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对虾养殖沉积环境细菌多样性的分子分析与若干可培养技术优化探讨

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1. 前言第11-35页
   ·我国对虾养殖业以及病害控制简况第11-13页
     ·我国对虾养殖业的发展简况第11页
     ·抗生素在病害控制中的应用第11-12页
     ·抗菌肽及其应用前景第12-13页
   ·微生态制剂在水产养殖中的应用第13-16页
     ·微生态制剂的定义第13-14页
     ·微生态制剂在水产养殖中的应用第14-15页
     ·微生态制剂的缺陷第15-16页
   ·微生物培养技术的局限性以及改进策略第16-25页
     ·传统微生物纯培养技术的局限性第16-19页
     ·微生物培养技术的改进策略第19-21页
     ·结冷胶技术的研究进展第21-25页
   ·分子生态学技术方法及其应用第25-32页
     ·从自然环境中提取核酸第26页
     ·分子杂交法第26-27页
     ·基于PCR 的指纹图谱分析法第27-29页
     ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术及其应用第29-32页
   ·本论文的研究思路、内容和意义第32-35页
2. 材料与方法第35-54页
   ·材料第35-45页
     ·采样地点概况与样品采集第35页
     ·菌株和质粒第35-36页
     ·主要试剂第36页
     ·工具酶第36页
     ·引物第36页
     ·主要仪器第36-37页
     ·培养基第37-40页
     ·溶液配制第40-44页
     ·分析软件第44-45页
   ·基本方法第45-54页
     ·虾池表层沉积物样品的采集和环境参数的测定第45页
     ·虾池表层沉积物总菌和异养细菌计数第45-46页
     ·沉积物细菌的培养第46页
     ·培养前后沉积物细菌群落结构变化与优势菌的分析第46-53页
     ·细菌遗传多样性的统计学分析第53-54页
3. 结果与分析第54-91页
   ·虾池的环境因子分析第54页
     ·虾池的基本概况第54页
     ·虾池主要环境因子第54页
   ·虾池表层沉积物的细菌计数分析第54-56页
     ·虾池表层沉积物总菌计数第54-55页
     ·培养期内可培养异养菌计数第55-56页
   ·虾池表层沉积物的细菌多样性分析第56-61页
     ·表层沉积物细菌总DNA 的提取第56页
     ·表层沉积物细菌16SrDNA-V3 高变区的PCR 扩增第56-57页
     ·DGGE 基因指纹图谱的构建与细菌多样性分析第57-58页
     ·表层沉积物细菌优势种群的分子鉴定与系统发育分析第58-61页
   ·富集培养后虾池表层沉积物的细菌群落结构分析第61-91页
     ·液体培养基富集培养后虾池表层沉积物的细菌群落结构分析第61-82页
     ·固体培养基富集培养后虾池表层沉积物的细菌群落结构分析第82-91页
4. 讨论第91-104页
   ·微生物培养技术改进策略的选择以及实施第91-96页
     ·培养基的选择第91-93页
     ·接种方式和培养方式的选择第93-94页
     ·培养时间的界定第94-96页
     ·固体培养基凝固剂的选择第96页
   ·虾池表层沉积物中优势种群的分析第96-99页
   ·固体培养基富集培养后特征种群的分析第99-100页
   ·关于变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术在应用中的若干问题第100-104页
5 结论与展望第104-106页
参考文献第106-117页
附录第117-120页
 附录一 攻硕期间参与的课题第117页
 附录二 载体图谱第117-118页
 附录三 DNA 分子量标准第118-119页
 附录四 缩略语对照表第119页
 附录五 整理待发表的文章第119-120页
致谢第120页

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