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两种线状病毒分子变异的研究及热处理对梨基因表达的影响

摘要第1-11页
Abstract第11-15页
缩略词表(Abbreviation)第15-17页
第一章 果树病毒的研究进展第17-34页
   ·苹果茎沟病毒和苹果褪绿叶斑病毒的分子生物学特性研究第17-19页
   ·病毒分子变异研究的常用技术—单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析第19-21页
   ·病毒在寄主中的定位分布检测技术研究第21-23页
   ·高温非生物因子诱导寄主获得抗性机理第23-25页
   ·热处理和茎尖脱除病毒机理的研究第25-29页
     ·热处理脱病毒机理的研究第26-28页
     ·茎尖培养脱病毒机理研究第28-29页
   ·抑制消减杂交技术和表达序列标签(ESTs)技术在植物基因表达研究中的应用第29-32页
   ·目的和意义第32-34页
第二章 两种线状病毒的分子变异研究第34-78页
   ·前言第34-35页
   ·研究材料第35-37页
     ·梨和苹果样品第35页
     ·核果类样品第35页
     ·主要试剂第35-36页
     ·RT-PCR引物的设计及合成引物第36-37页
   ·研究方法第37-44页
     ·双抗夹心法(Double Antibody Sandwich-Enzyme Linked Immunosorbent Assay,DAS-ELISA)第37页
     ·CTAB法提取总RNA第37页
     ·Trizol法提取总RNA第37-38页
     ·SuperScript~(TM) Ⅲ One-Step RT-PCR第38页
     ·试管捕捉RT-PCR(TC-RT-PCR)第38-40页
     ·一步法多重PCR检测体系第40页
     ·PCR产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第40-41页
     ·单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析第41页
     ·DNA片段的回收与纯化第41-42页
     ·连接第42页
     ·大肠杆菌JM109感受态细胞的制备及转化第42-43页
     ·质粒DNA的提取第43页
     ·质粒DNA酶切鉴定第43页
     ·克隆和序列分析第43-44页
   ·结果和分析第44-76页
     ·梨和苹果四种主要病毒的检测结果第44-48页
       ·ACLSV、ASGV、ASPV和ApMV的DAS-ELISA检测结果第44页
       ·CTAB和Trizol法提取总RNA的电泳检测结果第44-46页
       ·苹果上四种病毒的多重RT-PCR检测结果第46-47页
       ·ELISA和多重RT-PCR法检测苹果上四种病毒的检测效果比较第47-48页
     ·苹果和梨的ACLSV不同分离物3′端基因克隆及序列分析第48-72页
       ·苹果和梨的ACLSV不同分离物3′端基因的RT-PCR检测结果第48-49页
       ·ACLSV的3′端基因的RT-PCR产物的阳性克隆鉴定结果第49-50页
       ·来源于加拿大ACLSV分离物的3′端基因的核苷酸序列分析第50-53页
       ·来源于加拿大ACLSV分离物的C端CP基因的氨基酸序列分析第53-56页
       ·来源于中国ACLSV分离物的3′端基因的核苷酸序列分析第56-60页
       ·来源于中国ACLSV分离物的C端CP基因的氨基酸序列分析第60-63页
       ·来源于砂梨的ACLSV分离物的PCR-SSCP分析结果第63页
       ·来源于砂梨的ACLSV分离物内部的遗传变异分析结果第63-72页
     ·One-step RT-PCR和嫁接‘Kwanzan'的生物学法检测CGRM的结果第72-74页
     ·CGRMV不同分离物CP基因克隆及序列分析第74-76页
       ·CGRMV不同分离物CP基因的RT-PCR产物的阳性克隆鉴定结果第74页
       ·CGRMV分离物的CP基因编码的氨基酸序列分析第74-76页
   ·结论与讨论第76-78页
第三章 热处理对病毒在砂梨离体植株内分布的影响第78-84页
   ·前言第78页
   ·研究材料第78-79页
     ·砂梨样品第78-79页
       ·培养基第79页
     ·杂交检测的主要试剂第79页
   ·研究方法第79-80页
     ·脱毒材料的处理第79页
       ·试管苗准备第79页
       ·变温热处理第79页
     ·组织印迹杂交检测第79-80页
   ·结果与分析第80-82页
     ·ACLSV和ASGV在砂梨离体植株中的分布特点第80-81页
     ·变温34℃/42℃处理50d对ACLSV和ASGV在梨离体植株中分布的影响第81-82页
   ·结论与讨论第82-84页
第四章 热处理对梨离体植株基因表达的影响第84-120页
   ·前言第84-85页
   ·研究材料第85页
     ·梨离体植株材料第85页
     ·主要试剂及试剂盒第85页
   ·研究方法第85-95页
     ·梨离体植株的热处理第85页
     ·总RNA的提取及mRNA的分离第85-87页
     ·抑制差减杂交第87-92页
       ·ds cDNA合成第88-89页
       ·Rsa Ⅰ酶切第89-90页
       ·接头连接第90-91页
       ·差减杂交第91-92页
       ·两次PCR选择性扩增第92页
     ·差减文库生成第92-93页
     ·差减文库筛选第93-95页
       ·插入片段的扩增及反向Southern斑点杂交膜的制备第93页
       ·反向Southern斑点杂交第93-94页
       ·差异表达克隆选取第94页
       ·序列同源性检索第94-95页
   ·结果与分析第95-117页
     ·差减文库构建第95-100页
       ·Tester和Driver样品总RNA质量检测第95页
       ·mRNA质量检测第95-96页
       ·接头连接及连接效率检测第96-97页
       ·差减杂交产物的选择性PCR扩增结果第97-98页
       ·SSH cDNA差减文库质量评价第98-100页
     ·差异表达片段的反向Southern斑点杂交筛选结果第100-101页
     ·差异表达片段的序列分析及功能分类第101-117页
       ·差异表达片段的序列分析第101-115页
       ·差异表达片段的基因功能分类第115-117页
   ·讨论与小结第117-120页
参考文献第120-133页
附录A:主要试剂及溶液的配制第133-136页
附录B:差减文库所用接头和引物信息第136-137页
附录C:PMD18-T载体信息第137-138页
附录D:pGEM-T Easy载体信息图第138-139页
附录E:研究生在读期间已发表或已接受的文章第139-140页
致谢第140页

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