNA 的获得第31页
     ·菠菜雄花 RNA 的提取及检测第31-32页
     ·菠菜雄花双链 cDNA 的合成第32-34页
   ·利用杂交特异性扩增法获得菠菜性染色体上的 cDNA 片段第34-40页
     ·杂交样品制备第34-36页
     ·杂交第36页
     ·绿豆核酸酶处理杂交产物第36页
     ·杂交样品的 PCR 扩增第36-37页
     ·杂交样品 PCR 产物的克隆第37-38页
     ·斑点杂交鉴定扩增产物来源并筛选菠菜 Y 染色体上特异表达 cDNA 序列 ...第38页
     ·雄性菠菜性染色体特异 cDNA 序列的生物信息学分析第38-40页
3 实验结果第40-56页
   ·染色体显微分离第40页
   ·微分离染色体 DOP-PCR 扩增产物第40-41页
   ·微分离染色体来源鉴定第41-43页
     ·利用斑点杂交鉴定菠菜单染色体 DOP-PCR 产物来源第41-42页
     ·用菠菜雄性特异 DNA 序列 T11A 鉴定微分离染色体来源第42-43页
   ·RNA 提取、纯化及检测第43页
   ·HSA 杂交特异性扩增第43-48页
     ·酶切效率检测第43-44页
     ·接头连接效率检测第44-45页
     ·杂交特异性扩增的效率分析第45-46页
     ·菠菜 Y 染色体上特异表达 EST 序列的克隆及筛选第46-47页
     ·斑点杂交鉴定扩增产物来源并筛选菠菜 Y 染色体上特异表达 EST 序列第47-48页
   ·菠菜 Y 染色体特异表达序列的生物信息学分析第48-56页
     ·EST 序列长度分布第48-49页
     ·菠菜 Y 染色体上 EST 序列的同源比对第49-51页
     ·GO 注释分析第51-55页
     ·KEGG 代谢途径分析第55-56页
4 讨论第56-62页
   ·菠菜 Y 染色体特异 EST 序列快速克隆技术体系的建立第56-58页
   ·菠菜 EST 序列的分析第58-60页
   ·后续研究工作第60-62页
参考文献第62-72页
附录第72-82页
致谢第82-83页
攻读学位期间发表的学术论文目录第83-84页

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