海湾扇贝微卫星标记的开发及遗传连锁图谱的构建
| 中文摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第一章 综述 | 第12-39页 |
| 第一节 微卫星标记及其应用 | 第12-20页 |
| ·微卫星DNA概述 | 第12-13页 |
| ·微卫星序列的起源与突变机制 | 第13-15页 |
| ·微卫星序列的起源 | 第13-14页 |
| ·微卫星序列突变机制 | 第14-15页 |
| ·微卫星分子标记的优点与不足 | 第15-17页 |
| ·微卫星标记在贝类遗传育种中的应用 | 第17-20页 |
| ·群体遗传学 | 第17-18页 |
| ·亲缘关系鉴定 | 第18-19页 |
| ·构建遗传连锁图谱 | 第19-20页 |
| 第二节 微卫星DNA的筛选方法 | 第20-27页 |
| ·公共数据库搜索微卫星序列 | 第20-21页 |
| ·引物在物种间的通用性扩增 | 第21页 |
| ·筛选基因组文库法 | 第21页 |
| ·选择性杂交法 | 第21-25页 |
| ·尼龙膜富集法 | 第22-23页 |
| ·磁珠富集法 | 第23-24页 |
| ·FIASCO法 | 第24-25页 |
| ·引物法富集微卫星 | 第25页 |
| ·几种分离技术的比较 | 第25-27页 |
| 第三节 遗传连锁图谱构建及应用 | 第27-36页 |
| ·遗传连锁图谱的构建过程 | 第27-32页 |
| ·作图群体的建立 | 第27-29页 |
| ·遗传标记的选择 | 第29页 |
| ·连锁数据的统计分析 | 第29-32页 |
| ·遗传连锁图谱的应用前景 | 第32-36页 |
| ·QTL定位 | 第32-33页 |
| ·图位克隆 | 第33-34页 |
| ·比较基因组作图 | 第34页 |
| ·标记辅助选择育种 | 第34-36页 |
| 第四节 我国海湾扇贝的引种及养殖现状 | 第36-39页 |
| 第二章 海湾扇贝微卫星标记的筛选与分析 | 第39-68页 |
| 第一节 材料与方法 | 第40-50页 |
| ·实验材料 | 第40页 |
| ·扇贝样品 | 第40页 |
| ·质粒和载体 | 第40页 |
| ·主要试剂 | 第40页 |
| ·实验方法 | 第40-50页 |
| ·DNA的提取方法 | 第40-41页 |
| ·大肠杆菌的制备 | 第41-42页 |
| ·富集文库的构建 | 第42-48页 |
| ·序列的测定 | 第48页 |
| ·微卫星引物的设计与筛选 | 第48-49页 |
| ·PCR产物的检测 | 第49页 |
| ·多态性检测 | 第49-50页 |
| 第二节 实验结果 | 第50-56页 |
| ·DNA的提取及定量 | 第50页 |
| ·基因组DNA的酶切和回收 | 第50-51页 |
| ·接头与酶切片段的连接效果 | 第51页 |
| ·富集文库的扫描 | 第51页 |
| ·阳性克隆的测序及分析 | 第51-53页 |
| ·引物设计和多态性检测 | 第53-56页 |
| 第三节 讨论与分析 | 第56-60页 |
| ·筛选方法的比较 | 第56页 |
| ·酶切和连接反应 | 第56-57页 |
| ·膜杂交富集 | 第57-58页 |
| ·富集文库质量的鉴定 | 第58-60页 |
| 第四节 湾扇贝养殖群体的遗传多样性与分化 | 第60-68页 |
| ·材料与方法 | 第60-62页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·方法 | 第60-62页 |
| ·结果 | 第62-63页 |
| ·讨论 | 第63-68页 |
| 第三章 作图家系的构建及形态学指标分析 | 第68-79页 |
| 第一节 实验材料和方法 | 第68-71页 |
| ·亲本来源 | 第68-69页 |
| ·作图群体的建立 | 第69-70页 |
| ·作图群体的检测 | 第70-71页 |
| 第二节 实验结果 | 第71-76页 |
| ·杂交家系的检测 | 第71-72页 |
| ·壳色分析 | 第72页 |
| ·生长指标分析 | 第72-73页 |
| ·各生长指标的相关分析 | 第73-76页 |
| 第三节 讨论 | 第76-79页 |
| ·作图亲本的选择 | 第76-77页 |
| ·整合遗传连锁的构建 | 第77页 |
| ·拟测交作图策略 | 第77-78页 |
| ·微卫星标记在杂交家系鉴定中的应用 | 第78-79页 |
| 第四章 海湾扇贝微卫星遗传连锁图谱的构建 | 第79-105页 |
| 第一节 材料与方法 | 第79-84页 |
| ·作图群体的选择和微卫星标记的筛选 | 第79页 |
| ·DNA提取、PCR反应及产物检测 | 第79页 |
| ·微卫星标记分离数据的收集 | 第79-81页 |
| ·连锁分析与作图 | 第81-84页 |
| 第二节 实验结果 | 第84-95页 |
| ·微卫星标记的分离方式 | 第84-85页 |
| ·连锁图谱概况 | 第85-95页 |
| 第三节 讨论 | 第95-105页 |
| ·作图标记的选择 | 第95页 |
| ·拟测交作图策略 | 第95-96页 |
| ·遗传连锁图谱 | 第96页 |
| ·偏分离标记 | 第96-98页 |
| ·性别间和个体间重组率的差异 | 第98-105页 |
| 第五章 海湾扇贝生长相关QTL的定位分析 | 第105-113页 |
| ·材料与方法 | 第106页 |
| ·作图家系的建立 | 第106页 |
| ·目标性状的测量 | 第106页 |
| ·QTL定位 | 第106页 |
| ·QTL定位结果 | 第106-111页 |
| ·雌性图谱定位结果 | 第106-107页 |
| ·雄性图谱定位结果 | 第107页 |
| ·各性状QTL定位结果 | 第107-111页 |
| ·讨论 | 第111-113页 |
| ·QTL定位策略 | 第111页 |
| ·参考家系的选择 | 第111-112页 |
| ·存在问题及展望 | 第112-113页 |
| 第六章 总结 | 第113-115页 |
| 参考文献 | 第115-127页 |
| 已完成论文和发表文章 | 第127-128页 |
| 致谢 | 第128页 |
