| 目录 | 第1-6页 |
| 英文缩略词 | 第6-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 第一章 导论(含文献综述) | 第12-33页 |
| 1.肺癌相关蛋白标志物研究现状 | 第12-13页 |
| 2.蛋白质组学的研究内容及主要技术流程 | 第13-14页 |
| 3.现阶段肿瘤蛋白质组学研究中的关键环节 | 第14-28页 |
| ·肿瘤蛋白质组学研究对象的选取 | 第14-19页 |
| ·拓展新的模型系统 | 第19-20页 |
| ·蛋白质组学中的定量技术 | 第20-27页 |
| ·筛选用于联合检测的蛋白标记物(谱) | 第27-28页 |
| 4.本课题的目的、基本研究内容及策略 | 第28-30页 |
| 参考文献 | 第30-33页 |
| 第二章 材料与方法 | 第33-51页 |
| 实验材料 | 第33-42页 |
| 1.人体样品收集 | 第33-38页 |
| 2.抗体 | 第38-39页 |
| 3.质谱鉴定主要材料与试剂 | 第39页 |
| 4.ELISA主要材料与试剂 | 第39-40页 |
| 5.器官培养所用主要材料与试剂 | 第40-41页 |
| 6.Western blot分析用主要材料与试剂(盒) | 第41页 |
| 7.主要仪器 | 第41-42页 |
| 实验方法 | 第42-51页 |
| 1.原代器官培养 | 第42页 |
| 2.收集条件培养基 | 第42-43页 |
| 3.液质联用分析鉴定细胞释放到条件培养基中的蛋白 | 第43-46页 |
| 4. Western blot | 第46-48页 |
| 5.免疫组织化学染色 | 第48-49页 |
| 6.酶联免疫吸附反应ELISA | 第49-50页 |
| 7.统计学分析 | 第50-51页 |
| 第三章 实验结果 | 第51-96页 |
| 1.肺癌及其对照癌旁支气管组织原代器官培养条件培养基的获取 | 第51-52页 |
| 2.从肺癌及其对照组织原代培养的条件培养基中鉴定游离蛋白 | 第52-65页 |
| ·原代细胞培养条件培养基的蛋白鉴定 | 第52-55页 |
| ·对LTQ系统稳定性的评价 | 第55页 |
| ·无标记定量蛋白质组学技术在条件培养基中鉴定到的差异蛋白 | 第55-60页 |
| ·差异蛋白的聚类分析 | 第60-61页 |
| ·条件培养基差异蛋白的GO富集分析 | 第61-62页 |
| ·条件培养基差异蛋白的network分析 | 第62-64页 |
| ·条件培养基蛋白与文献报道数据库的关系 | 第64-65页 |
| 3 "条件培养基差异蛋白"在起始样品中的初步验证 | 第65页 |
| 4."条件培养基差异蛋白"在肺癌患者组织和血浆中的验证 | 第65-72页 |
| ·ENO1蛋白在肺癌组织和血浆中的验证 | 第65-67页 |
| ·ALCAM蛋白在肺癌组织和血浆中的验证 | 第67-70页 |
| ·CLU蛋白在肺癌组织和血浆中的验证 | 第70-72页 |
| ·DCN蛋白在肺癌组织中的检测 | 第72页 |
| 5.其它肺癌相关游离蛋白在血浆中的检测 | 第72-77页 |
| ·ANG蛋白在血浆中的验证 | 第73-74页 |
| ·SLPI蛋白在血浆中的验证 | 第74页 |
| ·SCGB3A1蛋白在血浆中的验证 | 第74-75页 |
| ·TFPI-2蛋白在血浆中的验证 | 第75-76页 |
| ·MIA蛋白在血浆中的验证 | 第76-77页 |
| 6.从发育生物学的角度发掘与肺癌侵袭转移相关的微环境蛋白 | 第77-94页 |
| ·肺癌肿瘤组织培养条件培养基蛋白全谱在不同时期胎盘资料中的富集 | 第77-83页 |
| ·在不同预后肺癌肿瘤组织表达谱中考察GSEA分析结果 | 第83-84页 |
| ·在中期胎盘表达谱富集的肺癌相关游离蛋白的验证 | 第84-94页 |
| 7.多因素分析被测血浆蛋白的临床意义(回顾性分析) | 第94-96页 |
| 第四章 讨论 | 第96-118页 |
| 1.器官培养模型为肺癌血浆标志物鉴定提供新的思路 | 第97-98页 |
| 2.器官培养条件培养基反映肿瘤微环境信息 | 第98-99页 |
| 3.无标记定量蛋白质组学方法的建立 | 第99-101页 |
| 4.差异蛋白的初步分析及验证 | 第101-108页 |
| ·糖酵解途径 | 第101-104页 |
| ·肿瘤组织条件培养基中表达显著下调蛋白 | 第104-107页 |
| ·炎症与肿瘤血浆标记物 | 第107-108页 |
| 5.CM蛋白中一些其他蛋白的验证 | 第108-111页 |
| 6.对肿瘤侵袭转移的系统生物学类比分析 | 第111-116页 |
| ·胚胎植入与肿瘤侵袭转移的相似性 | 第111-112页 |
| ·肿瘤组织CM蛋白在浸润性较强的中期母胎界面相关基因簇中显著富集 | 第112-116页 |
| 7.肺癌联合检测的血浆蛋白标记谱的建立 | 第116页 |
| 8.展望 | 第116-118页 |
| 小结 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-139页 |
| 致谢 | 第139-142页 |
| 附表 | 第142-181页 |
