| 致谢 | 第4-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| 英文缩略词 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-28页 |
| 1.1 我国主要多胎绵羊品种 | 第12-14页 |
| 1.1.1 湖羊 | 第12页 |
| 1.1.2 小尾寒羊 | 第12-13页 |
| 1.1.3 杜泊羊 | 第13-14页 |
| 1.2 绵羊繁殖力及其候选基因 | 第14页 |
| 1.3 绵羊多胎性状候选基因的遗传变异研究 | 第14-25页 |
| 1.3.1 BMPR-1B基因 | 第15页 |
| 1.3.2 BMP15基因 | 第15-17页 |
| 1.3.3 BMP4基因 | 第17页 |
| 1.3.4 GDF9基因 | 第17-18页 |
| 1.3.5 ESR基因 | 第18-19页 |
| 1.3.6 RBP4基因 | 第19-20页 |
| 1.3.7 IGF基因 | 第20页 |
| 1.3.8 PRL、PRLR基因 | 第20-21页 |
| 1.3.9 PGR基因 | 第21页 |
| 1.3.10 FSH-β 基因 | 第21页 |
| 1.3.11 RXRG基因 | 第21-22页 |
| 1.3.12 MTNR1A基因 | 第22页 |
| 1.3.13 Lacaune基因-B4GALNT2 | 第22-24页 |
| 1.3.14 ZAR1基因 | 第24-25页 |
| 1.4 影响绵羊繁殖力主效基因互作与基因聚合 | 第25-27页 |
| 1.4.1 主效基因互作 | 第25页 |
| 1.4.2 基因聚合 | 第25-27页 |
| 1.4.2.1 基因聚合的概念 | 第26页 |
| 1.4.2.2 动物多基因聚合研究进展 | 第26-27页 |
| 1.5 本研究总体目标 | 第27-28页 |
| 2 引言 | 第28-29页 |
| 3 试验一绵羊B4GALNT2和Zar1基因遗传变异分析 | 第29-44页 |
| 3.1 试验材料 | 第29-31页 |
| 3.1.1 试验动物及样品采集 | 第29页 |
| 3.1.1.1 所选试验动物 | 第29页 |
| 3.1.1.2 样品的采集 | 第29页 |
| 3.1.2 试验仪器设备 | 第29-30页 |
| 3.1.3 试验试剂 | 第30页 |
| 3.1.4 溶液配制 | 第30页 |
| 3.1.5 分析工具 | 第30-31页 |
| 3.2 试验方法 | 第31-37页 |
| 3.2.1 绵羊血液基因组DNA的提取与检测 | 第31页 |
| 3.2.1.1 DNA样本的纯度与浓度检测 | 第31页 |
| 3.2.1.2 DNA样本质量的定性检测 | 第31页 |
| 3.2.2 DNA混合池的构建 | 第31页 |
| 3.2.3 引物设计 | 第31-34页 |
| 3.2.3.1 绵羊B4GALNT2基因筛选和鉴定 | 第31-33页 |
| 3.2.3.2 绵羊Zar1基因筛选和鉴定 | 第33-34页 |
| 3.2.4 引物稀释及注意事项 | 第34-35页 |
| 3.2.4.1 引物稀释 | 第34页 |
| 3.2.4.2 注意事项 | 第34-35页 |
| 3.2.5 PCR扩增、检测及测序 | 第35-36页 |
| 3.2.5.1 PCR扩增 | 第35页 |
| 3.2.5.2 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第35页 |
| 3.2.5.3 PCR产物纯化 | 第35-36页 |
| 3.2.5.4 测序筛选突变位点 | 第36页 |
| 3.2.6 Sequenom Mass Array基因分型 | 第36-37页 |
| 3.2.7 体尺性状测量 | 第37页 |
| 3.2.8 统计分析 | 第37页 |
| 3.2.8.1 体型指数 | 第37页 |
| 3.2.8.2 变异位点与繁殖性状关联分析 | 第37页 |
| 3.3 结果与分析 | 第37-41页 |
