摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
第一章 文献综述 | 第10-26页 |
第一节 生物入侵的危害和机制假说 | 第10-15页 |
一、生物入侵的定义 | 第10-11页 |
二、生物入侵的危害 | 第11-13页 |
三、生物入侵的机制假说 | 第13-15页 |
第二节 福寿螺入侵的现状和研究进展 | 第15-25页 |
一、福寿螺生态及遗传学研究进展 | 第15-17页 |
二、福寿螺入侵造成的危害 | 第17-19页 |
三、福寿螺的环境适应能力 | 第19-24页 |
四、福寿螺的组学研究现状 | 第24-25页 |
第三节 本研究的特色和研究意义 | 第25-26页 |
第二章 实验材料和方法 | 第26-38页 |
第一节 实验材料 | 第26-27页 |
一、实验涉及的动物 | 第26页 |
二、实验采用的主要仪器 | 第26-27页 |
第二节 实验方法 | 第27-38页 |
一、福寿螺刺激处理及样品的收集 | 第27-28页 |
二、福寿螺的DNA提取 | 第28-29页 |
三、福寿螺的DNA的建库和测序 | 第29页 |
四、福寿螺的基因组预估 | 第29-30页 |
五、福寿螺的基因组的组装 | 第30页 |
六、基因预测和功能注释 | 第30-31页 |
七、同源基因家族的鉴定和系统发生分析 | 第31-32页 |
八、福寿螺各组织总RNA提取 | 第32-34页 |
九、转录组建库和测序 | 第34页 |
十、转录组数据的处理 | 第34-35页 |
十一、加权互作网络分析(WGCNA,Weighted correlation networkanalysis) | 第35页 |
十二、肠道宏基因组数据的处理 | 第35-37页 |
十三、数据的统计处理 | 第37-38页 |
第三章 实验结果 | 第38-64页 |
第一节 福寿螺基因组的组装和注释 | 第38-47页 |
一、测序数据概要 | 第38页 |
二、福寿螺基因组的预估 | 第38-39页 |
三、福寿螺基因组的组装 | 第39-44页 |
四、福寿螺基因组的基因预测 | 第44-46页 |
五、福寿螺基因的功能注释 | 第46-47页 |
第二节 福寿螺的进化特征分析 | 第47-52页 |
一、福寿螺的直系同源家族基因分析 | 第47-48页 |
二、福寿螺与近源软体动物的系统发生分析 | 第48-49页 |
三、福寿螺的重复序列分析 | 第49-52页 |
第三节 以转录组为基础的功能组学分析 | 第52-61页 |
一、福寿螺转录组总述 | 第52-53页 |
二、福寿螺的细胞稳态系统 | 第53-56页 |
三、福寿螺的卵黄外周蛋白 | 第56-58页 |
四、福寿螺免疫系统 | 第58页 |
五、福寿螺应对压力的分子策略 | 第58-61页 |
第四节 福寿螺肠道宏基因组分析 | 第61-64页 |
第四章 讨论 | 第64-66页 |
参考文献 | 第66-72页 |