模式生物基因组中可变剪接位点的预测及序列特征分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-23页 |
| ·信使RNA剪接途径概述 | 第10-12页 |
| ·可变剪接的研究背景和调节机制 | 第12-14页 |
| ·可变剪接的模式和功能 | 第14-17页 |
| ·可变剪接的实验和理论探测方法 | 第17-21页 |
| ·可变剪接的实验探测方法 | 第17-19页 |
| ·可变剪接的理论研究方法 | 第19-21页 |
| ·论文的研究内容与安排 | 第21-23页 |
| 第二章 理论预测模型与评价 | 第23-31页 |
| ·多样性和多样性增量 | 第23-25页 |
| ·多样性 | 第23-24页 |
| ·多样性增量 | 第24-25页 |
| ·二次判别分析法 | 第25-26页 |
| ·支持向量机 | 第26-28页 |
| ·非均匀指数 | 第28页 |
| ·Weblogo | 第28-29页 |
| ·非参数检验 | 第29-30页 |
| ·预测结果的评价 | 第30-31页 |
| 第三章 人类盒式外显子和内含子保留剪接位点的预测 | 第31-42页 |
| ·数据库 | 第31-33页 |
| ·可变剪接数据集的构建 | 第31-33页 |
| ·组成性剪接数据的提取 | 第33页 |
| ·序列保守性分析 | 第33-37页 |
| ·SCE和SIR的剪接位点附近的Weblogo图 | 第33-34页 |
| ·SCE和SIR的长度统计分析 | 第34-35页 |
| ·非均匀指数HI的计算分析 | 第35-37页 |
| ·盒式外显子和内含子保留剪接位点的预测 | 第37-42页 |
| ·SCE的参数定义 | 第37页 |
| ·SIR的参数定义 | 第37-38页 |
| ·预测结果 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-40页 |
| ·ROC分析 | 第40-41页 |
| ·展望 | 第41-42页 |
| 第四章 老鼠盒式外显子和内含子保留剪接位点的预测 | 第42-48页 |
| ·数据库 | 第42-43页 |
| ·可变剪接数据集的构建 | 第42-43页 |
| ·组成性剪接数据集的构建 | 第43页 |
| ·序列特征的统计分析 | 第43-44页 |
| ·老鼠盒式外显子和内含子保留剪接位点的预测 | 第44-48页 |
| ·SCE的参数定义 | 第44-45页 |
| ·SIR的参数定义 | 第45页 |
| ·预测结果 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-47页 |
| ·展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第55页 |
