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棉花在黄萎病菌侵染早期的蛋白质组及表达谱分析

摘要第1-12页
Abstract第12-16页
第一章 文献综述第16-32页
   ·黄萎病菌研究进展第16-17页
     ·种的分类第16页
     ·生理型划分第16-17页
     ·棉花黄萎病适宜环境第17页
   ·黄萎病致病机理第17-19页
     ·导管堵塞说第17-18页
     ·毒素说第18-19页
   ·棉花抗黄萎病机理第19-21页
     ·组织结构抗性第20页
     ·生理生化抗性第20-21页
   ·植物蛋白质组学研究进展第21-27页
     ·蛋白质组学研究技术第21-25页
     ·植物亚细胞蛋白质组第25-27页
     ·蛋白质组学在植物与病原菌相互作用研究中的应用第27页
   ·植物转录组学研究进展第27-32页
     ·转录组研究技术第28-29页
     ·转录组学在植物与病原菌相互作用研究中的应用第29-32页
第二章 引言第32-34页
   ·论文立题依据第32-33页
   ·论文技术路线第33-34页
第三章 棉花蛋白质双向电泳技术体系的建立第34-56页
   ·实验材料第34-36页
     ·植物材料第34页
     ·生化试剂第34页
     ·仪器设备第34-35页
     ·相关试剂与缓冲液配方第35-36页
   ·实验方法第36-43页
     ·蛋白质的提取第36-39页
     ·蛋白质定量与SDS-PAGE电泳第39页
     ·蛋白质双向电泳第39-40页
     ·凝胶染色及图像采集分析第40-41页
     ·蛋白质质谱分析与检索第41页
     ·V.dahliae培养与棉花接菌第41-42页
     ·RNA反转录方法第42页
     ·Realtime-PCR方法第42-43页
   ·结果与分析第43-53页
     ·蛋白提取方法比较第43-45页
     ·双向电泳第45-47页
     ·Method D基础上的优化第47-49页
     ·V.dahliae侵染后棉花叶片的差异蛋白质组学初步研究第49-51页
     ·黄萎病与伤处理诱导原花色素通路相关基因的表达第51-53页
   ·讨论第53-54页
     ·棉花总蛋白的双向电泳第53-54页
     ·V.dahliae侵染后,棉花叶片的差异蛋白质组学研究第54页
   ·小结第54-56页
第四章 V.dahliae侵染后棉花根差异蛋白质组学研究第56-74页
   ·实验材料第56-57页
     ·材料第56页
     ·生化试剂第56页
     ·仪器设备第56页
     ·相关试剂与缓冲液配方第56-57页
   ·实验方法第57-59页
     ·V.dahliae接菌第57页
     ·蛋白质提取第57-58页
     ·蛋白质样品溶解与定量第58页
     ·双向电泳与凝胶染色第58页
     ·图像采集与分析第58页
     ·蛋白质质谱分析与检索第58页
     ·棉花根部活性氧检测第58页
     ·棉花组织死亡细胞检测第58页
     ·毒素及抑制剂处理第58-59页
   ·结果与分析第59-72页
     ·有效可靠的棉花接菌方法第59-60页
     ·棉花根部组织材料的双向电泳第60-62页
     ·V.dahliae侵染条件下,棉花根部组织差异蛋白质组学第62-67页
       ·上调表达蛋白第65页
       ·临时上调表达蛋白第65-66页
       ·下调表达蛋白第66-67页
     ·V.dahliae侵染后,棉花微管组织组织中活性氧的积累与细胞坏死第67-69页
     ·活性氧不是导致细胞坏死的原因第69页
     ·V.dahliae毒素诱导的植物细胞死亡需要启动植物新蛋白质的合成,并且是年龄依赖性的 #544.4 讨论第69-72页
   ·讨论第72页
     ·V.dahliae侵染后,棉花根部的差异蛋白质组学第72页
     ·V.dahliae上清毒素的致病及抑制实验第72页
   ·小结第72-74页
第五章 弱致病V.dahliae侵染后,棉花根表达谱分析第74-93页
   ·实验材料第74-75页
     ·材料第74页
     ·生化试剂第74页
     ·相关试剂与缓冲液配方第74-75页
   ·实验方法第75-79页
     ·棉花基因组DNA的提取方法第75-76页
     ·平衡酚(pH 5.5)与RNA提取缓冲液配制第76页
     ·RNA提取步骤第76-77页
     ·改进的试剂盒方法来提取RNA第77页
     ·表达谱分析第77-78页
     ·RNA反转录方法第78页
     ·Realtime-PCR方法第78-79页
     ·Realtime-PCR数据处理第79页
   ·结果与分析第79-91页
     ·弱致病型V.dahliae侵染导致棉花幼苗矮小第79-80页
     ·RNA提取方法的建立第80-83页
     ·V.dahliae侵染后,棉花根Solexa表达谱分析结果第83-88页
     ·上调表达通路第88-91页
     ·下调表达通路第91页
   ·讨论第91-92页
     ·真菌孢子可能在致病中发挥作用第91页
     ·Solexa结果第91-92页
     ·Steroid合成通路基因参与棉花侧根生长第92页
   ·小结第92-93页
第六章 结论第93-96页
   ·主要结论第93-94页
     ·棉花双向电泳技术建立第93页
     ·棉花根差异蛋白质组学研究第93-94页
     ·弱致病V.dahliae侵染棉花后,棉花根部组织差异表达基因第94页
   ·论文的创新第94-96页
     ·建立棉花研究的蛋白质组及表达谱实验体系第94-95页
     ·黄萎病菌胞外毒素通过主动调控植物的蛋白合成导致植物坏死第95页
     ·黄萎病菌弱致病株不会导致棉花萎焉的一个重要原因是与甾族化合物代谢调控密切相关第95-96页
参考文献第96-113页
附录1 缩略词表第113-115页
附录2 学习期间主持、参加的主要项目和发表的文章第115-116页
附录3 根差异蛋白质质谱图第116-124页
致谢第124页

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