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西瓜噬酸菌效应蛋白Ace1功能研究及光照黑暗条件下致病性差异分析

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-24页
    1.1 瓜类细菌性果斑病研究概述第14-18页
        1.1.1 瓜类细菌性果斑病发生与为害第14-15页
        1.1.2 西瓜噬酸菌分类地位及病原生物学第15页
        1.1.3 发病症状及病害侵染循环第15-16页
        1.1.4 西瓜噬酸菌的遗传多样性第16页
        1.1.5 西瓜噬酸菌致病机理第16-17页
        1.1.6 瓜类细菌性果斑病的防治方法第17-18页
    1.2 植物与病原细菌互作机制研究进展第18-21页
        1.2.1 植物免疫系统概述第18-19页
        1.2.2 植物病原细菌T3SS调控T3Es的表达第19-20页
        1.2.3 植物病原细菌T3Es的鉴定方法第20页
        1.2.4 植物病原细菌T3Es抑制植物免疫反应第20-21页
        1.2.5 西瓜噬酸菌中T3Es研究进展第21页
    1.3 光与植物病原细菌致病性的关系第21-23页
        1.3.1 光对植物病原细菌及寄主抗性反应的影响第21-22页
        1.3.2 细菌中光受体蛋白研究进展第22页
        1.3.3 LOV蛋白研究进展第22-23页
    1.4 研究目的与意义第23-24页
        1.4.1 效应蛋白鉴定及功能分析第23页
        1.4.2 光调控西瓜噬酸菌致病性差异第23-24页
第二章 T3SS核心基因hrpG以及hrpX的功能分析第24-48页
    2.1 试验材料、试剂及仪器第24-27页
        2.1.1 供试菌株、质粒及培养条件第24-25页
        2.1.2 试验中所用到的培养基及溶液第25-27页
        2.1.3 试验中用到的试剂及仪器第27页
    2.2 试验方法第27-36页
        2.2.1 引物设计第27-29页
        2.2.2 细菌基因组DNA的提取第29-30页
        2.2.3 载体构建第30-32页
        2.2.4 筛选突变体菌株第32-33页
        2.2.5 互补菌株的构建第33页
        2.2.6 致病性测定及过敏性坏死反应测定第33-34页
        2.2.7 活性氧(ROS)测定第34页
        2.2.8 生物膜测定第34页
        2.2.9 目的基因转录水平表达测定第34-35页
        2.2.10 启动子活性测定第35页
        2.2.11 Westernblot试验第35-36页
        2.2.12 统计分析第36页
    2.3 结果与分析第36-45页
        2.3.1 西瓜噬酸菌Aac5菌株中hrpG以及hrpX基因同源性分析第36-37页
        2.3.2 西瓜噬酸菌Aac5中hrpG以及hrpX缺失突变体的构建第37-39页
        2.3.3 西瓜噬酸菌Aac5中hrpG以及hrpX互补菌株的构建第39页
        2.3.4 hrpG以及hrpX负调控西瓜噬酸菌生物膜的形成第39-40页
        2.3.5 hrpG以及hrpX正调控西瓜噬酸菌诱导非寄主HR能力第40-41页
        2.3.6 hrpG以及hrpX负调控西瓜噬酸菌诱导寄主ROS爆发能力第41-42页
        2.3.7 hrpG以及hrpX正调控西瓜噬酸菌致病性第42-43页
        2.3.8 hrpG为hrpX上游调控因子第43-44页
        2.3.9 hrpG以及hrpX调控T3Es的表达第44-45页
    2.4 讨论第45-48页
第三章 西瓜噬酸菌中候选T3Es的筛选第48-58页
    3.1 材料与方法第48-49页
        3.1.1 供试菌株、质粒及培养条件第48-49页
        3.1.2 试验中所用到的培养基及溶液第49页
        3.1.3 试验中用到的试剂及仪器第49页
    3.2 试验方法第49-53页
        3.2.1 引物设计第49-52页
        3.2.2 转录组测定及分析过程第52页
        3.2.3 生物信息学预测分析T3Es第52页
        3.2.4 Ace1与PCD激发子共表达试验第52-53页
        3.2.5 定量PCR分析基因表达量变化第53页
