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家蚕特有基因的鉴定、表达模式分析及功能初探

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-15页
第一章 文献综述第15-29页
   ·概述第15-17页
     ·昆虫多态性与遗传物质第15-16页
     ·鳞翅目昆虫概述第16页
     ·昆虫的基因组计划第16-17页
   ·物种的特有基因第17-27页
     ·物种特有基因的定义及特点第17-18页
     ·关于孤儿基因成因的几个推测第18-19页
     ·孤儿基因的研究现状第19-25页
     ·研究孤儿基因的意义第25-26页
     ·研究孤儿基因的主要手段第26-27页
   ·家蚕基因组和特有基因第27-29页
第二章 引言第29-33页
   ·研究背景及目的意义第29-31页
   ·研究的主要内容第31页
   ·技术路线第31-33页
第三章 家蚕特有基因的鉴定及功能分析第33-42页
   ·材料和方法第33-34页
     ·数据库和基因组序列第33页
     ·基因组序列建库及序列比对第33-34页
     ·家蚕特有基因的序列分析第34页
     ·家蚕特有基因染色体分布分析第34页
   ·结果与分析第34-38页
     ·六个昆虫基因组特有基因的鉴定第34-36页
     ·家蚕特有基因的EST分析第36页
     ·家蚕特有基因功能注释分析第36-37页
     ·拷贝数及染色体分布分析第37-38页
   ·讨论第38-42页
第四章 基于芯片数据的家蚕特有基因的表达分析第42-49页
   ·材料和方法第42页
     ·基因芯片数据来源第42页
     ·芯片数据分析第42页
   ·结果与分析第42-47页
     ·家蚕特有基因组织芯片分析第42-43页
     ·家蚕特有基因胚胎期芯片分析第43-44页
     ·家蚕特有基因在幼虫发育期的芯片分析第44-45页
     ·家蚕特有基因在变态发育期芯片分析第45-46页
     ·家蚕特有基因在免疫诱导芯片中的分析第46-47页
   ·讨论第47-49页
第五章 利用RNAi探索候选基因的功能第49-65页
   ·实验材料与试剂第49-51页
     ·实验材料第49页
     ·实验试剂第49-50页
     ·主要仪器第50页
     ·主要溶液的配置第50-51页
   ·实验方法第51-57页
     ·目标基因的筛选第51页
     ·RNA材料的提取及反转录第51-53页
     ·dsRNA引物的设计第53-54页
     ·dsRNA的体外转录第54-56页
     ·家蚕预蛹dsRNA注射第56页
     ·BGIBMGA000702基因RNAi效应的分子检测第56-57页
   ·结果与分析第57-63页
     ·目标基因的确定第57-58页
     ·候选基因dsRNA的制备第58页
     ·目标基因的RNAi表型观察第58-59页
     ·BGIBMGA000702基因的时期与组织表达特征检测第59-61页
     ·BGIBMGA000702的干涉验证第61-63页
     ·BGIBMGA000702基因干涉效应分子水平检测第63页
   ·讨论第63-65页
第六章 BGIBMGA000702基因的原核表达、蛋白纯化及Western-blotting检测第65-89页
   ·材料第65-72页
     ·主要试剂第65页
     ·载体和菌株第65页
     ·主要使用仪器第65-66页
     ·实验溶液配置第66-72页
   ·实验方法第72-81页
     ·BGIBMGA000702的序列分析第72页
     ·BGIBMGA000702基因重组表达质粒的构建第72-75页
     ·BGIBMGA000702基因的原核表达第75-77页
     ·蛋白纯化第77-78页
     ·抗体制备及纯化第78-79页
     ·Western blotting检测表达蛋白第79-81页
   ·结果与分析第81-86页
     ·BGIBMGA000702基因的序列分析及结构域预测第81-82页
     ·BGIBMGA000702基因的表达载体构建第82页
     ·重组质粒诱导表达及表达形式鉴定第82-84页
     ·BGIBMGA000702重组蛋白的纯化第84页
     ·BGIBMGA000702抗体的制备和纯化第84-85页
     ·Western blotting检测目的蛋白的表达第85-86页
   ·讨论第86-89页
     ·外源蛋白在大肠杆菌中的原核表达第86-87页
     ·蛋白水平表达检测第87-89页
第七章 总结第89-93页
   ·鉴定家蚕等六个昆虫基因组中的特有基因第89页
   ·家蚕特有基因的生物信息学分析第89页
   ·家蚕特有基因时空及免疫表达模式分析第89-90页
   ·筛选了13个候选基因并进行RNAi干涉实验第90页
   ·对BGIBMGA000702基因进行原核表达及western blotting检测第90-93页
参考文献第93-99页
硕士在读期间发表文章及课题参研情况第99-101页
致谢第101页

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