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稻瘟病菌致病相关基因的克隆与功能分析

Acknowledgements第1-18页
List of Tables第18-19页
List of Figures第19-22页
Abstract第22-26页
摘要第26-28页
Chapter 1 General Introduction第28-32页
Chapter 2 Literature Review第32-44页
     ·Biology of M. oryzae第32-37页
       ·Blast disease cycle第32-34页
       ·Appressorium formation第34-36页
       ·Blast symptoms第36-37页
     ·Plant penetration and colonization第37-43页
       ·Signaling pathways第37-42页
         ·G protein signaling第37-38页
         ·Autophagy第38-39页
         ·Mitogen-activated protein (MAP) kinase signaling第39-40页
         ·Cyclic adenosyl monophosphate (CAMP) signaling第40-41页
         ·Ca~(2+) -mediated signaling第41-42页
       ·Mucilage第42页
       ·Hydrophobin第42页
       ·Melanin第42-43页
     ·Concluding remarks第43-44页
Chapter 3 Materials and Methods第44-84页
     ·Growth conditions of fungal strains第44-45页
     ·Media composition第45-51页
     ·Preparation of competent E. coli cells (DH5α)第51页
     ·Molecular cloning and disruption of targeted genes第51-62页
       ·Bioinformatics analysis第51页
       ·Primer designing (for targeted genes of interest)第51-52页
       ·PCR amplification (up/dn flanking sequences of targeted gene)第52-53页
       ·Nucleic acids第53-54页
       ·Ligation (up/dn fragment in pUCm-T vector)第54页
       ·Transformation (E. coli DH5α competent cells with pUCm-T vector)第54-55页
       ·Plasmid pUCm-T isolation and confirmation第55-57页
       ·Purification (up/dn fragment)第57页
       ·Ligation (up/dn purified fragment into pBS vector)第57-59页
       ·Transformation (pBS into E. coli DH5α competent cel第59-60页
       ·Plasmid pBS isolation and confirmation第60页
       ·Purification and ligation第60页
       ·Transformation (pCAMBIA-1300 into AGL-1 cells)第60-61页
       ·Confirmation of pCAMBIA-1300 (PCR and restriction digestion)第61页
       ·ATMT transformation (using Guy-11 strain conidia)第61-62页
     ·Confirmation of the gene knock-out transformants (Check PCR)第62-64页
       ·Genomic DNA isolation (Quick and safe DNA extraction method)第63页
       ·Check PCR confirmation (Guy-11 and mutants gDNA)第63-64页
     ·Mono-conidial isolation and storage of deleted transformants第64页
     ·Southern blot analysis第64-73页
       ·High quality genomic DNA isolation (2% CTAB method)第65-66页
       ·Southern blotting (DIG High Prime DNA Labeling)第66-73页
     ·Reverse Transcription PCR (Guy-11, mutants and rescued strains RNA)第73-75页
       ·RNA isolation (Guy-11, mutants and rescued strains mycelium)第73-74页
       ·RT (Reverse transcription) PCR第74-75页
     ·Real Time PCR (Guy-11, mutants and rescued strains cDNA)第75-76页
     ·Phenotypic studies (Guy-11, mutants and rescued strains)第76-81页
       ·Assays for mycelium radial growth and conidiation第76-77页
       ·Assays for mycelium radial growth on MM, MM-N and MM-C medium第77-78页
       ·Analysis for conidial germination and appressorium formation第78页
       ·Cell wall integrity test (Congo red)第78-79页
       ·Stress response under chemical pressure (ZnSO_4, CuSO_4 and CdCl_2)第79页
       ·Wettable phenotype (H_2O and 0.2% gelatin)第79页
       ·Osmotic and oxidative stress response (NaCl and H_2O_2)第79页
       ·Plant cultivars and growth conditions第79-80页
       ·Infection assays (Rice and barley)第80-81页
       ·Mating with 2539 strain第81页
     ·Complementation of the mutant with the wild-type allele第81-82页
     ·Generation of GFP fusion constructs第82-84页
Chapter 4 An Mitochondrial Fission Protein(MoFIS1) Is Essential for the Blast FungusMagnaporthe oryzae to cause Full Pathogenicity第84-104页
     ·Abstract第84-85页
     ·Introduction第85-87页
     ·Results第87-100页
       ·Identification and isolation of MoFIS1第87-88页
       ·Disruption of MoFIS1第88-89页
       ·MoFIS1 affects mycelium radial growth and conidiation第89-91页
       ·MoFIS1 mutants showed reduced growth on MM, MM-N and MM-C medium第91-92页
       ·MoFIS1 role in conidial germination and appressorium formatio第92-93页
       ·MoFIS1 does not affect cell wall integrity第93-94页
       ·MoFIS1 role in surface hydrophobicity第94-95页
       ·MoFIS1 is involved in stress response under chemicals pressure第95页
       ·MoFIS1 role in hypersensitivity to osmotic and oxidative stress第95-97页
       ·MoFIS1 is critical for full virulence of M. oryzae第97-98页
       ·MoFIS1 is not required for sexual reproduction第98-99页
       ·Complementation of the mutant MoFISl with the wild-type MoFIS1 allele第99页
