| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 文献综述 | 第15-25页 |
| 第一章 禽隐孢子虫病与非编码RNA研究概况 | 第15-25页 |
| 1.1 禽隐孢子虫病研究概况 | 第15-19页 |
| 1.1.1 禽的隐孢子虫种类 | 第15-16页 |
| 1.1.2 临床症状 | 第16-17页 |
| 1.1.3 流行病学 | 第17-18页 |
| 1.1.4 致病机理 | 第18页 |
| 1.1.5 诊断和防治 | 第18-19页 |
| 1.2 非编码RNA研究概况 | 第19-24页 |
| 1.2.1 lncRNA研究概况 | 第19-20页 |
| 1.2.1.1 lncRNA的特征 | 第19-20页 |
| 1.2.1.2 lncRNA的分类 | 第20页 |
| 1.2.1.3 lncRNA的功能 | 第20页 |
| 1.2.2 circRNA研究概况 | 第20-22页 |
| 1.2.2.1 circRNA的特征 | 第20-21页 |
| 1.2.2.2 circRNA的分类与来源 | 第21页 |
| 1.2.2.3 circRNA的功能 | 第21-22页 |
| 1.2.3 其他非编码RNA研究概况 | 第22-24页 |
| 1.2.3.1 microRNA | 第22-23页 |
| 1.2.3.2 siRNA | 第23-24页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第24-25页 |
| 试验研究 | 第25-57页 |
| 第二章 雏鸡贝氏隐孢子虫感染模型的建立 | 第25-35页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-29页 |
| 2.1.1 材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1.1 试验材料 | 第25页 |
| 2.1.1.2 主要仪器设备 | 第25页 |
| 2.1.1.3 主要试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.1.4 主要溶液的配制 | 第26页 |
| 2.1.2 方法 | 第26-29页 |
| 2.1.2.1 C.baileyi卵囊收集 | 第26-27页 |
| 2.1.2.2 C.baileyi卵囊纯化 | 第27页 |
| 2.1.2.3 C.baileyi卵囊计数 | 第27页 |
| 2.1.2.4 粪便基因组DNA提取 | 第27页 |
| 2.1.2.5 组织基因组DNA提取 | 第27页 |
| 2.1.2.6 巢氏PCR扩增和电泳 | 第27-28页 |
| 2.1.2.7 序列测定和种系发育分析 | 第28页 |
| 2.1.2.8 石蜡切片及HE染色 | 第28-29页 |
| 2.1.2.9 扫描电镜样品制备与观察 | 第29页 |
| 2.2 结果 | 第29-34页 |
| 2.2.1 显微镜检查结果 | 第29-30页 |
| 2.2.218 SrRNA基因PCR扩增结果 | 第30页 |
| 2.2.3 种系发育分析结果 | 第30-31页 |
| 2.2.4 气管组织样品PCR检测结果 | 第31-32页 |
| 2.2.5 排卵囊规律 | 第32-33页 |
| 2.2.6 切片观察结果 | 第33页 |
| 2.2.7 电镜观察结果 | 第33-34页 |
| 2.3 讨论 | 第34页 |
| 2.4 小结 | 第34-35页 |
| 第三章 贝氏隐孢子虫感染雏鸡的lncRNA与mRNA表达谱分析 | 第35-50页 |
| 3.1 材料与方法 | 第35-39页 |
| 3.1.1 材料 | 第35-36页 |
| 3.1.1.1 试验材料 | 第35页 |
| 3.1.1.2 主要仪器设备 | 第35页 |
| 3.1.1.3 主要试剂 | 第35页 |
| 3.1.1.4 主要溶液的配制 | 第35-36页 |
| 3.1.2 方法 | 第36-39页 |
| 3.1.2.1 样品采集 | 第36页 |
| 3.1.2.2 RNA的提取 | 第36页 |
| 3.1.2.3 RNA沉淀的洗涤 | 第36页 |
| 3.1.2.4 RNA的溶解 | 第36页 |
| 3.1.2.5 RNA的质量评估 | 第36页 |
| 3.1.2.6 cDNA合成 | 第36-37页 |
| 3.1.2.7 测序 | 第37-38页 |
| 3.1.2.8 实时定量PCR检测 | 第38-39页 |
| 3.1.2.9 统计学分析 | 第39页 |
| 3.2 结果 | 第39-49页 |
| 3.2.1 RNA的提取与质量检测结果 | 第39-40页 |
| 3.2.2 测序数据结果 | 第40页 |
| 3.2.3 lncRNA筛选结果 | 第40-41页 |
| 3.2.4 mRNA和lncRNA的差异表达分析结果 | 第41-42页 |
| 3.2.5 lncRNA的聚类分析结果 | 第42-43页 |
| 3.2.6 mRNA和lncRNA的特征比较结果 | 第43页 |
| 3.2.7 qRT-PCR验证结果 | 第43-44页 |
| 3.2.8 lncRNA的靶基因预测结果 | 第44-45页 |
| 3.2.9 GO分析结果 | 第45-46页 |
| 3.2.10 KEGG分析结果 | 第46页 |
| 3.2.11 差异mRNA和lncRNA在雏鸡感染过程中的表达规律 | 第46-49页 |
| 3.3 讨论 | 第49页 |
| 3.4 小结 | 第49-50页 |
| 第四章 贝氏隐孢子虫感染雏鸡的circRNA表达谱分析 | 第50-57页 |
| 4.1 材料与方法 | 第50-52页 |
| 4.1.1 材料 | 第50页 |
| 4.1.1.1 试验材料 | 第50页 |
| 4.1.1.2 主要仪器设备 | 第50页 |
| 4.1.1.3 主要试剂 | 第50页 |
| 4.1.1.4 主要溶液的配制 | 第50页 |
| 4.1.2 方法 | 第50-52页 |
| 4.1.2.1 样品采集 | 第50页 |
| 4.1.2.2 RNA的提取 | 第50页 |
| 4.1.2.3 RNA沉淀的洗涤 | 第50-51页 |
| 4.1.2.4 RNA的溶解 | 第51页 |
| 4.1.2.5 RNA的质量评估 | 第51页 |
| 4.1.2.6 cDNA合成 | 第51页 |
| 4.1.2.7 测序 | 第51页 |
| 4.1.2.8 实时定量PCR检测 | 第51页 |
| 4.1.2.9 统计学分析 | 第51-52页 |
| 4.2 结果 | 第52-56页 |
| 4.2.1 circRNA的差异表达分析结果 | 第52页 |
| 4.2.2 circRNA的聚类分析结果 | 第52-53页 |
| 4.2.3 qRT-PCR验证结果 | 第53页 |
| 4.2.4 circRNA的靶基因预测结果 | 第53-54页 |
| 4.2.5 KEGG分析结果 | 第54-55页 |
| 4.2.6 差异circRNA在雏鸡感染过程中的表达规律 | 第55-56页 |
| 4.3 讨论 | 第56页 |
| 4.4 小结 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简介 | 第71页 |
