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基于高通量测序的石刁柏基因组转座子分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
缩略语表第10-11页
1 前言第11-19页
   ·转座子的研究概况第11-15页
     ·转座子的分类第11-12页
     ·转座子在植物基因组中的分布特征第12-13页
     ·转座子在植物基因组进化中的作用第13-15页
   ·高通量测序技术及其应用第15-17页
     ·高通量测序技术第15-16页
     ·高通量测序技术的应用第16-17页
   ·石刁柏研究概况第17-18页
   ·研究目的和意义第18-19页
2 材料与方法第19-27页
   ·材料第19-21页
     ·植物材料第19页
     ·菌株和载体第19页
     ·主要仪器设备第19页
     ·主要试剂及药品第19-20页
     ·常用试剂配方第20页
     ·引物第20-21页
   ·方法第21-27页
     ·基因组 DNA 提取第21-22页
     ·雌、雄基因组文库的构建及高通量测序第22页
     ·石刁柏基因组序列的组装及验证第22-23页
     ·石刁柏基因组中转座子的鉴定第23页
     ·石刁柏雌、雄基因组中转座子的比较第23页
     ·石刁柏基因组中 Ty1-copia 的反转座子的扩增及分析第23-24页
     ·石刁柏 Ty1-copia 反转座子的克隆及测序第24-25页
     ·石刁柏 Ty1-copia 反转座子的验证第25-27页
3 结果与分析第27-45页
   ·石刁柏基因组转座子组分的生物信息学分析第27-36页
     ·基因组序列测定和组装第27-30页
     ·转座子的鉴定和分类第30-33页
     ·石刁柏雌、雄基因组间转座子的比较第33-36页
   ·Ty1-copia 反转录转座子的克隆结果与分析第36-45页
     ·基因组 DNA 的提取结果第36页
     ·Ty1-copia 反转录转座子的克隆第36-38页
     ·Ty1-copia 反转录转座子的验证第38-39页
     ·Ty1-copia 反转录转座子异质性分析第39-45页
4 讨论第45-49页
   ·石刁柏基因组中转座子成分的分析第45-46页
   ·石刁柏中 Ty1-copia 反转录转座子序列的分析第46-49页
参考文献第49-57页
致谢第57-59页
攻读学位期间发表的学术论文目录第59-60页

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