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利用斑马鱼模型研究心脏和肌肉高水平表达基因POP3在心脏发育中的生物学功能

摘要第3-7页
ABSTRACT第7-10页
第一章 研究背景和文献综述第15-41页
    1.1 斑马鱼心脏发育概述第15-20页
    1.2 脊椎动物心脏早期发育的分子调控第20-29页
        1.2.1 NK-2同源异性因子第20-22页
        1.2.2 锌指蛋白GATA转录因子第22-24页
        1.2.3 Nkx2.5和GATA4调控心脏早期发育的信号通路第24-27页
        1.2.4 其它因子对心脏早期发育的调控第27-29页
    1.3 细胞增殖调控第29-35页
        1.3.1 细胞周期第30页
        1.3.2 细胞增殖的调控第30-35页
            1.3.2.1 生长因子与生长因子受体第30-31页
            1.3.2.2 信号系统的影响第31-32页
            1.3.2.3 癌基因、抑癌基因、细胞周期引擎分子Cdk-cyclin第32-33页
            1.3.2.4 ATF4对细胞增殖的调控第33-34页
            1.3.2.5 GATA4对细胞增殖的调控第34-35页
    1.4 粘附分子第35-37页
    1.5 POPDC家族第37-39页
    1.6 本文研究意义与研究目标第39-41页
第二章 POP3基因的克隆及其蛋白对心脏前体细胞的增殖调控第41-93页
    2.1 前言第41页
    2.2 材料与方法第41-62页
        2.2.1 材料、试剂与设备第41-44页
        2.2.2 常规分子生物学实验方法第44-53页
            2.2.2.1 PCR反应第44-46页
            2.2.2.2 PCR产物的纯化回收第46-47页
            2.2.2.3 产物与载体的连接第47页
            2.2.2.4 转化(热休克法)第47页
            2.2.2.5 质粒的小量制备第47-48页
            2.2.2.6 阳性克隆的筛选与鉴定第48-49页
            2.2.2.7 测序第49页
            2.2.2.8 总RNA的提取第49页
            2.2.2.9 半定量RT-PCR第49-50页
            2.2.2.10 真核表达重组质粒的大量制备第50-51页
            2.2.2.11 常规细胞培养第51页
            2.2.2.12 转基因稳定表达细胞系的建立第51-52页
            2.2.2.13 Western blot第52页
            2.2.2.14 免疫荧光第52-53页
        2.2.3 原核细胞诱导蛋白质表达及多克隆抗体制备第53-54页
        2.2.4 用POP3抗体免疫沉淀和免疫复合物的胰酶酶解第54-55页
        2.2.5 HPLC-MS/MS第55页
        2.2.6 免疫共沉淀第55-56页
        2.2.7 哺乳动物细胞双杂交第56页
        2.2.8 荧光素酶报告系统分析第56-57页
        2.2.9 凝胶阻滞(EMSA)实验第57-58页
        2.2.10 斑马鱼morpholino技术第58-59页
        2.2.11 斑马鱼整胚原位杂交第59-61页
        2.2.12 斑马鱼整胚抗体染色第61-62页
    2.3 结果第62-90页
        2.3.1 重组质粒的构建第62-65页
        2.3.2 POP3与ATF4的基因和蛋白结构分析第65-69页
        2.3.3 家族关系和进化分析第69-70页
        2.3.4 POP3抗体的制备第70-71页
        2.3.5 POP3的表达第71-74页
            2.3.5.1 POP3在鼠中的表达和定位第71-72页
            2.3.5.2 POP3在斑马鱼胚胎中的表达和定位第72-74页
        2.3.6 用斑马鱼morpholino敲减技术确定POP3的生物学功能第74-80页
        2.3.7 用斑马鱼morpholino技术鉴别POPDC家族的功能差异第80-81页
        2.3.8 免疫沉淀确定POP3的相互作用蛋白ATF4第81-82页
        2.3.9 POP3与ATF4相互作用的确定第82-84页
        2.3.10 利用morpholino敲减技术确定POP3与ATF4的相互作用第84-86页
        2.3.11 利用RNAi干扰C2C12细胞系确定POP3与ATF4的相互作用第86页
        2.3.12 POP3与ATF4相互作用调控GATA4启动子上的CRE位点第86-90页
    2.4 讨论第90-93页
第三章 其它研究第93-107页
    3.1 ZNF480与ACTC1相互作用对肌生成的调控研究第93-101页
        3.1.1 材料与方法第93-97页
            3.1.1.1 常规实验材料与方法第93页
            3.1.1.2 RT-PCR引物第93页
            3.1.1.3 酵母双杂交第93-95页
            3.1.1.4 ZNF480转基因稳定表达C2C12细胞系的分化第95页
            3.1.1.5 免疫沉淀第95-96页
            3.1.1.6 胶内酶解和质谱分析第96-97页
        3.1.2 结果与讨论第97-101页
            3.1.2.1 质粒构建第97页
            3.1.2.2 酵母双杂交筛选与ZNF480相互作用的蛋白第97-99页
            3.1.2.3 ZNF480对C2C12分化的调控第99-101页
    3.2 人类心脏候选新基因C6orf142的克隆、表达及其转录活性的初步研究第101-107页
        3.2.1 材料与方法第101-102页
            3.2.1.1 常规实验材料与方法(同2.2)第101页
            3.2.1.2 引物第101-102页
            3.2.1.3 细胞转染和荧光素酶分析第102页
        3.2.2 结果与讨论第102-107页
            3.2.2.1 C6orf142基因和质粒构建第102-104页
            3.2.2.2 RT-PCR第104-105页
            3.2.2.3 转录活性分析第105页
            3.2.2.4 信号途径分析第105-107页
第四章 结语第107-110页
参考文献第110-120页
附录一第120-122页
附录二第122-124页
致谢第124-126页

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