摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
第一章 文献综述 | 第9-18页 |
1. 家猪复杂性状遗传解析研究 | 第9-13页 |
·QTL定位 | 第9页 |
·QTL精细定位及其影响因素 | 第9-10页 |
·QTL精细定位的策略 | 第10-12页 |
·提高标记密度在一定程度上可以提高QTL精细定位的效率 | 第10页 |
·提高和利用重组发生事件,是对QTL精细定位最有效的方法 | 第10-12页 |
·提高当前重组事件精细定位QTL | 第11页 |
·利用历史重组事件精细定位QTL——IBD分析 | 第11-12页 |
·全基因组关联性分析(GWAS) | 第12-13页 |
2. 糖原酵解潜能(GP)的含义及其计算方法 | 第13-14页 |
3. GP的研究意义 | 第14-15页 |
4. 影响GP的主效基因及QTL定位研究进展 | 第15-17页 |
5. 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
第二章 研究正文 | 第18-39页 |
1. 前言 | 第18页 |
2. 实验材料与方法 | 第18-26页 |
·实验动物 | 第18页 |
·组织样的采集方法 | 第18-19页 |
·表型测定 | 第19-20页 |
·资源家系的GP表型测定 | 第19页 |
·苏太家系F_1代背最长肌糖原含量测定 | 第19-20页 |
·DNA样品制备 | 第20页 |
·全基因组60K SNP芯片的判型 | 第20-21页 |
·F_0、F_1公猪QTL基因型判定 | 第21页 |
·“Q”染色体共享单倍型(IBD)精细定位 | 第21页 |
·IBD区域内新增遗传标记的基因型检测 | 第21-24页 |
·全基因组关联性分析 | 第24页 |
·连锁不平衡(LD)分析 | 第24-26页 |
3. 实验结果 | 第26-35页 |
·资源家系GP及其组分的GWAS及LD分析 | 第26-29页 |
·资源家系GP含量GWAS及LD分析结果 | 第26-27页 |
·GP各组分的GWAS分析结果 | 第27-29页 |
·资源家系GP及其组分表型测定结果 | 第29页 |
·资源家系F_1公猪QTL基因型的判定 | 第29-30页 |
·资源家系F_0公猪的单倍型分析及IBD精细定位 | 第30-32页 |
·苏太家系剩余糖原含量的GWAS及LD分析结果 | 第32-33页 |
·苏太家系剩余糖原含量测定结果 | 第33-35页 |
4. 分析与讨论 | 第35-39页 |
·SSC3上影响GP的QTL的精细定位 | 第35-37页 |
·在不同群体中QTL对表型影响效应分析 | 第37页 |
·位置候选基因的分析 | 第37-39页 |
小结 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-43页 |
致谢 | 第43页 |