| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 序言 | 第8-12页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| 1.1. 基因测序项目介绍 | 第12-14页 |
| 1.2. 基因测序技术发展现状 | 第14-20页 |
| 1.2.1. 早期的基因测序技术 | 第15页 |
| 1.2.2. 第二代测序技术 | 第15-16页 |
| 1.2.3. 第三代测序技术 | 第16-20页 |
| 1.3. 论文组织结构 | 第20-22页 |
| 2 长READ纠错介绍 | 第22-29页 |
| 2.1. 长READ纠错研究现状 | 第22-27页 |
| 2.1.1. 现有长READ纠错算法介绍 | 第23-25页 |
| 2.1.2. 长READ纠错算法分类 | 第25-27页 |
| 2.2. 本论文研究内容 | 第27-28页 |
| 2.3. 本章小结 | 第28-29页 |
| 3 算法详细设计 | 第29-39页 |
| 3.1. 方法介绍 | 第29-31页 |
| 3.2. 算法流程 | 第31-37页 |
| 3.2.1. 第一步:将长READ比对到CONTIG上 | 第33页 |
| 3.2.2. 第二步:将CONTIG和长READ区域拆分 | 第33-34页 |
| 3.2.3. 第三步:构建CONTIG图 | 第34-36页 |
| 3.2.4. 第四步:为长READ纠错 | 第36-37页 |
| 3.2.5. 第五步:再纠错 | 第37页 |
| 3.3. 软件运行环境 | 第37页 |
| 3.4. 本章小结 | 第37-39页 |
| 4 实验设计与结论 | 第39-60页 |
| 4.1. 实验设计 | 第39-43页 |
| 4.1.1. 数据集和测试环境 | 第40页 |
| 4.1.2. 实验指标 | 第40-43页 |
| 4.2. 实验结果 | 第43-47页 |
| 4.2.1. 基因组纠错性能实验结果 | 第43页 |
| 4.2.2. 长READ拼接实验结果 | 第43-45页 |
| 4.2.3. 转录组测试实验结果 | 第45-46页 |
| 4.2.4. 不同短READ拼接软件实验结果 | 第46页 |
| 4.2.5. 运行时间和内存消耗 | 第46-47页 |
| 4.3. 关于错误纠错的讨论 | 第47-49页 |
| 4.4. 第三方综合实验 | 第49-58页 |
| 4.4.1. 实验设计 | 第50-51页 |
| 4.4.2. 实验结果 | 第51-55页 |
| 4.4.3. 实验结果分析 | 第55-58页 |
| 4.5. 本章小结 | 第58-60页 |
| 5 结论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-65页 |
| 作者简历及攻读硕士/博士学位期间取得的研究成果 | 第65-67页 |
| 学位论文数据集 | 第67页 |