| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 主要缩略词与符号一览表 | 第12-13页 |
| 第一章 研究背景 | 第13-24页 |
| 1.1 引言 | 第13页 |
| 1.2 饲料利用效率是绵羊的重要经济性状 | 第13-14页 |
| 1.3 RFI的测定 | 第14-16页 |
| 1.4 RFI的影响因素 | 第16-18页 |
| 1.4.1 采食量 | 第16-17页 |
| 1.4.2 消化吸收 | 第17页 |
| 1.4.3 体组成与新陈代谢 | 第17-18页 |
| 1.4.4 活动量 | 第18页 |
| 1.4.5 体温调节 | 第18页 |
| 1.5 RFI的研究进展 | 第18-23页 |
| 1.5.1 RFI候选基因的研究 | 第18-20页 |
| 1.5.2 RFI性状的转录调控研究 | 第20-22页 |
| 1.5.3 RFI的微生物菌群结构研究 | 第22-23页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 第二章 育肥期湖羊公羔饲料效率相关性状特征及遗传参数分析 | 第24-43页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-32页 |
| 2.2.1 试验羊群 | 第25页 |
| 2.2.2 性状测定 | 第25-32页 |
| 2.2.3 试验分组与统计分析 | 第32页 |
| 2.3 结果与分析 | 第32-40页 |
| 2.3.1 饲料效率相关性状描述性统计量 | 第32-35页 |
| 2.3.2 性状间的相关性分析 | 第35-36页 |
| 2.3.3 不同RFI湖羊公羔生长性状的比较分析 | 第36-38页 |
| 2.3.4 不同RFI湖羊公羔胴体性状、体组成和肌肉品质的比较分析 | 第38页 |
| 2.3.5 育肥期湖羊公羔重要经济性状的遗传力估计 | 第38-40页 |
| 2.4 讨论 | 第40-42页 |
| 2.5 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 不同RFI羔羊瘤胃微生物多样性的研究 | 第43-57页 |
| 3.1 引言 | 第43页 |
| 3.2 材料与方法 | 第43-46页 |
| 3.2.1 试验群体与饲养管理 | 第43页 |
| 3.2.2 剩余采食量（Residual feed intake，RFI）和饲料转化率（Feed conversion rate，FCR）的计算 | 第43页 |
| 3.2.3 样品采集 | 第43页 |
| 3.2.4 试剂耗材 | 第43-44页 |
| 3.2.5 仪器设备 | 第44页 |
| 3.2.6 瘤胃内容物DNA提取与质量检测 | 第44-45页 |
| 3.2.7 16 SrDNA V3-V4区PCR扩增子测序 | 第45页 |
| 3.2.8 测序数据分析 | 第45-46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-55页 |
| 3.3.1 DNA样品及16S V3-V4区PCR扩增产物质量 | 第46-47页 |
| 3.3.2 16 SrDNA V3-V4 测序数据量与质量 | 第47页 |
| 3.3.3 Alpha多样性分析 | 第47-48页 |
| 3.3.4 Beta多样性分析 | 第48-49页 |
| 3.3.5 羔羊瘤胃微生物组成及功能富集分析 | 第49-51页 |
| 3.3.6 不同RFI羔羊瘤胃微生物区系差异分析 | 第51-54页 |
| 3.3.7 差异微生物的LEfSe及功能富集分析 | 第54-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-56页 |
| 3.5 小结 | 第56-57页 |
| 第四章 极端RFI羔羊肝脏组织转录组分析 | 第57-72页 |
| 4.1 前言 | 第57页 |
| 4.2 材料与方法 | 第57-61页 |
| 4.2.1 组织样品 | 第57页 |
| 4.2.2 试剂耗材 | 第57页 |
| 4.2.3 仪器设备 | 第57-58页 |
| 4.2.4 肝脏组织总RNA的提取与检测 | 第58-59页 |
| 4.2.5 mRNA测序 | 第59-61页 |
| 4.3 结果与分析 | 第61-70页 |
| 4.3.1 总RNA的提取与质量检测 | 第61页 |
| 4.3.2 原始数据的质量控制 | 第61-63页 |
| 4.3.3 Clean reads与参考基因组的比对 | 第63页 |
| 4.3.4 Reads在各个染色体上的密度分布情况 | 第63-65页 |
| 4.3.5 样品间表达相关性检查 | 第65-66页 |
| 4.3.6 差异表达mRNA转录本分析 | 第66页 |
| 4.3.7 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第66页 |
| 4.3.8 差异表达基因的Q-PCR验证 | 第66-70页 |
| 4.4 讨论 | 第70-71页 |
| 4.5 小结 | 第71-72页 |
| 第五章 差异表达基因的SNPs扫描及其与饲料效率性状的关联分析 | 第72-80页 |
| 5.1 前言 | 第72页 |
| 5.2 材料与方法 | 第72-74页 |
| 5.2.1 试验群体 | 第72页 |
| 5.2.2 性状测定 | 第72-73页 |
| 5.2.3 样品采集与DNA提取 | 第73页 |
| 5.2.4 SNPs扫描与基因型检测 | 第73页 |
| 5.2.5 基因型与饲料转化率的关联分析 | 第73-74页 |
| 5.3 结果与分析 | 第74-78页 |
| 5.3.1 试验群体DNA质量与浓度 | 第74-75页 |
| 5.3.2 绵羊ADRA2A和 RYR2 基因目的片段的PCR扩增 | 第75页 |
| 5.3.3 绵羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs扫描 | 第75-76页 |
| 5.3.4 绵羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs检测及其与饲料转化率的关联分析 | 第76-78页 |
| 5.4 讨论 | 第78-79页 |
| 5.4.1 KASPar SNP分型技术 | 第78页 |
| 5.4.2 绵羊ADRA2A和 RYR2 基因与饲料转化率 | 第78-79页 |
| 5.5 小结 | 第79-80页 |
| 第六章 全文小结 | 第80-82页 |
| 6.1 主要结论 | 第80页 |
| 6.2 创新点 | 第80-81页 |
| 6.3 研究展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 在学期间的研究成果 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 附录 | 第93-132页 |
