| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 缩略语索引 | 第7-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-17页 |
| 1.1 蜡样芽孢杆菌简介 | 第11-14页 |
| 1.1.1 蜡样芽孢杆菌的生物学特性 | 第11页 |
| 1.1.2 蜡样芽孢杆菌在蜡样芽孢杆菌群里的分类与地位 | 第11-12页 |
| 1.1.3 致病性蜡样芽孢杆菌 | 第12-13页 |
| 1.1.4 益生性蜡样芽孢杆菌 | 第13页 |
| 1.1.5 蜡样芽孢杆菌的益生性和致病性研究动态 | 第13-14页 |
| 1.2 微生物基因组学与PacBio RSⅡ三代测序技术 | 第14-15页 |
| 1.3 蛋白组学 | 第15页 |
| 1.4 生物信息学 | 第15-16页 |
| 1.5 本文研究意义与方法 | 第16-17页 |
| 第二章 三株蜡样芽孢杆菌的生物学特性研究 | 第17-26页 |
| 2.1 前言 | 第17-18页 |
| 2.2 实验材料 | 第18页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第18页 |
| 2.2.2 实验动物 | 第18页 |
| 2.2.3 主要试剂和仪器设备 | 第18页 |
| 2.2.4 培养基及相关溶液试剂的配置 | 第18页 |
| 2.3 实验方法 | 第18-21页 |
| 2.3.1 生长曲线的测定 | 第18页 |
| 2.3.2 API 50 CH生化试验 | 第18页 |
| 2.3.3 16种抗菌药的敏感性测定 | 第18-19页 |
| 2.3.4 溶血性与磷脂酶活性的检测 | 第19-20页 |
| 2.3.5 芽孢的收集培养和染色 | 第20页 |
| 2.3.6 小鼠急性毒性试验 | 第20页 |
| 2.3.7 革兰氏染色 | 第20-21页 |
| 2.3.8 PCR扩增 | 第21页 |
| 2.4 实验结果 | 第21-24页 |
| 2.4.1 三株蜡样芽孢杆菌与炭疽芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌的区分 | 第21页 |
| 2.4.2 三株蜡样芽孢杆菌生长曲线的测定 | 第21-22页 |
| 2.4.3 三株蜡样芽孢杆菌的糖代谢研究 | 第22-23页 |
| 2.4.4 三株蜡样芽孢杆菌的耐药性评价 | 第23页 |
| 2.4.5 三株蜡样芽孢杆菌的溶血性与磷脂酶活性 | 第23-24页 |
| 2.4.6 三株蜡样芽孢杆菌的安全性评价 | 第24页 |
| 2.5 结果与讨论 | 第24-26页 |
| 第三章 三株蜡样芽孢杆菌的基因组学与蛋白组学研究 | 第26-64页 |
| 3.1 前言 | 第26-27页 |
| 3.2 实验材料 | 第27页 |
| 3.2.1 实验菌株 | 第27页 |
| 3.2.2 主要试剂和仪器设备 | 第27页 |
| 3.2.3 培养基及相关溶液试剂的配置 | 第27页 |
| 3.3 实验方法 | 第27-31页 |
| 3.3.1 基因组数据的获得 | 第27-29页 |
| 3.3.2 蛋白组学数据的获得 | 第29-31页 |
| 3.4 结果与分析 | 第31-62页 |
| 3.4.1 全基因组的提取结果 | 第31-32页 |
| 3.4.2 三株蜡样芽孢杆菌的生长拐点的测定 | 第32页 |
| 3.4.3 蜡样芽孢杆菌P0021与P0011的基因组学与蛋白组学比较 | 第32-49页 |
| 3.4.4 蜡样芽孢杆菌HN001的基因组学与蛋白组学研究 | 第49-60页 |
| 3.4.5 三株蜡样芽孢杆菌毒力基因的分布情况 | 第60-62页 |
| 3.5 小结讨论 | 第62-64页 |
| 第四章 三株蜡样芽孢杆菌蔗糖代谢差异分析 | 第64-71页 |
| 4.1 前言 | 第64页 |
| 4.2 实验材料 | 第64-65页 |
| 4.2.1 菌株 | 第64页 |
| 4.2.2 主要试剂和仪器设备 | 第64-65页 |
| 4.2.3 培养基及相关溶液试剂的配置 | 第65页 |
| 4.3 实验方法 | 第65页 |
| 4.3.1 API 50CH生化试验 | 第65页 |
| 4.3.2 蔗糖生化鉴定 | 第65页 |
| 4.3.3 PCR扩增及反应条件 | 第65页 |
| 4.4 结果与分析 | 第65-70页 |
| 4.4.1 蔗糖代谢能力比较 | 第65-66页 |
| 4.4.2 蜡样芽孢杆菌蔗糖代谢通路的分析 | 第66-69页 |
| 4.4.3 果糖激酶(scrK)和β-呋喃果糖苷酶(scrB)基因的检测结果 | 第69-70页 |
| 4.5 小结讨论 | 第70-71页 |
| 第五章 结论与展望 | 第71-73页 |
| 5.1 结论 | 第71-72页 |
| 5.1.1 三株蜡样芽孢杆菌的鉴定与生物学特性比较 | 第71页 |
| 5.1.2 三株蜡样芽孢杆菌的基因组学与蛋白组学研究 | 第71页 |
| 5.1.3 蔗糖代谢差异分析和致病性探索 | 第71-72页 |
| 5.2 展望 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-79页 |
| 附录A 实验菌株 | 第79-80页 |
| 附录B 实验试剂 | 第80-81页 |
| 附录C 实验仪器设备 | 第81-82页 |
| 附录D 培养基及相关溶液试剂的配置 | 第82-83页 |
| 附录E 质粒pRML04具有功能描述的ORF | 第83-91页 |
| 附录F 质粒pRML05具有功能描述的ORF | 第91-99页 |
| 附录G 质粒pRML1具有功能描述的ORF | 第99-106页 |
| 附录H 质粒pRML2具有功能描述的ORF | 第106-108页 |
| 个人介绍 | 第108页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第108页 |
