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叶绿体分裂装置中ARC6与PDV2复合物的结构与功能研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第15-29页
    1.1 叶绿体分裂分子机制研究进展第15-25页
        1.1.1 叶绿体及分裂概述第15-18页
        1.1.2 FtsZ环第18-20页
        1.1.3 ARC5环第20页
        1.1.4 Min系统第20-22页
        1.1.5 PDV1&PDV2第22-23页
        1.1.6 ARC6第23-24页
        1.1.7 PARC6第24-25页
    1.2 本课题的研究内容和意义第25-29页
第二章 实验材料与方法第29-47页
    2.1 实验仪器第29-30页
    2.2 实验材料第30-34页
        2.2.1 实验用菌种第30页
        2.2.2 载体第30页
        2.2.3 储液第30-31页
        2.2.4 蛋白纯化用缓冲液配方第31-32页
        2.2.5 SDS-PAGE以及Tricine-SDS-PAGE的配方第32-34页
        2.2.6 结晶条件筛选试剂盒第34页
    2.3 分子克隆第34-38页
        2.3.1 目的基因的扩增第34-35页
        2.3.2 提取质粒第35页
        2.3.3 DNA纯化与回收第35-36页
        2.3.4 载体以及目的基因的双酶切第36-37页
        2.3.5 连接第37页
        2.3.6 连接产物转化第37-38页
        2.3.7 克隆鉴定第38页
    2.4 蛋白纯化第38-43页
        2.4.1 蛋白的表达与超声破碎第38-40页
        2.4.2 蛋白亲和纯化第40-41页
        2.4.3 蛋白的凝胶色谱分离第41-43页
    2.5 蛋白质的结晶与优化第43-45页
        2.5.1 蛋白质结晶的原理第43-44页
        2.5.2 蛋白质结晶的方法与要求第44-45页
        2.5.3 晶体初筛第45页
        2.5.4 蛋白质晶体的优化第45页
    2.6 晶体结构的解析第45-46页
        2.6.1 晶体的防冻液第45-46页
        2.6.2 晶体相位的获得第46页
        2.6.3 晶体衍射数据的收集、处理以及解析结构第46页
    2.7 本章小结第46-47页
第三章 ARC6-PDV2复合物的表达、纯化与结晶第47-55页
    3.1 ARC6与PDV2结合力的检测第47-48页
    3.2 ARC6-PDV2的表达与纯化第48-49页
        3.2.1 融合蛋白分分子筛图第48-49页
        3.2.2 融合蛋白的SDS-PAGE鉴定第49页
    3.3 ARC6-PDV2聚集形态的鉴定第49-51页
        3.3.1 融合蛋白非变性胶的检测第50页
        3.3.2 融合蛋白超速离心分析第50-51页
        3.3.3 融合蛋白pull down实验第51页
    3.4 ARC6-PDV2复合物蛋白的晶体筛选第51-54页
        3.4.1 晶体条件的筛选与晶体条件的获得第51-53页
        3.4.2 晶体条件的优化第53-54页
    3.5 本章小结第54-55页
第四章 ARC6-PDV2复合物结构解析与生化性质研究第55-67页
    4.1 ARC6-PDV2蛋白的衍射与结构解析第55-56页
        4.1.1 晶体的捞取与防冻液的配制第55页
        4.1.2 晶体衍射与结构解析第55-56页
    4.2 ARC-PDV2复合物结构的分析第56-59页
        4.2.1 ARC-PDV2复合物结构第56-57页
        4.2.2 ARC-PDV2复合物结构与ARC6单体的比较第57-58页
        4.2.3 ARC6-PDV2复合物异源四聚体的形成第58-59页
    4.3 “锁钥机制”第59-62页
        4.3.1 PDV2~(K299-G307)的C末端与ARC6之间的相互作用第59-60页
        4.3.2 PDV2~(282-307)与ARC6~(646-801)突变体蛋白之间相互作用体外验证第60-61页
        4.3.3 PDV2~(282-307)与ARC6~(646-801)突变体蛋白之间相互作用体内验证第61-62页
        4.3.4 锁钥机制第62页
    4.4 PDV2~(V285-1291)介导的与ARC6的相互作用及ARC6二聚体的形成第62-64页
    4.5 PDV2诱导ARC6形成二聚体的分子模型第64-66页
        4.5.1 PDV2诱导ARC6形成二聚体的先决条件第65页
        4.5.2 PDV2诱导ARC6形成二聚体的简化模型第65-66页
    4.6 本章小结第66-67页
第五章 结果讨论与展望第67-69页
    5.1 实验结果的总结与讨论第67页
    5.2 质体分裂展望第67-68页
    5.3 本章小结第68-69页
参考文献第69-73页
致谢第73-75页
研究成果及发表的学术论文第75-77页
作者与导师简介第77-78页
北京化工大学硕士研究生学位论文答辩委员会决议书第78-79页

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