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干旱胁迫下棉花转录组分析

摘要第3-5页
abstract第5-6页
缩略语表第7-13页
第一部分 文献综述第13-19页
    第一章 干旱对植物的影响第13-16页
        1.干旱对植物的危害第13-14页
            1.1 干旱抑制植物的生长、加快植株的衰老第13页
            1.2 干旱导致光合速率降低第13页
            1.3 干旱导致细胞原生质失水第13-14页
        2.植物对干旱的响应第14-16页
            2.1 植物形态结构对干旱的响应第14页
            2.2 植物膜系统对干旱的响应第14页
            2.3 信号转导过程对干旱的响应第14-15页
                2.3.1 干旱胁迫信号的感知第14页
                2.3.2 干旱胁迫信号的转导第14-15页
                2.3.3 植物通过干旱胁迫信号诱导基因进行表达第15页
            2.4 光合系统对干旱的响应第15页
            2.5 渗透调节系统对干旱的响应第15页
            2.6 抗氧化系统对干旱的响应第15-16页
    第二章 转录组测序研究进展第16-18页
        1.转录组测序第16-17页
        2.转录组水平的耐旱研究第17-18页
    第三章 本研究的目的、意义及拟解决的问题第18-19页
        1.本研究的目的和意义第18页
        2.拟解决的问题第18-19页
第二部分 实验部分第19-65页
    第一章 干旱胁迫下棉花转录组测序分析第19-32页
        1.材料与方法第21-23页
            1.1 实验材料第21页
            1.2 实验试剂第21页
            1.3 棉花幼苗干旱胁迫处理第21页
            1.4 cDNA文库的构建及转录组测序第21页
            1.5 转录组数据的分析第21-22页
            1.6 实时荧光定量PCR第22-23页
        2.结果与分析第23-30页
            2.1 转录组数据的分析第23-24页
            2.2 样品相关性分析第24-25页
            2.3 棉花转录组响应干旱的差异表达分析第25页
            2.4 干旱胁迫后棉花转录组差异表达基因的GO功能分类第25-26页
            2.5 干旱胁迫后棉花转录组差异表达基因的KEGG代谢通路分析第26-27页
            2.6 干旱胁迫后棉花转录组差异表达基因的热图分析第27-29页
            2.7 干旱胁迫后棉花转录组差异表达基因实时荧光定量PCR验证第29-30页
                2.7.1 棉花总RNA的提取、反转录第29页
                2.7.2 差异表达基因qRT-PCR验证第29-30页
        3.讨论第30-32页
    第二章 干旱胁迫下棉花转录组数据的深度挖掘第32-52页
        1.材料和方法第33-34页
            1.1 实验材料及试剂第33页
            1.2 实验方法第33-34页
                1.2.1 棉花总RNA的提取及cDNA的合成第33页
                1.2.2 棉花干旱转录本的深度挖掘第33页
                1.2.3 生物信息分析第33页
                1.2.4 实时荧光定量PCR第33-34页
        2.结果与分析第34-46页
            2.1 棉花干旱胁迫下转录组数据的深度挖掘第34-46页
                2.1.1 棉花干旱胁迫下光合作用通路分析第34-37页
                2.1.2 qRT-PCR验证光合作用通路差异表达基因第37-38页
                2.1.3 棉花干旱胁迫下DNA损伤修复途径分析第38-40页
                2.1.4 qRT-PCR验证DNA损伤修复通路差异表达基因第40-41页
                2.1.5 棉花干旱胁迫下转录因子调控分析第41-45页
                2.1.6 棉花干旱下渗透调节系统、活性氧清除系统第45-46页
        3.讨论第46-52页
            3.1 转录因子在棉花干旱胁迫下的变化第46-47页
            3.2 光合作用途径对棉花干旱胁迫的响应第47-48页
            3.3 DNA损伤修复途径对棉花干旱胁迫的响应第48-50页
            3.4 渗透调节和活性氧清除系统对棉花干旱胁迫的响应第50页
            3.5 棉花响应干旱胁迫的分子网络第50-52页
    第三章 棉花油质蛋白基因GhOleosin1的克隆和原核表达第52-65页
        1.材料与方法第53-56页
            1.1 实验材料第53-54页
            1.2 实验试剂第54页
            1.3 实验方法第54-56页
                1.3.1 GhOleosin1荧光定量分析第54页
                1.3.2 GhOleosin1ORF的扩增第54页
                1.3.3 GhOleosin1原核系统的构建第54-55页
                1.3.4 GhOleosin1生物信息学分析第55页
                1.3.5 重组蛋白的诱导表达第55-56页
        2.结果与分析第56-63页
            2.1 干旱诱导的GhOleosin1的相对表达分析第56-57页
                2.1.1 棉花干旱胁迫下转录组中GhOleosin1的相对表达分析第56页
                2.1.2 棉花干旱胁迫下转录组中GhOleosin1的相对表达分析第56-57页
            2.2 GhOleosin1ORF的扩增第57页
            2.3 原核表达载的构建第57-58页
            2.4 GhOleosin1的生物信息学分析第58-61页
                2.4.1 GhOleosin1理化性质分析第58页
                2.4.2 GhOleosin1保守结构域预测第58-59页
                2.4.3 GhOleosin1信号肽、跨膜结构域和三级结构的预测第59页
                2.4.4 GhOleosin1亚细胞定位预测分析第59-60页
                2.4.5 GhOleosin1亲疏水性预测分析第60页
                2.4.6 GhOleosin1启动子中的顺式作用原件分析第60-61页
            2.5 融合蛋白的诱导表达第61-63页
        3.讨论第63-65页
第三部分 结论与展望第65-66页
    结论第65页
    存在的问题和展望第65-66页
个人简历第66页
参与课题及发表文章第66-67页
参考文献第67-78页
致谢第78-79页

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