| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-26页 |
| 1.1 大豆疫病概况 | 第13-14页 |
| 1.1.1 大豆疫病发生与危害 | 第13页 |
| 1.1.2 大豆疫病病原 | 第13页 |
| 1.1.3 大豆疫病症状 | 第13-14页 |
| 1.1.4 大豆疫霉毒力的变异 | 第14页 |
| 1.1.5 大豆疫霉根腐病的防治 | 第14页 |
| 1.2 大豆抗疫病研究 | 第14-20页 |
| 1.2.1 质量抗性与数量抗性 | 第14-15页 |
| 1.2.2 大豆抗性资源的鉴定和发掘 | 第15-17页 |
| 1.2.3 大豆抗疫病基因的鉴定和作图 | 第17-20页 |
| 1.3 大豆抗疫病基因发掘方法 | 第20-24页 |
| 1.3.1 传统抗疫病基因的发掘和定位 | 第20-21页 |
| 1.3.2 QTL-seq方法 | 第21-24页 |
| 1.4 大豆抗疫霉根腐病候选基因的鉴定和克隆 | 第24-25页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 大豆抗疫病新基因RpsHC18的候选基因鉴定及特异性标记的开发 | 第26-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-33页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第26页 |
| 2.1.2 大豆疫霉分离物 | 第26-27页 |
| 2.1.3 抗性鉴定方法 | 第27-28页 |
| 2.1.4 二代混池测序文库的构建及Illumina测序 | 第28-29页 |
| 2.1.5 SNP-index的计算和QTL-seq分析 | 第29页 |
| 2.1.6 传连锁图谱的构建以及候选基因的发掘 | 第29-30页 |
| 2.1.7 基于候选基因特异性标记的开发和验证 | 第30-32页 |
| 2.1.8 候选基因的差异表达量分析 | 第32-33页 |
| 2.2 结果与分析 | 第33-48页 |
| 2.2.1 抗大豆疫病表型鉴定 | 第33-34页 |
| 2.2.2 亲本和抗、感池重测序数据分析 | 第34页 |
| 2.2.3 SNP-index分析以及RpsHC18抗病候选区域的鉴定 | 第34页 |
| 2.2.4 RpsHC18抗疫病候选区域的验证及精细定位 | 第34-40页 |
| 2.2.5 RpsHC18候选基因中非同义突变SNPs(nsSNP)及单倍型分析 | 第40-42页 |
| 2.2.6 RpsHC18特异性标记的开发 | 第42-48页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第48-51页 |
| 第三章 大豆抗疫病新基因RPSZS18的精细定位和候选基因分析 | 第51-70页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第52页 |
| 3.1.2 大豆疫霉分离物 | 第52页 |
| 3.1.3 抗性鉴定 | 第52页 |
| 3.1.4 大豆品种全基因组重测序 | 第52-53页 |
| 3.1.5 InDel标记精细定位RpsZS18 | 第53页 |
| 3.1.6 RpsZS18抗病性关联突变的鉴定以及候选基因的预测 | 第53页 |
| 3.1.7 候选基因的差异表达分析 | 第53-54页 |
| 3.2 结果与分析 | 第54-67页 |
| 3.2.1 表型鉴定 | 第54-58页 |
| 3.2.2 定位区间内的InDel开发和重组位点鉴定 | 第58页 |
| 3.2.3 RpsZS18候选基因单倍型分析 | 第58-63页 |
| 3.2.4 RpsZS18候选基因差异表达分析 | 第63-67页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第67-70页 |
| 第四章 大豆抗疫病基因RPSYD25精细作图及候选基因鉴定 | 第70-86页 |
| 4.1 材料与方法 | 第71-73页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第71页 |
| 4.1.2 抗性表型鉴定 | 第71-72页 |
| 4.1.3 植物DNA的提取 | 第72页 |
| 4.1.4 SSR分析及遗传连锁图谱的构建 | 第72页 |
| 4.1.5 定位区间内重组事件的鉴定及候选基因的发掘 | 第72页 |
| 4.1.6 RpsYD25共分离标记在不同大豆品种之间的有效性检测 | 第72-73页 |
| 4.2 结果与分析 | 第73-83页 |
| 4.2.1 表型鉴定及抗性遗传分析 | 第73页 |
| 4.2.2 RpsYD25遗传连锁图谱的构建 | 第73-77页 |
| 4.2.3 RpsYD25初定位区间重组家系的筛选和鉴定 | 第77-78页 |
| 4.2.4 RpsYD25共分离标记的鉴定 | 第78-83页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第83-86页 |
| 第五章 全文结论 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 作者简历 | 第101页 |
