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油茶炭疽病菌群体遗传及MAPK基因CfPMK1功能研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 绪论第13-23页
    1 油茶第13页
    2 油茶炭疽病第13-15页
        2.1 炭疽病症状第13页
        2.2 病原及初侵染源第13-14页
        2.3 发病规律第14-15页
        2.4 病菌侵染特性及发病影响因素第15页
    3 炭疽真菌属的建立及分类第15-17页
        3.1 属的建立及形态分类第15-16页
        3.2 分子分类第16页
        3.3 寄主范围第16-17页
        3.4 繁殖方式第17页
    4 植物病原物的群体遗传研究第17-19页
        4.1 遗传多样性第17-18页
        4.2 群体遗传分化第18页
        4.3 基因流第18页
        4.4 基因重组第18-19页
    5 植物病原菌基因功能研究第19-21页
        5.1 植物病原真菌基因组测序第19-20页
        5.2 植物病原真菌中MAPK信号网络级联通路第20-21页
    6 选题背景、意义和主要研究内容第21-23页
        6.1 选题背景、意义第21-22页
        6.2 主要研究内容第22页
        6.3 技术路线第22-23页
第二章 中国油茶炭疽病原鉴定第23-39页
    1 材料与方法第23-25页
        1.1 样品采集及病原菌的分离第23页
        1.2 致病性测定第23-24页
        1.3 病菌形态学及产孢第24页
        1.4 菌株DNA提取、基因选择、PCR扩增及测序第24-25页
        1.5 系统发育学分析第25页
    2 结果第25-37页
        2.1 病原菌分离及致病性测定第25-26页
        2.2 系统发育学分析第26-30页
        2.3 油茶炭疽病菌形态学特征第30-36页
        2.4 5种已知炭疽病菌生长速度及分生孢子产生率比较第36-37页
    3 讨论第37-38页
    4 小结第38-39页
第三章 油茶果生炭疽菌群体遗传学分析第39-64页
    1 材料与方法第41-47页
        1.1 菌株分离及柯赫氏法则验证第41-42页
        1.2 多位点序列分型第42-44页
        1.3 菌株鉴定第44页
        1.4 核酸序列多态性及遗传多样性第44-45页
        1.5 繁殖方式第45-46页
        1.6 地理群体之间的关系第46-47页
    2 结果与分析第47-58页
        2.1 菌株分离、致病性和测序第47-48页
        2.2 系统发育种鉴别第48页
        2.3 C. fructicola基因座内和基因座间的遗传变异第48-50页
        2.4 C. fructicola地理种群内和种群间的遗传变异第50-53页
        2.5 无性繁殖与基因重组第53-54页
        2.6 地里种群间的相互关系第54-58页
    3 讨论第58-62页
        3.1 物种分布第59页
        3.2 C. fructicola的遗传变异与繁殖模式第59-60页
        3.3 地理群体之间的遗传变异第60-62页
    4 小结第62-64页
第四章 油茶及其它寄主植物果生炭疽菌群体遗传学分析第64-77页
    1 材料与方法第64-67页
        1.1 材料第64-66页
        1.2 基因选择及PCR扩增第66页
        1.3 测序第66页
        1.4 数据分析第66-67页
    2 结果与分析第67-74页
        2.1 果生炭疽菌的单倍型分布及其多样性第67-69页
        2.2 单倍型网络及种群扩张分析第69-70页
        2.3 病菌分子变异分析第70-71页
        2.4 不同种群果生炭疽菌遗传分化与基因流第71-72页
        2.5 果生炭疽菌的遗传重组第72-73页
        2.6 基于3基因序列的系统发育树分析第73-74页
    3 讨论第74-76页
    4 小结第76-77页
第五章 油茶果生炭疽菌CfPMK1基因功能研究第77-94页
    1 材料与方法第77-82页
        1.1 供试菌株第77页
        1.2 野生型菌株CFLH16全基因组测序第77页
        1.3 生物信息分析第77-78页
        1.4 CfPmk1蛋白结构域及系统发育树分析第78-79页
        1.5 CfPMK1基因敲除载体构建及突变体筛选第79页
        1.6 CfPMK1基因敲除突变体的验证第79-80页
        1.7 CfPMK1基因敲除突变体互补菌株的获得第80页
        1.8 CfPMK1基因敲除突变体的生物学表型分析第80-82页
    2 结果与分析第82-92页
        2.1 果生炭疽菌CFLH16全基因组序列分析第82页
        2.2 CfPmk1的鉴定及系统进化树分析第82-83页
        2.3 敲除突变体及互补菌株的获得第83-84页
        2.4 CfPMK1基因参与调控病菌菌丝营养生长第84页
        2.5 CfPMK1基因参与调控病菌分生孢子的形成第84-85页
        2.6 CfPMK1参与调控病菌侵染结构的形成第85-86页
        2.7 突变体△Cfpmk1不能穿透玻璃纸第86-87页
        2.8 CfPMK1基因敲除突变体致病性丧失第87-88页
        2.9 CfPMK1基因参与调控病菌有性生殖第88-89页
        2.10 CfPMK1基因参与对外界胁迫的应答第89-91页
        2.11 CfPmk1蛋白定位于除液泡以外的胞质和细胞核中第91页
        2.12 果生炭疽菌CfPMK1基因可以恢复稻瘟病菌突变体△Mopmk1致病性第91-92页
    3 讨论第92-93页
    4 小结第93-94页
第六章 主要结论及创新点第94-97页
    1 主要结论第94-95页
    2 创新点第95-96页
    3 展望第96-97页
参考文献第97-113页
附录A第113-118页
附表1第118-124页
附表2第124-131页
附表3第131-132页
附B 攻读学位期间的主要学术成果第132-134页
致谢第134页

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