| 3.3.1 血液DNA提取结果与分析 | 第37-38页 |
| 3.3.2 绵羊B4GALNT2基因变异位点的筛选 | 第38-39页 |
| 3.3.2.1 小尾寒羊和湖羊T28075A变异位点鉴定 | 第38-39页 |
| 3.3.2.2 绵羊B4GALNT2全基因组变异扫描分析 | 第39页 |
| 3.3.3 绵羊Zar1基因变异位点的筛选和鉴定 | 第39-41页 |
| 3.3.3.1 Zar1基因变异位点的筛选 | 第39页 |
| 3.3.3.2 Zar1基因变异位点的遗传变异分析 | 第39-41页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第41-44页 |
| 3.4.1 基因多态性与筛选多态位点的方法 | 第41页 |
| 3.4.1.1 基因多态性 | 第41页 |
| 3.4.1.2 筛选多态位点的方法 | 第41页 |
| 3.4.2 B4GALNT2基因遗传多态性 | 第41-42页 |
| 3.4.3 Zar1基因遗传多态性分析 | 第42-43页 |
| 3.4.3.1 Zar1基因群体遗传变异 | 第42页 |
| 3.4.3.2 Zar1基因与绵羊生产性状关联分析 | 第42-43页 |
| 3.4.4 小结 | 第43-44页 |
| 4 试验二17个候选基因中重要SNP对绵羊产羔数单基因效应分析 | 第44-57页 |
| 4.1 试验材料 | 第44页 |
| 4.2 试验内容和方法 | 第44-48页 |
| 4.2.1 候选基因和变异位点的选择 | 第44-46页 |
| 4.2.2 基因型分型方法 | 第46页 |
| 4.2.2.1 BMPR-IB基因Fec B突变基因型PCR-RFLP分析 | 第46页 |
| 4.2.2.2 其它候选基因重要位点的Sequenom Mass Array基因分型 | 第46页 |
| 4.2.3 群体遗传学分析 | 第46-48页 |
| 4.2.3.1 各变异位点遗传多态性分析 | 第46-48页 |
| 4.3 结果与分析 | 第48-54页 |
| 4.3.1 BMPR-IB基因Fec B突变基因分型 | 第48页 |
| 4.3.1.1 PCR扩增 | 第48页 |
| 4.3.1.2 AvaⅡ酶切及酶切产物电泳结果 | 第48页 |
| 4.3.2 各候选基因重要变异位点的群体遗传分析 | 第48-52页 |
| 4.3.2.1 Fec B(A746G)位点遗传变异分析 | 第49页 |
| 4.3.2.2 MTNR1A(G605A)位点遗传变异分析 | 第49-50页 |
| 4.3.2.3 GDF9(G477A)位点遗传变异分析 | 第50页 |
| 4.3.2.4 BMP4(C305A)位点遗传变异分析 | 第50页 |
| 4.3.2.5 ESR(C363G)位点遗传变异分析 | 第50-51页 |
| 4.3.2.6 IGF-1(G4988A)位点遗传变异分析 | 第51页 |
| 4.3.2.7 PGR(C70T)位点遗传变异分析 | 第51页 |
| 4.3.2.8 PRLR(G304A)位点遗传变异分析 | 第51-52页 |
| 4.3.3 各候选基因重要变异位点与产羔数的关联性分析 | 第52-53页 |
| 4.3.3.1 湖羊群体中重要SNP单独效应分析 | 第52页 |
| 4.3.3.2 小尾寒羊重要SNP单独效应分析 | 第52-53页 |
| 4.3.4 合并群体重要SNP单独效应分析 | 第53-54页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第54-57页 |
| 4.4.1 BMPR-IB与绵羊产羔数单基因效应分析 | 第54页 |
| 4.4.2 小尾寒羊MTNR1A(G605A)基因位点的多态性及其与产羔数关联性 | 第54-55页 |
| 4.4.2.1 小尾寒羊MTNR1A(G605A)基因位点的多态性 | 第54页 |
| 4.4.2.2 小尾寒羊MTNR1A(G605A)位点与产羔性状关联分析 | 第54-55页 |
| 4.4.3 湖羊GDF9(G477A)基因位点的多态性及其与产羔数的关联性 | 第55页 |
