| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第14-26页 |
| 1.1 保护遗传学 | 第14-22页 |
| 1.1.1 保护遗传学的诞生与发展 | 第14页 |
| 1.1.2 保护遗传学的研究内容 | 第14-15页 |
| 1.1.3 影响物种遗传多样性水平和遗传结构的因素 | 第15-19页 |
| 1.1.4 分子标记在保护遗传学中的应用 | 第19-22页 |
| 1.2 东亚植物区系 | 第22页 |
| 1.3 八角莲属的生物学特性及药用价值 | 第22-23页 |
| 1.4 八角莲属保护遗传学研究的现状及存在的问题 | 第23-25页 |
| 1.5 本研究的内容、目的和意义 | 第25-26页 |
| 1.5.1 本研究的内容和目的 | 第25页 |
| 1.5.2 本研究的意义 | 第25-26页 |
| 2 EST-SSR开发 | 第26-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 植物材料和基因组DNA提取 | 第26页 |
| 2.1.2 从转录组序列中鉴别EST-SSR并设计引物 | 第26-28页 |
| 2.1.3 PCR条件和微卫星分离 | 第28-29页 |
| 2.1.4 多态性检测 | 第29页 |
| 2.1.5 通用性检测 | 第29-30页 |
| 2.1.6 中性检验 | 第30页 |
| 2.2 结果 | 第30-40页 |
| 2.2.1 八角莲转录组数据组装 | 第30-31页 |
| 2.2.2 转录组中EST-SSR的频率和分布 | 第31-33页 |
| 2.2.3 EST-SSR引物开发与种间通用性 | 第33-35页 |
| 2.2.4 EST-SSR位点的中性检验 | 第35-40页 |
| 3 八角莲属居群遗传多样性和遗传结构分析 | 第40-52页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-41页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第40页 |
| 3.1.2 计算八角莲属物种各居群遗传多样性和近交程度 | 第40页 |
| 3.1.3 八角莲属物种间遗传结构分析 | 第40页 |
| 3.1.4 评估物种内居群间遗传结构 | 第40-41页 |
| 3.2 结果 | 第41-52页 |
| 3.2.1 八角莲属物种各居群遗传多样性 | 第41-43页 |
| 3.2.2 八角莲属物种间的遗传结构 | 第43-47页 |
| 3.2.3 八角莲属物种内居群间遗传结构 | 第47-52页 |
| 4 八角莲属居群间基因流和居群动态历史 | 第52-65页 |
| 4.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第52页 |
| 4.1.2 评估当代和历史基因流 | 第52-53页 |
| 4.1.3 分析居群动态历史变化 | 第53-54页 |
| 4.2 结果 | 第54-65页 |
| 4.2.1 当代和历史基因流 | 第54-59页 |
| 4.2.2 居群动态历史 | 第59-65页 |
| 5 解析距离隔离(IBD)与环境隔离(IBE)对基因流影响 | 第65-72页 |
| 5.1 材料与方法 | 第65-66页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第65页 |
| 5.1.2 评估地理距离隔离(IBD)和环境隔离(IBE)对遗传分化的影响 | 第65-66页 |
| 5.2 结果 | 第66-72页 |
| 5.2.1 各物种/支系内居群间的基因流隔离模型：IBD和IBE | 第66-69页 |
| 5.2.2 物种间的基因流隔离模型：IBD和IBE | 第69-72页 |
| 6 讨论 | 第72-80页 |
| 6.1 开发属内通用EST-SSR | 第72-73页 |
| 6.1.1 EST-SSR在八角莲转录组中的频率和分布 | 第72-73页 |
| 6.1.2 EST-SSR具有较高的多态性和种间通用性 | 第73页 |
| 6.2 八角莲属的遗传多样性、近交系数和遗传结构 | 第73-76页 |
| 6.2.1 近交系数 | 第73-74页 |
| 6.2.2 居群内遗传多样性 | 第74页 |
| 6.2.3 八角莲属物种间的遗传结构 | 第74-75页 |
| 6.2.4 八角莲属各物种/支系内居群间的遗传分化 | 第75-76页 |
| 6.3 各物种/支系内居群间基因流和居群动态历史 | 第76-77页 |
| 6.3.1 居群间的基因流 | 第76-77页 |
| 6.3.2 气候波动和人类活动共同导致了居群动态变化 | 第77页 |
| 6.4 影响八角莲属的遗传分化的因素——IBD和IBE | 第77-78页 |
| 6.4.1 各物种/支系内居群间具有不同的隔离模式 | 第77-78页 |
| 6.4.2 环境隔离促进六角莲成种 | 第78页 |
| 6.5 对八角莲属物种保护的建议 | 第78-80页 |
| 6.5.1 八角莲属各物种/支系内各ESU的迁地保护建议 | 第78-79页 |
| 6.5.2 八角莲属物种/支系内的就地保护建议 | 第79-80页 |
| 7 总结与展望 | 第80-83页 |
| 7.1 总结 | 第80-81页 |
| 7.2 展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-98页 |
| 在读期间发表的论文 | 第98页 |
