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基于网络方法探讨miRNA在脑肿瘤中的作用机制及应用价值

中文摘要第3-6页
Abstract第6-9页
缩略词表Ⅰ第10-11页
缩略词表Ⅱ第11-15页
第一部分 III级胶质瘤基因共表达网络(WGCNA)构建第15-40页
    1.1 前言第15-19页
        1.1.1 研究背景第15-16页
        1.1.2 WGCNA理论基础第16页
        1.1.3 WGCNA算法基础第16-17页
        1.1.4 基因共表达网络similarity的定义第17页
        1.1.5 Adjacency功能参数的定义第17-19页
        1.1.6 识别基因模块(modules)以及功能第19页
        1.1.7 Cytoscape的基因网络分析第19页
    1.2 研究目的第19-20页
    1.3 研究方法以及结果第20-22页
        1.3.1 数据下载第20页
        1.3.2 差异基因筛选第20-21页
        1.3.3 构建III级胶质瘤共表达网络第21-22页
        1.3.4 III级胶质瘤基因模块GO、KEGG功能分析第22页
        1.3.5 III级胶质瘤的预后第22页
    1.4 结果第22-33页
        1.4.1 差异基因第22-25页
        1.4.2 III级胶质瘤共表达网络第25-29页
        1.4.3 III级胶质瘤基因模块GO、KEGG功能分析结果第29-31页
        1.4.4 与III级胶质瘤的预后相关的信号分子第31-33页
    1.5 讨论第33-35页
    1.6 结论第35-36页
    参考文献第36-40页
第二部分 microRNA在髓母细胞瘤的作用机制第40-52页
    2.1 前言第40-41页
        2.1.1 髓母细胞瘤的研究进展第40-41页
        2.1.2 IPA(ingenuity pathway analysis)软件在肿瘤研究中的应用第41页
    2.2 研究目的第41-42页
    2.3 方法第42-43页
        2.3.1 数据下载和预处理第42页
        2.3.2 差异基因筛选第42-43页
        2.3.3 IPA软件分析髓母细胞瘤的调控网络第43页
    2.4 结果第43-46页
        2.4.1 差异基因第43-45页
        2.4.2 髓母细胞瘤mi RNA调控网络第45-46页
    2.5 讨论第46-48页
    2.6 结论第48页
    参考文献第48-52页
第三部分 microRNA在中枢神经系统肿瘤诊断应用的研究第52-69页
    3.1 前言第52-54页
    3.2 颅内肿瘤脑脊液差异microRNA的筛选第54-58页
    3.3 差异microRNA实验验证第58-63页
        3.3.1 标本的采集第58页
        3.3.2 主要仪器和试剂第58-59页
        3.3.3 脑脊液RNA的提取第59-60页
        3.3.4 mi RNA反转录成cDNA第60-63页
    3.4 结果第63-64页
    3.5 讨论第64-65页
    3.6 结论第65-66页
    参考文献第66-69页
在学期间的研究成果第69-70页
致谢第70页

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