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世居高原藏族人群EGLN1基因单核苷酸多态性(SNP)与皮层体积的关联性研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
英文缩略词第15-16页
第一章 前言第16-34页
    1.1 藏族人群高原适应的表型性状第16-21页
        1.1.1 高原适应与高原习服第16-17页
        1.1.2 藏族人群低氧适应的典型生理遗传特征第17-21页
    1.2 高原低氧适应基因及其调节机制第21-27页
        1.2.1 高原低氧适应基因第21-24页
        1.2.2 HIF通路第24-26页
        1.2.3 EGLN1基因的生理作用第26-27页
    1.3 高原脑适应和影像遗传学的研究第27-34页
        1.3.1 高原脑适应第27-31页
        1.3.2 影像遗传学的研究第31-34页
第二章 材料与方法第34-46页
    2.1 研究对象第34-35页
        2.1.1 世居高原组第34页
        2.1.2 平原对照组第34-35页
    2.2 生理指标测试第35-36页
    2.3 血样采集与基因分型第36-39页
        2.3.1 基因序列的获取和引物设计第36-37页
        2.3.2 引物稀释第37页
        2.3.3 Sequenom MassArray系统基因分型步骤第37页
        2.3.4 MassARRAY分析第37-39页
    2.4 数据分析第39-40页
        2.4.1 单个SNP关联分析第40页
        2.4.2 连锁不平衡分析(linkage disequilibrium,LD)第40页
        2.4.3 单体型(haplotype)分析第40页
    2.5 核磁共振数据的采集和分析方法第40-45页
        2.5.1 数据采集第40-41页
        2.5.2 MRI数据分析第41-44页
        2.5.3 全脑体积分析第44-45页
    2.6 EGLN1基因上SNP位点和大脑皮层体积的关联性分析第45-46页
第三章 结果第46-61页
    3.1 EGLN1基因上SNP位点检出率第46-48页
    3.2 EGLN1基因上SNP位点的哈温平衡(HWE)第48-50页
    3.3 EGLN1基因上SNP位点的最小等位基因频率(MAF)第50-52页
    3.4 EGLN1基因上SNP位点单个SNP关联分析第52-54页
    3.5 EGLN1基因上SNP位点连锁不平衡(LD)第54-55页
    3.6 EGLN1基因上SNP位点的单体型(Haplotype)分析第55-57页
    3.7 EGLN1基因与世居高原藏族被试的脑形态学结构相关性研究第57-61页
第四章 讨论第61-65页
    4.1 额中回下部灰质变化的意义第62页
    4.2 楔前叶灰质变化的意义第62-63页
    4.3 距状旁回灰质变化的意义第63页
    4.4 额前回灰质变化的意义第63页
    4.5 顶叶灰质变化的意义第63-65页
第五章 总结第65-67页
    5.1 结论第65页
    5.2 本课题的创新与不足之处第65-66页
    5.3 研究展望第66-67页
参考文献第67-80页
致谢第80-81页

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