| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略名词表 | 第13-14页 |
| 1 前言 | 第14-34页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第14-15页 |
| 1.2 文献综述 | 第15-32页 |
| 1.2.1 关联分析技术在植物中的应用 | 第15-20页 |
| 1.2.2 植物在非生物胁迫中的应答反应 | 第20-24页 |
| 1.2.3 植物在低温胁迫中的应答反应 | 第24-28页 |
| 1.2.4 植物中的MYB转录因子 | 第28-31页 |
| 1.2.5 植物中的β淀粉酶基因 | 第31-32页 |
| 1.3 研究的目的和意义 | 第32-34页 |
| 2 材料和方法 | 第34-46页 |
| 2.1 水稻材料、菌株及载体 | 第34-36页 |
| 2.2 载体构建与水稻的遗传转化 | 第36页 |
| 2.3 基因表达分析 | 第36页 |
| 2.4 DNA抽提和突变体基因型鉴定 | 第36-37页 |
| 2.5 水稻植株的逆境胁迫处理 | 第37-38页 |
| 2.5.1 转基因植株及突变体苗期低温胁迫 | 第37-38页 |
| 2.5.2 转基因植株及突变体孕穗期低温胁迫 | 第38页 |
| 2.5.3 529 份种质资源苗期低温胁迫 | 第38页 |
| 2.6 生理指标测定 | 第38-39页 |
| 2.6.1 细胞膜透性测定 | 第38-39页 |
| 2.6.2 叶绿素荧光参数（Fv/Fm）测定 | 第39页 |
| 2.6.3 淀粉含量测定 | 第39页 |
| 2.6.4 可溶性糖含量测定 | 第39页 |
| 2.7 蛋白抽提及Western-blot | 第39-40页 |
| 2.8 蛋白的原核表达及纯化 | 第40页 |
| 2.9 蛋白质与DNA的结合分析 | 第40-41页 |
| 2.9.1 染色质免疫共沉淀（ChIP） | 第40-41页 |
| 2.9.2 凝胶阻滞实验（EMSA） | 第41页 |
| 2.10 淀粉酶的酶活的测定 | 第41页 |
| 2.11 蛋白质的定位与互作分析 | 第41-43页 |
| 2.11.1 亚细胞定位 | 第41-42页 |
| 2.11.2 双分子荧光互补实验 | 第42页 |
| 2.11.3 Pull-down实验 | 第42页 |
| 2.11.4 Co-IP实验 | 第42-43页 |
| 2.12 酵母中的实验 | 第43-44页 |
| 2.12.1 转录激活活性检测 | 第43页 |
| 2.12.2 酵母双杂交系统筛选互作蛋白 | 第43页 |
| 2.12.3 酵母单杂交 | 第43-44页 |
| 2.13 水稻原生质体双荧光素酶活实验 | 第44页 |
| 2.14 GUS组织化学染色 | 第44-45页 |
| 2.15 关联分析方法 | 第45页 |
| 2.16 关联分析研究中的统计方法 | 第45-46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-110页 |
| 3.1 水稻苗期低温耐受性的遗传分析 | 第46-80页 |
| 3.1.1 关联分析群体在不同低温胁迫处理下的表型评估 | 第46-51页 |
| 3.1.2 水稻苗期不同低温胁迫中的性状表型间的相关性分析 | 第51页 |
| 3.1.3 水稻苗期低温相关性状的全基因组关联分析 | 第51-56页 |
| 3.1.4 水稻苗期低温关联分析与已知QTL的比较分析 | 第56-59页 |
| 3.1.5 关联分析位点中的候选基因 | 第59-62页 |
| 3.1.6 OsMYB2的单倍型分析 | 第62-64页 |
| 3.1.7 OsMYB2的各单倍型亚群及纬度分析 | 第64-67页 |
| 3.1.8 07g的单倍型分析 | 第67-68页 |
| 3.1.9 07g的各单倍型亚群及纬度分析 | 第68-70页 |
| 3.1.10 关联群体中不同低温胁迫条件下抗冷及冷敏感品种的筛选 | 第70-71页 |
| 3.1.11 具有不同低温抗性品种的亚群分析 | 第71-72页 |
| 3.1.12 具有不同低温抗性品种的纬度分析 | 第72-76页 |
| 3.1.13 不同低温胁迫条件下的重叠品种之间的比较分析 | 第76-80页 |
| 3.2 OSMYB30调控低温敏感性的功能鉴定 | 第80-110页 |
| 3.2.1 OsMYB30前期研究进展 | 第80-81页 |
| 3.2.2 OsMYB30基因超量表达及突变体材料的表型重复鉴定 | 第81-84页 |
| 3.2.3 OsMYB30转录活性的分析 | 第84-85页 |
| 3.2.4 OsMYB30亚细胞定位分析 | 第85-86页 |
| 3.2.5 OsMYB30靶基因的确定 | 第86-88页 |
| 3.2.6 OsMYB30与靶基因启动子互作分析 | 第88-91页 |
| 3.2.7 OsMYB30通过抑制β 淀粉酶活力负调控植物体内麦芽糖含量 | 第91-93页 |
| 3.2.8 OsMYB30超表达及突变体植株中淀粉含量受到影响 | 第93-95页 |
| 3.2.9 在低温逆境中，麦芽糖对植物细胞膜具有保护作用 | 第95-99页 |
| 3.2.10 OsMYB30的互作蛋白的筛选及验证 | 第99-105页 |
| 3.2.11 OsJAZ9参与低温逆境应答 | 第105-108页 |
| 3.2.12 OsMYB30与OsJAZ9对靶基因的调控分析 | 第108-110页 |
| 4 讨论 | 第110-126页 |
| 4.1 关联分析的探讨 | 第110-115页 |
| 4.1.1 关联作图与连锁作图的比较分析 | 第110-112页 |
| 4.1.2 低温适应性与籼粳和纬度分布的相关性的探讨 | 第112-114页 |
| 4.1.3 自然低温胁迫与急剧低温胁迫的遗传基础的探讨 | 第114-115页 |
| 4.2 OSMYB30的功能探讨 | 第115-122页 |
| 4.2.1 OsMYB30在低温胁迫中的负调控功能 | 第115-118页 |
| 4.2.2 OsMYB30在淀粉代谢中的复杂调控 | 第118-119页 |
| 4.2.3 BMY基因在低温胁迫中的保护作用 | 第119-120页 |
| 4.2.4 互作蛋白OsJAZ9对于OsMYB30介导的负调控的贡献 | 第120-122页 |
| 4.3 正向遗传学和反向遗传学应用于作物遗传改良 | 第122-124页 |
| 4.4 全文小结与后续工作设想 | 第124-126页 |
| 参考文献 | 第126-141页 |
| 附录 | 第141-211页 |
| 附录I 附图 | 第141-148页 |
| 附录II 附表 | 第148-198页 |
| 附录III 部分实验的详细操作程序 | 第198-209页 |
| 附录IV 作者简介 | 第209-211页 |
| 致谢 | 第211-213页 |
