| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-10页 |
| 第一部分 绪论 | 第10-30页 |
| 1 叶甲科昆虫概述 | 第10-16页 |
| ·叶甲科昆虫简介 | 第10页 |
| ·叶甲科的分类系统 | 第10-11页 |
| ·叶甲相关期刊及著作 | 第11页 |
| ·国内外研究现状 | 第11-16页 |
| 2 系统学的概念及发展概况 | 第16-18页 |
| 3 分子系统学概述 | 第18-23页 |
| ·分子系统学定义 | 第18页 |
| ·分子系统学的特点 | 第18-19页 |
| ·分子进化研究中常用分析软件包 | 第19-20页 |
| ·分子系统树构建 | 第20-23页 |
| 4 线粒体 DNA与 COII基因 | 第23-29页 |
| ·线粒体 DNA | 第23-25页 |
| ·COII基因的特点及其在昆虫系统学研究中的应用 | 第25-29页 |
| ·昆虫系统发育重建 | 第26-28页 |
| ·昆虫起源与演化研究 | 第28页 |
| ·生物地理研究 | 第28-29页 |
| 5 本课题研究的目的及意义 | 第29-30页 |
| 第二部分 材料和方法 | 第30-36页 |
| 1 实验材料 | 第30-31页 |
| ·实验试剂 | 第30页 |
| ·设备及耗材 | 第30页 |
| ·实验材料 | 第30-31页 |
| 2 实验方法 | 第31-35页 |
| ·总基因组 DNA提取 | 第31-32页 |
| ·DNA样品的检测 | 第32-33页 |
| ·PCR扩增线粒体 DNA COII基因片段 | 第33-35页 |
| 3 实验数据分析方法 | 第35-36页 |
| ·序列校对与确认 | 第35页 |
| ·序列比对 | 第35页 |
| ·序列组成分析 | 第35页 |
| ·碱基替换饱和性分析 | 第35页 |
| ·系统发育树的建立 | 第35-36页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第36-60页 |
| 1 基因组总 DNA提取、PCR扩增及 COII基因序列测定 | 第36-37页 |
| ·基因组总 DNA提取 | 第36页 |
| ·PCR扩增结果 | 第36-37页 |
| ·PCR产物测序 | 第37页 |
| 2 数据处理与分析 | 第37-39页 |
| ·序列拼接与对准 | 第37页 |
| ·碱基组成分析 | 第37-38页 |
| ·碱基替换分析 | 第38-39页 |
| 3 叶甲科 COII基因翻译成氨基酸序列 | 第39-41页 |
| ·密码子应用频率 | 第39-41页 |
| ·氨基酸组成 | 第41页 |
| 4 叶甲科昆虫不同种间的遗传距离 | 第41-42页 |
| ·核苷酸差异和遗传距离 | 第41页 |
| ·p距离与 R的关系 | 第41-42页 |
| ·叶甲科 COII基因 P距离与转换、颠换的线性关系 | 第42页 |
| 5 叶甲科22种昆虫系统发育重建 | 第42-54页 |
| ·系统树构建和外群的选择 | 第42-47页 |
| ·距离法 | 第47-50页 |
| ·贝叶斯推论 | 第50-51页 |
| ·简约法 | 第51-53页 |
| ·基于氨基酸序列重建22种叶甲系统发育树 | 第53-54页 |
| 6 分析讨论 | 第54-58页 |
| ·叶甲科部分种类 COII基因片段的序列组成和分子进化 | 第54页 |
| ·COII基因序列数据系统发育信号评估 | 第54页 |
| ·叶甲科三亚科间系统发育关系 | 第54-55页 |
| ·亚科内系统发育关系讨论 | 第55-56页 |
| ·叶甲属4种昆虫系统发育关系讨论 | 第56页 |
| ·三种系统发育推断方法的比较 | 第56-57页 |
| ·基于蛋白质序列22种叶甲系统发育关系结果讨论 | 第57页 |
| ·线粒体 COII基因在叶甲科昆虫系统发育重建中的有效性 | 第57-58页 |
| 7 分子系统学研究中需要注意的几个问题 | 第58-60页 |
| ·标本采集、固定与鉴定 | 第58页 |
| ·分子标记的选择 | 第58页 |
| ·取样策略 | 第58-59页 |
| ·外群的选择 | 第59-60页 |
| 第四部分 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-69页 |
| 附录 | 第69-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第73页 |