       ·Subcellular localization of MoFIS1-GFP fusion protein第99-100页
     ·Discussion第100-102页
     ·Conclusions第102-104页
Chapter 5 Molecular Characterization of a Carbon Catabolite De-repressing (MoYPL1) Genein Magnaporthe oryzae第104-117页
     ·Abstract第104页
     ·Introduction第104-106页
     ·Results第106-115页
       ·Isolation of Mo YPL1第106-108页
       ·Disruption of Mo YPL1第108-109页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第109-110页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第110页
       ·Mutants of MoYPL1 showed normal growth on MM, MM-C and MM-N medium第110-111页
       ·MoYPL1 plays no role in cell wall integrity第111-112页
       ·MoYPL1 is not involved in stress response under chemicals pressure第112-113页
       ·MoYPL1 plays no role in hypersensitivity to osmotic and oxidative stress第113页
       ·Pathogenicity test (barley)第113-114页
       ·MoYPL1 is not required for sexual reproduction第114-115页
     ·Discussion第115-116页
     ·Conclusions第116-117页
Chapter 6 PCR Cloning and Molecular Characterization of an Endonuclease (MoNUC1) Genein Magnaporthe oryzae第117-125页
     ·Abstract第117页
     ·Introduction第117-119页
     ·Results第119-123页
       ·Isolation of MoNUC1第119-120页
       ·Disruption of MoNUC1第120-121页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第121页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第121页
       ·Pathogenicity test (barley)第121-122页
       ·Mating of MoNUC1 mutants with 2539 strain第122-123页
     ·Discussion第123-124页
     ·Conclusions第124-125页
Chapter 7 Molecular Characterization of an Apoptosis-Inducing Factor (MoAIF1) Gene inMagnaporthe oryzae第125-133页
     ·Abstract第125页
     ·Introduction第125-126页
     ·Results第126-131页
       ·Isolation of MoAIF1第126-127页
       ·Disruption of MoAIF1第127-129页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第129页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第129页
       ·Pathogenicity test (barley)第129-131页
       ·Mating of MoAIF1 mutants with 2539 strain第131页
     ·Discussion第131-132页
     ·Conclusions第132-133页
Chapter 8 Disruption of a Zinc-Regulated Transcription (MoZAP1) Gene does not affectPathogenicity in Magnaporthe oryzae第133-142页
     ·Abstract第133页
     ·Introduction第133-135页
     ·Results第135-140页
       ·Isolation of MoZAP1第135-136页
       ·Disruption of MoZAP1第136-138页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第138页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第138页
       ·Pathogenicity test (barley)第138-140页
       ·Mating of MoZAP1 mutants with 2539 strain第140页
     ·Discussion第140-141页
     ·Conclusions第141-142页
Chapter 9 Molecular Characterization of a Nitrogen Sensor (MoSTM1) Gene in Magnaportheoryzae第142-151页
     ·Abstract第142页
     ·Introduction第142-144页
     ·Results第144-149页
       ·Isolation of MoSTM1第144-145页
       ·Disruption of MoSTM1第145-147页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第147页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第147页
       ·Pathogenicity test (barley)第147-149页
       ·MoSTM1 plays no role in sexual reproduction第149页
     ·Discussion第149-150页
     ·Conclusions第150-151页
Chapter 10 Calpains-Related Genes (MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4) are not Requiredfor Pathogenicity in Magnaporthe oryzae第151-170页
     ·Abstract第151页
     ·Introduction第151-153页
     ·Results第153-168页
       ·Isolation of MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4第153-157页
       ·Disruption of MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4第157-160页
       ·Assay for mycelium radial growth and conidiation第160-161页
       ·Assay for conidial germination and appressorium formation第161页
       ·Mutants of MoYPL1 showed normal growth on MM, MM-C and MM medium第161-162页
       ·MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4 play no role in cell wall integrity第162页
       ·MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4 are not involved in stress response under chemicals pressure第162-163页
       ·MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4 play no role in hypersensitivity to osmotic and oxidative stress第163-164页
       ·Pathogenicity test (rice and barley)第164-167页
       ·MoCAPN1, MoCAPN3 and MoCAPN4 play no role in sexual reproduction第167-168页
     ·Discussion第168-169页
     ·Conclusions第169-170页
Conclusions and Future Perspectives第170-172页
References第172-195页
List of publications第195页

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