中文摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
中英文缩略词表 | 第7-11页 |
前言 | 第11-14页 |
实验研究 | 第14-55页 |
第一部分 艾灸“足三里”穴位局部全基因组DNA甲基化反应特征 | 第14-31页 |
1 实验材料 | 第14-15页 |
1.1 实验动物 | 第14页 |
1.2 实验仪器及耗材 | 第14页 |
1.3 .主要实验试剂 | 第14-15页 |
2 实验方法 | 第15-26页 |
2.1 实验分组 | 第15页 |
2.2 穴位选择 | 第15页 |
2.3 干预方法 | 第15页 |
2.4 取材 | 第15页 |
2.5 DNA的提取 | 第15-16页 |
2.6 建库及测序流程 | 第16-18页 |
2.6.1 DNA样本检测 | 第16页 |
2.6.2 文库的构建、质检及测序 | 第16-18页 |
2.7 测序数据质量评估 | 第18-21页 |
2.7.1 数据质量控制及原始数据Trimming | 第18-21页 |
2.8 参考序列比对分析 | 第21页 |
2.9 测序深度和覆盖度统计 | 第21-23页 |
2.9.1 基因组覆盖度深度统计 | 第21-23页 |
2.9.2 C位点的覆盖度统计 | 第23页 |
2.10 甲基化位点检测及分析 | 第23-25页 |
2.10.1 甲基化位点检测 | 第24页 |
2.10.2 甲基化序列类型比例统计 | 第24-25页 |
2.11 样本相关性分析 | 第25-26页 |
3 结果 | 第26-31页 |
3.1 DMR甲基化水平分析 | 第26-27页 |
3.2 比较组合甲基化水平分析 | 第27-29页 |
3.2.1 功能区域甲基化水平分析 | 第27-29页 |
3.2.2 基因上下游甲基化水平分析 | 第29页 |
3.3 DMR锚定区域分布 | 第29-31页 |
第二部分 艾灸“足三里”穴位局部全基因组DNA甲基化差异基因及信号通路 | 第31-55页 |
1 实验材料和方法 | 第31页 |
2 结果 | 第31-41页 |
2.1 DMR(differentially methylated regions)分析 | 第31-34页 |
2.2 DMR相关基因GO富集分析 | 第34-39页 |
2.3 DMR相关基因KEGG富集分析 | 第39-41页 |
3 DMR相关基因及信号通路的潜在研究价值 | 第41-55页 |
3.1 PINK1与艾灸改善能量代谢 | 第41-44页 |
3.2 APBB2与艾灸抗衰老作用 | 第44-45页 |
3.3 DPP4与艾灸调节内分泌功能作用 | 第45-46页 |
3.4 艾灸与免疫功能作用 | 第46-50页 |
3.5 HSPA12A与艾灸改善血液循环 | 第50-52页 |
3.6 PI3K与艾灸改善能量代谢及内分泌功能作用 | 第52-55页 |
讨论 | 第55-63页 |
1 传统中医理论对艾灸机理的认识 | 第55-56页 |
2 “足三里”穴位选择的依据 | 第56-57页 |
3 基因组DNA甲基化的生物学意义 | 第57-60页 |
4 艾灸“足三里”穴位局部DNA甲基化变化 | 第60-61页 |
5 艾灸“足三里”穴位局部全基因组DNA甲基化的价值和意义 | 第61-63页 |
结论 | 第63-64页 |
问题与展望 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-82页 |
附件一:综述 | 第82-94页 |
参考文献 | 第88-94页 |
附件二:攻读硕士研究生期间公开发表的学术论文、专著、科研成果 | 第94-95页 |