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海湾扇贝微卫星标记的开发及遗传连锁图谱的构建

中文摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 综述第12-39页
 第一节 微卫星标记及其应用第12-20页
     ·微卫星DNA概述第12-13页
     ·微卫星序列的起源与突变机制第13-15页
       ·微卫星序列的起源第13-14页
       ·微卫星序列突变机制第14-15页
     ·微卫星分子标记的优点与不足第15-17页
     ·微卫星标记在贝类遗传育种中的应用第17-20页
       ·群体遗传学第17-18页
       ·亲缘关系鉴定第18-19页
       ·构建遗传连锁图谱第19-20页
 第二节 微卫星DNA的筛选方法第20-27页
     ·公共数据库搜索微卫星序列第20-21页
     ·引物在物种间的通用性扩增第21页
     ·筛选基因组文库法第21页
     ·选择性杂交法第21-25页
       ·尼龙膜富集法第22-23页
       ·磁珠富集法第23-24页
       ·FIASCO法第24-25页
     ·引物法富集微卫星第25页
     ·几种分离技术的比较第25-27页
 第三节 遗传连锁图谱构建及应用第27-36页
     ·遗传连锁图谱的构建过程第27-32页
       ·作图群体的建立第27-29页
       ·遗传标记的选择第29页
       ·连锁数据的统计分析第29-32页
     ·遗传连锁图谱的应用前景第32-36页
       ·QTL定位第32-33页
       ·图位克隆第33-34页
       ·比较基因组作图第34页
       ·标记辅助选择育种第34-36页
 第四节 我国海湾扇贝的引种及养殖现状第36-39页
第二章 海湾扇贝微卫星标记的筛选与分析第39-68页
 第一节 材料与方法第40-50页
     ·实验材料第40页
       ·扇贝样品第40页
       ·质粒和载体第40页
       ·主要试剂第40页
     ·实验方法第40-50页
       ·DNA的提取方法第40-41页
       ·大肠杆菌的制备第41-42页
       ·富集文库的构建第42-48页
       ·序列的测定第48页
       ·微卫星引物的设计与筛选第48-49页
       ·PCR产物的检测第49页
       ·多态性检测第49-50页
 第二节 实验结果第50-56页
     ·DNA的提取及定量第50页
     ·基因组DNA的酶切和回收第50-51页
     ·接头与酶切片段的连接效果第51页
     ·富集文库的扫描第51页
     ·阳性克隆的测序及分析第51-53页
     ·引物设计和多态性检测第53-56页
 第三节 讨论与分析第56-60页
     ·筛选方法的比较第56页
     ·酶切和连接反应第56-57页
     ·膜杂交富集第57-58页
     ·富集文库质量的鉴定第58-60页
 第四节 湾扇贝养殖群体的遗传多样性与分化第60-68页
     ·材料与方法第60-62页
       ·实验材料第60页
       ·方法第60-62页
     ·结果第62-63页
     ·讨论第63-68页
第三章 作图家系的构建及形态学指标分析第68-79页
 第一节 实验材料和方法第68-71页
     ·亲本来源第68-69页
     ·作图群体的建立第69-70页
     ·作图群体的检测第70-71页
 第二节 实验结果第71-76页
     ·杂交家系的检测第71-72页
     ·壳色分析第72页
     ·生长指标分析第72-73页
     ·各生长指标的相关分析第73-76页
 第三节 讨论第76-79页
     ·作图亲本的选择第76-77页
     ·整合遗传连锁的构建第77页
     ·拟测交作图策略第77-78页
     ·微卫星标记在杂交家系鉴定中的应用第78-79页
第四章 海湾扇贝微卫星遗传连锁图谱的构建第79-105页
 第一节 材料与方法第79-84页
     ·作图群体的选择和微卫星标记的筛选第79页
     ·DNA提取、PCR反应及产物检测第79页
     ·微卫星标记分离数据的收集第79-81页
     ·连锁分析与作图第81-84页
 第二节 实验结果第84-95页
     ·微卫星标记的分离方式第84-85页
     ·连锁图谱概况第85-95页
 第三节 讨论第95-105页
     ·作图标记的选择第95页
     ·拟测交作图策略第95-96页
     ·遗传连锁图谱第96页
     ·偏分离标记第96-98页
     ·性别间和个体间重组率的差异第98-105页
第五章 海湾扇贝生长相关QTL的定位分析第105-113页
   ·材料与方法第106页
     ·作图家系的建立第106页
     ·目标性状的测量第106页
     ·QTL定位第106页
   ·QTL定位结果第106-111页
     ·雌性图谱定位结果第106-107页
     ·雄性图谱定位结果第107页
     ·各性状QTL定位结果第107-111页
   ·讨论第111-113页
     ·QTL定位策略第111页
     ·参考家系的选择第111-112页
     ·存在问题及展望第112-113页
第六章 总结第113-115页
参考文献第115-127页
已完成论文和发表文章第127-128页
致谢第128页

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