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基于网络模块的特征基因分析方法研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第1章 绪论第12-17页
    1.1 引言第12页
    1.2 研究背景及意义第12-13页
    1.3 国内外研究现状第13-15页
    1.4 论文结构安排第15-17页
第2章 相关的理论知识第17-33页
    2.1 基因基础知识介绍第17-19页
    2.2 基因表达谱数据第19-21页
        2.2.1 基因表达谱数据构建第19-20页
        2.2.2 基因表达谱数据形态第20页
        2.2.3 基因表达谱数据的预处理第20-21页
        2.2.4 基因表达谱数据的应用第21页
    2.3 基因选择方法第21-29页
        2.3.1 基于Filter的基因选择方法第22-26页
        2.3.2 基于Wrapper的基因选择方法第26-27页
        2.3.3 嵌入式方法第27-28页
        2.3.4 混合法第28-29页
    2.4 聚类第29-31页
        2.4.1 相似度计算方法第30-31页
        2.4.2 聚类算法划分第31页
    2.5 小结第31-33页
第3章 一种基于网络模块的癌症特征基因选择方法第33-49页
    3.1 引言第33页
    3.2 算法原理与实现第33-42页
        3.2.1 过滤法第34页
        3.2.2 构建基因共表达网络第34-38页
        3.2.3 分类器第38-41页
        3.2.4 交叉验证第41-42页
    3.3 实验结果与分析第42-48页
        3.3.1 网络构建的结果第42-44页
        3.3.2 基因网络/模块特征第44-46页
        3.3.3 基因本体论分析(Gene Ontology)第46-47页
        3.3.4 分类预测第47-48页
    3.4 小结第48-49页
第4章 基于网络模块的精神分裂症特征基因分析第49-59页
    4.1 引言第49-50页
    4.2 算法原理与实现第50-52页
        4.2.1 数据预处理第50页
        4.2.2 网络模块构建第50-52页
    4.3 实验结果与分析第52-58页
        4.3.1 网络构建结果第52-57页
        4.3.2 基因本体论分析第57-58页
    4.4 小结第58-59页
结论第59-61页
参考文献第61-67页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第67-68页
附录B 攻读硕士期间参加的科研项目第68-69页
致谢第69页

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