| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第9-16页 |
| 1.1 全基因组关联研究 | 第9-12页 |
| 1.1.1 试验设计 | 第10页 |
| 1.1.2 群体分层 | 第10-11页 |
| 1.1.3 GWAS的多重假设检验 | 第11页 |
| 1.1.4 全基因组关联研究在肉牛中的应用 | 第11-12页 |
| 1.2 荟萃分析 | 第12-13页 |
| 1.3 选择信号分析 | 第13-14页 |
| 1.4 研究的目的、意义 | 第14-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-21页 |
| 2.1 试验材料 | 第16页 |
| 2.1.1 资源群体构建 | 第16页 |
| 2.1.2 基因型数据获取 | 第16页 |
| 2.2 试验方法 | 第16-21页 |
| 2.2.1 肉质相关表型数据测定 | 第16-17页 |
| 2.2.2 基因型数据质量控制 | 第17页 |
| 2.2.3 群体分层分析 | 第17-19页 |
| 2.2.4 表型数据矫正 | 第19页 |
| 2.2.5 全基因组关联研究 | 第19页 |
| 2.2.6 两群体肉质性状荟萃分析 | 第19-20页 |
| 2.2.7 选择信号分析 | 第20页 |
| 2.2.8 基因注释和富集分析 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-48页 |
| 3.1 表型数据基本统计量 | 第21-22页 |
| 3.2 基因型数据质量控制 | 第22-23页 |
| 3.3 群体分层分布 | 第23-24页 |
| 3.4 单品种GWAS分析 | 第24-37页 |
| 3.4.1 西门塔尔牛群体GWAS分析 | 第24-30页 |
| 3.4.2 杂种和牛GWAS分析 | 第30-37页 |
| 3.5 两群体肉质性状荟萃分析 | 第37-42页 |
| 3.6 选择信号分析 | 第42-43页 |
| 3.7 基因富集分析 | 第43-48页 |
| 4 讨论 | 第48-54页 |
| 4.1 西门塔尔牛与杂种和牛 | 第48页 |
| 4.2 单群体GWAS与荟萃分析GWAS比较 | 第48页 |
| 4.3 全基因组关联研究、荟萃分析与选择信号候选基因 | 第48-53页 |
| 4.3.1 单群体GWAS分析与肉质性状相关的候选基因 | 第48-50页 |
| 4.3.2 荟萃分析与肉质性状相关的候选基因 | 第50-51页 |
| 4.3.3 选择信号分析与候选基因 | 第51-53页 |
| 4.4 基因CAST与KIT作用机理 | 第53-54页 |
| 5 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 在读期间发表论文 | 第62-63页 |
| 作者简历 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附件 | 第65-82页 |
| 详细摘要 | 第82-83页 |