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猪外周血单核细胞抗病毒反应的转录组及全基因组DNA甲基化调控研究

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
缩略词第9-12页
第一章 文献综述第12-23页
    1.1 猪抗病育种研究现状第12-13页
    1.2 DNA甲基化研究第13-18页
        1.2.1 CpG岛第15页
        1.2.2 DNA甲基化对基因转录的调控第15-16页
        1.2.3 DNA甲基化与疾病研究第16-17页
        1.2.4 DNA甲基化的检测方法第17-18页
    1.3 外周单核细胞第18-19页
    1.4 Poly Ⅰ:C在免疫学研究中的应用第19-20页
    1.5 畜禽转录组学研究第20-21页
        1.5.1 RNA-seq技术在转录组学研究中的优势第20-21页
        1.5.2 RNA-seq在畜禽转录学研究中的应用第21页
    1.6 本研究的目的和意义第21-23页
第二章 Poly Ⅰ:C诱导猪PBMCs转录组研究第23-42页
    2.1 材料与方法第23-30页
        2.1.1 试验材料第23-24页
        2.1.2 试验方法第24-30页
    2.2 结果与分析第30-39页
        2.2.1 PBMCs Poly Ⅰ:C免疫刺激预试验第30-33页
        2.2.2 PBMCs Poly Ⅰ:C免疫刺激试验第33-39页
    2.3 讨论第39-40页
    2.4 小结第40-42页
第三章 Poly Ⅰ:C诱导猪PBMCs全基因组DNA甲基化研究第42-61页
    3.1 材料与方法第42-48页
        3.1.1 试验材料第42-43页
        3.1.2 试验方法第43-48页
    3.2 结果与分析第48-58页
        3.2.1 PBMCs基因组DNA提取结果第48-49页
        3.2.2 PBMCs甲基化测序数据统计第49-50页
        3.2.3 全基因组甲基化水平分析第50-53页
        3.2.4 差异甲基化区域检测第53-54页
        3.2.5 差异甲基化区域Bisulfite测序验证第54页
        3.2.6 DMR功能特征分析第54-56页
        3.2.7 DNA甲基化与基因转录调控第56-57页
        3.2.8 差异甲基化差异表达基因分析第57-58页
    3.3 讨论第58-59页
    3.4 小结第59-61页
第四章 PACSIN1基因功能鉴定及启动子甲基化功能研究第61-75页
    4.1 材料与方法第61-70页
        4.1.1 试验材料第61-62页
        4.1.2 试验方法第62-70页
    4.2 试验结果与分析第70-73页
        4.2.1 CpG甲基转移酶处理的重组质粒甲基化完整性检测第70-71页
        4.2.2 甲基化对启动子转录活性的影响第71页
        4.2.3 PACSIN1基因siRNA转染效率评价第71-72页
        4.2.4 PACSIN1基因沉默对免疫相关基因表达的影响第72-73页
    4.3 讨论第73-74页
    4.4 小结第74-75页
第五章 结论第75-76页
    5.1 主要结论第75页
    5.2 下一步研究工作第75-76页
参考文献第76-86页
致谢第86-87页
附录第87-101页
个人简历第101-103页

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