    3.3 结果与分析第53-57页
        3.3.1 转录组差异基因分析第53-54页
        3.3.2 转录组差异基因与生物信息学关联分析预测T3Es第54-55页
        3.3.3 候选效应蛋白抑制Bax诱导的PCD能力第55-57页
    3.4 讨论第57-58页
第四章 候选效应蛋白Ace1的鉴定及功能分析第58-71页
    4.1 材料与方法第58页
        4.1.1 供试菌株、质粒及培养条件第58页
        4.1.2 试验中所用到的培养基及溶液第58页
        4.1.3 试验中用到的试剂及仪器第58页
    4.2 试验方法第58-61页
        4.2.1 引物设计第58-59页
        4.2.2 生物信息学分析第59页
        4.2.3 ace1基因敲除及互补菌株构建第59页
        4.2.4 西瓜噬酸菌在寄主体内生长能力测定第59-60页
        4.2.5 ROS测定试验第60页
        4.2.6 胼胝质沉积测定试验第60页
        4.2.7 蛋白亚细胞定位试验第60页
        4.2.8 Ace1抑制AvrPto诱导PCD能力试验第60-61页
        4.2.9 IP试验及质谱分析第61页
        4.2.10 luc双分子荧光试验第61页
    4.3 结果与分析第61-69页
        4.3.1 Ace1的克隆及生物信息学分析第61-62页
        4.3.2 Ace1为T3SS分泌的效应蛋白第62-63页
        4.3.3 T3SS中核心基因hrpG及hrpX调控ace1的表达第63-64页
        4.3.4 ace1缺失突变株以及互补菌株的构建第64-65页
        4.3.5 Ace1正调控西瓜噬酸菌致病能力第65-66页
        4.3.6 Ace1在本氏烟中定位于整个细胞第66-67页
        4.3.7 Ace1抑制寄主中ROS爆发第67页
        4.3.8 Ace1抑制寄主中胼胝质的沉积能力第67-68页
        4.3.9 Ace1抑制AvrPto诱导的PCD反应第68-69页
        4.3.10 Ace1与ACAT1互作关系验证第69页
    4.4 讨论第69-71页
第五章 光照及黑暗条件对西瓜噬酸菌致病性的差异研究第71-83页
    5.1 材料与方法第71-72页
        5.1.1 供试菌株、质粒及培养条件第71页
        5.1.2 培养基及溶液第71-72页
        5.1.3 试验中所用到的试剂及仪器第72页
    5.2 试验方法第72-74页
        5.2.1 引物设计第72页
        5.2.2 光照以及黑暗条件下运动性测定第72-73页
        5.2.3 光照以及黑暗条件下生物膜测定第73页
        5.2.4 突变体的构建及互补菌株的构建第73页
        5.2.5 光照以及黑暗条件下ROS测定第73页
        5.2.6 光照以及黑暗条件下胼胝质测定第73页
        5.2.7 光照以及黑暗条件下菌落形态观察第73页
        5.2.8 目的基因转录水平检测第73页
        5.2.9 致病性测定第73-74页
    5.3 结果与分析第74-81页
        5.3.1 光照抑制西瓜噬酸菌运动性第74页
        5.3.2 光照抑制西瓜噬酸菌生物膜形成第74-75页
        5.3.3 光照及黑暗条件下西瓜噬酸菌菌落形态存在差异第75页
        5.3.4 光照促进寄主响应西瓜噬酸菌后胼胝质沉积第75-76页
        5.3.5 光照促进寄主响应西瓜噬酸菌后ROS爆发第76-77页
        5.3.6 光照抑制西瓜噬酸菌T3SS的表达第77-78页
        5.3.7 光照抑制西瓜噬酸菌对本氏烟的致病能力第78页
        5.3.8 lov在光照条件下抑制西瓜噬酸菌的运动能力第78-79页
        5.3.9 lov对西瓜噬酸菌致病能力无显著影响第79-80页
        5.3.10 光照及黑暗条件下西瓜噬酸菌蛋白组差异分析第80页
        5.3.11 黑暗条件诱导潜在III型效应蛋白Ace4的表达第80-81页
    5.4 讨论第81-83页
第六章 结论与展望第83-85页
    6.1 结论第83-84页
    6.2 展望第84-85页
参考文献第85-96页
致谢第96-97页
作者简介第97页

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