个人简历 | 第3-7页 |
中文摘要 | 第7-16页 |
ABSTRACT | 第16-26页 |
第一部分:TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌临床特征和预后的相关性及其甲基化在肝癌中的诊断价值 | 第27-91页 |
前言 | 第27-32页 |
1 材料与方法 | 第32-41页 |
1.1 实验试剂、实验耗材、实验仪器及常用实验溶液的配制 | 第32-34页 |
1.1.1 实验试剂 | 第32-33页 |
1.1.2 实验耗材 | 第33页 |
1.1.3 实验仪器 | 第33-34页 |
1.1.4 常用实验溶液的配制 | 第34页 |
1.2 研究对象 | 第34页 |
1.3 组织DNA的提取 | 第34-36页 |
1.4 肝癌中TM6SF1基因的甲基化检测 | 第36-39页 |
1.4.1 引物设计 | 第36页 |
1.4.2 亚硫酸盐处理 | 第36-37页 |
1.4.3 PCR扩增 | 第37-38页 |
1.4.4 SAP反应 | 第38页 |
1.4.5 产物检测 | 第38页 |
1.4.6 MassCLEAVE反应 | 第38-39页 |
1.4.7 树脂处理 | 第39页 |
1.4.8 质谱分析 | 第39页 |
1.5 肝癌中TM6SF1基因CNV检测 | 第39-41页 |
1.6 统计学分析 | 第41页 |
2 结果 | 第41-66页 |
2.1 入选样本的临床特征 | 第41-46页 |
2.1.1 入选TM6SF1基因甲基化检测的肝癌患者的临床特征 | 第41-43页 |
2.1.2 入选TM6SF1基因CNV检测的肝癌患者的临床特 | 第43-44页 |
2.1.3 共同入选TM6SF1基因甲基化检测和CNV检测的肝癌患者的临床特征 | 第44-46页 |
2.2 肝癌中TM6SF1基因甲基化位点、整体甲基化及显著甲基化位点判断 | 第46-52页 |
2.2.1 TM6SF1基因甲基化位点 | 第46-48页 |
2.2.2 肝癌组织及癌旁组织中TM6SF1基因整体甲基化分析 | 第48-50页 |
2.2.3 肝癌组织及癌旁组织中TM6SF1基因显著甲基化位点判断 | 第50-52页 |
2.3 TM6SF1基因显著甲基化肝癌患者的判断 | 第52-53页 |
2.4 肝癌中TM6SF1基因CNV检测及CNV缺失个体的判断 | 第53-55页 |
2.4.1 引物特异性及扩增效率检测 | 第53-54页 |
2.4.2 肝癌中TM6SF1基因CNV缺失个体的判断 | 第54-55页 |
2.5 TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌临床特征的相关性 | 第55-58页 |
2.5.1 TM6SF1基因甲基化与肝癌临床特征的相关性 | 第55-56页 |
2.5.2 TM6SF1基因CNV与肝癌临床特征的相关性 | 第56-57页 |
2.5.3 TM6SF1基因显著甲基化和CNV缺失共同与肝癌临床特征的相关性 | 第57-58页 |
2.6 TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌预后的相关性 | 第58-60页 |
2.6.1 TM6SF1基因甲基化与肝癌预后的相关性 | 第58-59页 |
2.6.2 TM6SF1基因CNV与肝癌预后的相关性 | 第59页 |
2.6.3 TM6SF1基因显著甲基化和CNV缺失共同与肝癌预后的相关性 | 第59-60页 |
2.7 TM6SF1基因甲基化在肝癌中的诊断 | 第60-66页 |
讨论 | 第66-80页 |
结论 | 第80-81页 |
参考文献 | 第81-91页 |
第二部分:TM6SF1基因转录与肝癌临床特征和预后的相关性 | 第91-107页 |
前言 | 第91-92页 |
1 材料与方法 | 第92-93页 |
1.1 研究对象 | 第92页 |
1.2 随访终点 | 第92页 |
1.3 统计学分析 | 第92-93页 |
2 结果 | 第93-98页 |
2.1 入选肝癌患者的临床特征 | 第93-94页 |
2.2 芯片数据的质量控制和标准化 | 第94-96页 |
2.3 TM6SF1基因转录水平与肝癌临床特征的相关性 | 第96-97页 |
2.4 TM6SF1基因转录水平与肝癌预后的相关性 | 第97-98页 |
讨论 | 第98-102页 |
结论 | 第102-103页 |
参考文献 | 第103-107页 |
附录一:中英文缩略词表 | 第107-109页 |
附录二:综述 | 第109-129页 |
参考文献 | 第122-129页 |
致谢 | 第129-130页 |
攻读博士期间发表的学术论文 | 第130页 |