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TM6SF1基因甲基化、CNV和转录与肝癌的相关性研究

个人简历第3-7页
中文摘要第7-16页
ABSTRACT第16-26页
第一部分:TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌临床特征和预后的相关性及其甲基化在肝癌中的诊断价值第27-91页
    前言第27-32页
    1 材料与方法第32-41页
        1.1 实验试剂、实验耗材、实验仪器及常用实验溶液的配制第32-34页
            1.1.1 实验试剂第32-33页
            1.1.2 实验耗材第33页
            1.1.3 实验仪器第33-34页
            1.1.4 常用实验溶液的配制第34页
        1.2 研究对象第34页
        1.3 组织DNA的提取第34-36页
        1.4 肝癌中TM6SF1基因的甲基化检测第36-39页
            1.4.1 引物设计第36页
            1.4.2 亚硫酸盐处理第36-37页
            1.4.3 PCR扩增第37-38页
            1.4.4 SAP反应第38页
            1.4.5 产物检测第38页
            1.4.6 MassCLEAVE反应第38-39页
            1.4.7 树脂处理第39页
            1.4.8 质谱分析第39页
        1.5 肝癌中TM6SF1基因CNV检测第39-41页
        1.6 统计学分析第41页
    2 结果第41-66页
        2.1 入选样本的临床特征第41-46页
            2.1.1 入选TM6SF1基因甲基化检测的肝癌患者的临床特征第41-43页
            2.1.2 入选TM6SF1基因CNV检测的肝癌患者的临床特第43-44页
            2.1.3 共同入选TM6SF1基因甲基化检测和CNV检测的肝癌患者的临床特征第44-46页
        2.2 肝癌中TM6SF1基因甲基化位点、整体甲基化及显著甲基化位点判断第46-52页
            2.2.1 TM6SF1基因甲基化位点第46-48页
            2.2.2 肝癌组织及癌旁组织中TM6SF1基因整体甲基化分析第48-50页
            2.2.3 肝癌组织及癌旁组织中TM6SF1基因显著甲基化位点判断第50-52页
        2.3 TM6SF1基因显著甲基化肝癌患者的判断第52-53页
        2.4 肝癌中TM6SF1基因CNV检测及CNV缺失个体的判断第53-55页
            2.4.1 引物特异性及扩增效率检测第53-54页
            2.4.2 肝癌中TM6SF1基因CNV缺失个体的判断第54-55页
        2.5 TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌临床特征的相关性第55-58页
            2.5.1 TM6SF1基因甲基化与肝癌临床特征的相关性第55-56页
            2.5.2 TM6SF1基因CNV与肝癌临床特征的相关性第56-57页
            2.5.3 TM6SF1基因显著甲基化和CNV缺失共同与肝癌临床特征的相关性第57-58页
        2.6 TM6SF1基因甲基化、CNV与肝癌预后的相关性第58-60页
            2.6.1 TM6SF1基因甲基化与肝癌预后的相关性第58-59页
            2.6.2 TM6SF1基因CNV与肝癌预后的相关性第59页
            2.6.3 TM6SF1基因显著甲基化和CNV缺失共同与肝癌预后的相关性第59-60页
        2.7 TM6SF1基因甲基化在肝癌中的诊断第60-66页
    讨论第66-80页
    结论第80-81页
    参考文献第81-91页
第二部分:TM6SF1基因转录与肝癌临床特征和预后的相关性第91-107页
    前言第91-92页
    1 材料与方法第92-93页
        1.1 研究对象第92页
        1.2 随访终点第92页
        1.3 统计学分析第92-93页
    2 结果第93-98页
        2.1 入选肝癌患者的临床特征第93-94页
        2.2 芯片数据的质量控制和标准化第94-96页
        2.3 TM6SF1基因转录水平与肝癌临床特征的相关性第96-97页
        2.4 TM6SF1基因转录水平与肝癌预后的相关性第97-98页
    讨论第98-102页
    结论第102-103页
    参考文献第103-107页
附录一:中英文缩略词表第107-109页
附录二:综述第109-129页
    参考文献第122-129页
致谢第129-130页
攻读博士期间发表的学术论文第130页

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