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鸡GnRHR-Ⅱ基因DNA甲基化特征及CpG-SNP与产蛋性状关联分析

英文缩略词第4-8页
中文摘要第8-10页
abstract第10-11页
1 前言第12-20页
    1.1 鸡性成熟启动研究进展第12-13页
        1.1.1 跨突触调节第13页
        1.1.2 神经胶质调节第13页
    1.2 GnRH与GnRHR基因的生物学特征第13-16页
        1.2.1 GnRH基因生物学特性第13-14页
        1.2.2 GnRHR基因的结构特点第14-15页
        1.2.3 GnRHR基因的组织表达及在性成熟启动中的功能第15-16页
    1.3 DNA甲基化第16-20页
        1.3.1 DNA甲基化的机制第16-17页
        1.3.2 DNA去甲基化的机制第17-18页
        1.3.3 DNA甲基化与基因表达的关系第18页
        1.3.4 CpG-SNPs第18-20页
2 材料与方法第20-38页
    2.1 试验材料第20-22页
        2.1.1 实验动物及样品采样第20页
        2.1.2 主要仪器设备第20-21页
        2.1.3 主要试剂及来源第21页
        2.1.4 主要试剂的配制第21-22页
        2.1.5 主要分子生物学数据库及软件第22页
    2.2 方法第22-37页
        2.2.1 鸡基因组DNA提取第22-23页
        2.2.2 DNA产物回收第23页
        2.2.3 鸡下丘脑和卵巢组织RNA提取第23-24页
        2.2.4 RNA浓度和质量检测第24页
        2.2.5 基因组DNA重亚硫酸氢盐修饰第24-25页
        2.2.6 GnRHR-Ⅱ基因-647~-38与+1206~+1778片段的获取第25-26页
        2.2.7 -647~-38片段与PMD18-T载体的连接与转化第26-27页
        2.2.8 挑菌与测序第27页
        2.2.9 GnRHR-Ⅱ基因启动子删除载体构建第27-33页
        2.2.10 鸡卵泡颗粒细胞的分离培养第33-35页
        2.2.11 细胞瞬时转染第35页
        2.2.12 双荧光素酶活性检测第35-36页
        2.2.13 GnRHR-Ⅱ基因启动子区SNPs筛选第36页
        2.2.14 SNPs群体遗传学分析及其与鸡产蛋性状关联分析第36-37页
    2.3 统计与分析第37-38页
3 结果与分析第38-61页
    3.1 GnRHR-Ⅱ基因在鸡性发育过程中甲基化特征分析第38-53页
        3.1.1 鸡下丘脑与卵巢基因组的提取第38页
        3.1.2 GnRHR-Ⅱ基因CpG岛分布预测第38-39页
        3.1.3 鸡下丘脑组织中GnRHR-Ⅱ基因甲基化变化规律第39-43页
        3.1.4 鸡卵巢组织中GnRHR-Ⅱ基因甲基化变化规律第43-48页
        3.1.5 下丘脑与卵巢组织中GnRHR-Ⅱ甲基化水平变化的差异比较第48-52页
        3.1.6 GnRHR-Ⅱ基因启动子区甲基化显著变化位点转录因子预测第52-53页
    3.2 GnRHR-Ⅱ5′启动子区荧光活性分析第53-55页
        3.2.1 GnRHR-Ⅱ基因启动子区片段扩增第53-54页
        3.2.2 PGL-GnRHR-3282载体序列比对分析第54页
        3.2.3 GnRHR-Ⅱ启动子区删除载体构建第54-55页
        3.2.4 双荧光素酶分析GnRHR-Ⅱ启动子区不同片段活性第55页
    3.3 GnRHR-Ⅱ基因启动子区SNPs的筛选与分析第55-61页
        3.3.1 混池测序检测GnRHR-Ⅱ启动子区SNPs第55-57页
        3.3.2 GnRHR-Ⅱ基因启动子区在不同鸡种中的等位基因和基因型频率第57-58页
        3.3.4 GnRHR-Ⅱ启动子区突变位点与产蛋性能的关联分析第58-61页
4 讨论第61-64页
5 结论第64-65页
6 参考文献第65-72页
7 致谢第72-73页
攻读学位期间发表论文情况第73页

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