| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 1 绪论 | 第10-25页 |
| ·体内蛋白质降解途径 | 第11-17页 |
| ·自吞噬-溶酶体途径 | 第11-12页 |
| ·泛素-蛋白酶体途径 | 第12-17页 |
| ·蛋白酶体催化底物降解的生物机制与活性调节 | 第17-20页 |
| ·蛋白酶体的催化机制 | 第17-18页 |
| ·蛋白酶体催化活性调节 | 第18-20页 |
| ·蛋白酶体酶切位点预测研究 | 第20-23页 |
| ·蛋白酶体酶切位点预测方法 | 第20-22页 |
| ·蛋白酶体酶切位点预测研究现状 | 第22-23页 |
| ·本文研究的主要内容和研究特色 | 第23-25页 |
| ·本文研究的主要内容 | 第23-24页 |
| ·本文的研究特色 | 第24-25页 |
| 2 原理和方法 | 第25-36页 |
| ·数据来源与结构表征 | 第25-27页 |
| ·本文使用数据库简介 | 第25-26页 |
| ·样本结构表征 | 第26-27页 |
| ·多元逐步回归法变量筛选 | 第27-28页 |
| ·支持向量机 | 第28-33页 |
| ·线性可分情况下的 SVM 分类 | 第28-31页 |
| ·线性不可分情况下的 SVM 分类 | 第31-32页 |
| ·SVM 核函数种类 | 第32-33页 |
| ·模型质量评价参数 | 第33-36页 |
| 3 基于 MHC-I 配体数据的蛋白酶体酶切位点预测研究 | 第36-45页 |
| ·数据收集与处理 | 第36-38页 |
| ·SVM 建模与评价 | 第38-40页 |
| ·蛋白酶体酶切特异性分析 | 第40-43页 |
| ·小结 | 第43-45页 |
| 4 基于 T 细胞表位数据的免疫型蛋白酶体酶切位点预测研究 | 第45-54页 |
| ·数据收集与处理 | 第45-46页 |
| ·SVM 建模与评价 | 第46-47页 |
| ·免疫型蛋白酶体酶切特异性分析 | 第47-51页 |
| ·SVMMHC-I和 SVMTCE酶切特异性比较 | 第51-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 5 基于体外酶切数据的组成型蛋白酶体酶切位点预测研究 | 第54-60页 |
| ·数据来源与处理 | 第54-55页 |
| ·SVM 建模与评价 | 第55-56页 |
| ·组成型蛋白酶体酶切特异性分析 | 第56-58页 |
| ·SVMTCE和 SVMVITRO酶切特异性比较 | 第58-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 6 结论与展望 | 第60-62页 |
| ·研究结论 | 第60-61页 |
| ·前景展望 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 附录 | 第71页 |
| A 作者在攻读学位期间发表的论文目录 | 第71页 |
