| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-23页 |
| 1.1 柑橘绿霉病害与防治 | 第12-13页 |
| 1.2 指状青霉耐药机制研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3 指状青霉耐药机制的组学分析 | 第14-15页 |
| 1.4 基于组学测序数据的指状青霉GSMM构建 | 第15-18页 |
| 1.4.1 GSMM的简要介绍 | 第15-16页 |
| 1.4.2 GSMM的构建和数据整合过程 | 第16-18页 |
| 1.4.3 基于流平衡分析的GSMM模拟 | 第18页 |
| 1.5 基于多组学数据整合的指状青霉耐药分析 | 第18-22页 |
| 1.5.1 以代谢模型为核心的多组学模型研究进展 | 第19-20页 |
| 1.5.2 GSMM基因表达数据整合算法 | 第20-21页 |
| 1.5.3 利用GSMM模拟微生物耐药的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 菌株与培养基实验设备 | 第23页 |
| 2.1.2 实验软件平台 | 第23-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-33页 |
| 2.2.1 实验材料处理及RNA提取 | 第25-26页 |
| 2.2.2 指状青霉代谢模型草图构建 | 第26-27页 |
| 2.2.3 指状青霉代谢模型的优化 | 第27-29页 |
| 2.2.4 基于相对基因表达量的代谢模型与表达数据整合 | 第29-30页 |
| 2.2.5 流平衡分析算法流程 | 第30-31页 |
| 2.2.6 指状青霉不同基因型和环境条件下的表型模拟 | 第31-33页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第33-41页 |
| 3.1 指状青霉全基因组代谢模型iPD1512构建 | 第33-35页 |
| 3.2 指状青霉野生型GSMM模拟分析 | 第35-37页 |
| 3.3 指状青霉基因缺失型GSMM模拟分析 | 第37-39页 |
| 3.4 指状青霉模拟基因敲除对的药物耐受的影响 | 第39-41页 |
| 第四章 讨论 | 第41-43页 |
| 第五章 小结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