| 4.4.3.1 湖羊GDF9(G477A)基因位点的多态性 | 第55页 |
| 4.4.3.2 湖羊GDF9(G477A)位点与产羔性状关联性 | 第55页 |
| 4.4.4 合并群体重要SNP单基因效应分析 | 第55页 |
| 4.4.5 其它位点遗传变异分析 | 第55-56页 |
| 4.4.6 小结 | 第56-57页 |
| 4.4.6.1 对三个试验群体20个SNP位点分型结果 | 第56页 |
| 4.4.6.2 试验群体单基因效应分析 | 第56-57页 |
| 5 试验三17个候选基因中重要SNP对绵羊产羔数的互作效应分析 | 第57-64页 |
| 5.1 材料与方法 | 第57页 |
| 5.2 试验数据统计分析 | 第57-58页 |
| 5.2.1 多基因互作效应分析模型 | 第57页 |
| 5.2.2 数据分析步骤 | 第57-58页 |
| 5.3 结果与分析 | 第58-61页 |
| 5.3.1 湖羊群体重要SNP互作效应分析 | 第58-59页 |
| 5.3.1.1 GDF9(G477A)和ESR(C363G)基因互作效应 | 第58-59页 |
| 5.3.1.2 Fec B(A746G)和ESR(C363G)基因互作效应 | 第59页 |
| 5.3.2 小尾寒羊群体重要SNP互作效应分析 | 第59-60页 |
| 5.3.2.1 PGR(C70T)和MTNR1A(G605A)基因互作效应 | 第59-60页 |
| 5.3.2.2 PGR(C70T)和PRLR(G304A)基因互作效应 | 第60页 |
| 5.3.3 合并群体重要SNP互作效应分析 | 第60-61页 |
| 5.3.3.1 GDF9(G477A)和IGF-1(G49888A)基因互作效应 | 第60-61页 |
| 5.4 讨论与小结 | 第61-64页 |
| 5.4.1 多标记的遗传效应 | 第61页 |
| 5.4.2 湖羊群体重要SNP互作效应分析 | 第61-62页 |
| 5.4.2.1 GDF9(G477A)和ESR(C363G)两个基因合并基因型的遗传效应 | 第61-62页 |
| 5.4.2.2 Fec B(A746G)和ESR(C363G)两个基因合并基因型的遗传效应 | 第62页 |
| 5.4.3 小尾寒羊群体重要SNP互作效应分析 | 第62页 |
| 5.4.4 合并群体GDF9(G477A)和IGF-1(G49888A)基因合并基因型遗传效应 | 第62页 |
| 5.4.5 绵羊基因聚合育种的探讨 | 第62-63页 |
| 5.4.5.1 拟聚合基因的选择 | 第63页 |
| 5.4.5.2 基因的遗传效应 | 第63页 |
| 5.4.5.3 样本含量 | 第63页 |
| 5.4.6 小结 | 第63-64页 |
| 6 试验四17个候选基因中重要SNP与母羊体重性状关联分析 | 第64-69页 |
| 6.1 试验材料 | 第64页 |
| 6.2 试验统计方法 | 第64-65页 |
| 6.2.1 产羔数与体重性状统计分析 | 第64页 |
| 6.2.2 Pearson相关系数 | 第64-65页 |
| 6.3 结果与分析 | 第65-67页 |
| 6.3.1 试验群体基本体尺性状统计分析 | 第65-66页 |
| 6.3.2 重要SNP位点与绵羊产羔性状和体重关联分析 | 第66-67页 |
| 6.3.2.1 重要SNP与小尾寒羊产羔性状和体重关联分析 | 第66-67页 |
| 6.3.2.2 重要SNP与湖羊产羔性状和体重关联分析 | 第67页 |
| 6.4 讨论与小结 | 第67-69页 |
| 6.4.1 试验总群体基本体型性状统计分析 | 第67-68页 |
| 6.4.2 重要SNP与绵羊体重性状关联分析 | 第68页 |
| 6.4.3 小结 | 第68-69页 |
| 7 全文结论及下一步工作计划 | 第69-71页 |
| 7.1 结论 | 第69-70页 |
| 7.2 下一步工作计划 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-80页 |
| ABSTRACT | 第80-83页 |
