| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-70页 |
| 引言 | 第16-17页 |
| 1.1 肥胖等代谢综合征概述 | 第17-19页 |
| 1.1.1 肥胖的基本概念 | 第17-18页 |
| 1.1.2 肥胖的流行病学调查 | 第18页 |
| 1.1.3 肥胖与慢性炎症 | 第18-19页 |
| 1.2 人体肠道菌群的结构与功能以及对人类健康的影响 | 第19-32页 |
| 1.2.1 人体肠道菌群的多样性组成 | 第20-26页 |
| 1.2.2 肠道菌群影响人体健康状态的作用概述 | 第26-32页 |
| 1.3 肥胖与肠道菌群关系的研究现状 | 第32-35页 |
| 1.3.1 肠道菌群与能量代谢和脂肪贮存 | 第32-33页 |
| 1.3.2 肠道菌群与系统性慢性低度炎症 | 第33-35页 |
| 1.4 非酒精性脂肪性肝病与肠道菌群关系的研究现状 | 第35-43页 |
| 1.4.1 非酒精性脂肪性肝病概述与诊断方法 | 第35-38页 |
| 1.4.2 非酒精性脂肪肝的流行病学调查及影响因素 | 第38页 |
| 1.4.3 非酒精性脂肪性肝病的发病机理 | 第38-42页 |
| 1.4.4 非酒精性脂肪性肝病与肠道菌群关系的研究进展 | 第42-43页 |
| 1.5 人体肠道菌群结构与功能的研究方法 | 第43-49页 |
| 1.5.1 基于分离培养的方法 | 第44-45页 |
| 1.5.2 基于指纹图谱的分子生态学研究方法 | 第45-46页 |
| 1.5.3 基于测序的分子生态学研究方法 | 第46-48页 |
| 1.5.4 多变量统计学在肠道菌群与健康相关研究中的应用 | 第48页 |
| 1.5.5 无菌动物在肠道菌群研究领域的应用 | 第48-49页 |
| 1.6 本章小结 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-70页 |
| 第二章 一株来自肥胖患者肠道内的条件致病菌引起无菌小鼠肥胖 | 第70-138页 |
| 摘要 | 第70-72页 |
| ABSTRACT | 第72-74页 |
| 引言 | 第74-75页 |
| 2.1 材料与方法 | 第75-91页 |
| 2.1.1 实验对象选择 | 第75-76页 |
| 2.1.2 膳食干预方案和生物样品采集 | 第76页 |
| 2.1.3 人体测量数据、临床数据实验分析以及生物样品分析 | 第76-77页 |
| 2.1.4 动物实验研究 | 第77-79页 |
| 2.1.5 粪便菌群的 16S rRNA 基因全长序列克隆文库分析 | 第79-82页 |
| 2.1.6 粪便菌群的变性梯度凝胶电泳分析 | 第82-83页 |
| 2.1.7 粪便菌群的元基因组测序及分析 | 第83-84页 |
| 2.1.8 “序列引导”的细菌分离 | 第84-85页 |
| 2.1.9 菌株 ERIC-PCR 指纹图谱分析 | 第85页 |
| 2.1.10 分离物的限制性内切酶酶切分型 | 第85-86页 |
| 2.1.11 菌株的利福平耐药标记 | 第86页 |
| 2.1.12 菌株生化鉴定以及 16S rRNA 基因全长序列的测定 | 第86-87页 |
| 2.1.13 菌株全基因组测序及草图分析 | 第87-88页 |
| 2.1.14 LPS 提取以及检测 | 第88页 |
| 2.1.15 小鼠粪便菌落计数法分析粪便样品中代表菌株的数量 | 第88页 |
| 2.1.16 葡萄糖耐受实验 | 第88页 |
| 2.1.17 小鼠血清生化分析 | 第88-89页 |
| 2.1.18 实时定量 PCR | 第89-90页 |
| 2.1.19 细菌易位检测 | 第90页 |
| 2.1.20 数据统计分析 | 第90-91页 |
| 2.2 实验结果 | 第91-128页 |
| 2.2.1 肥胖患者膳食干预前后内毒素载荷量、炎性水平以及代谢综合征相关指标的变化 | 第91-94页 |
| 2.2.2 肥胖患者膳食干预前后肠道菌群结构的变化 | 第94-103页 |
| 2.2.3 “序列引导”方式的细菌分离 | 第103-106页 |
| 2.2.4 菌株 Enterobacter cloacae B29 的 16S rRNA 基因全长测序分析以及生化鉴定分析 | 第106-109页 |
| 2.2.5 菌株 B29 的全基因组测序分析 | 第109-111页 |
| 2.2.6 菌株 B29 的内毒素活性检测 | 第111页 |
| 2.2.7 菌株 B29 在无菌小鼠体内定植能力的分析 | 第111-113页 |
| 2.2.8 单一接种菌株 B29 对悉生小鼠出现肥胖和胰岛素抵抗症状的影响 | 第113-122页 |
| 2.2.9 菌株 B29 对悉生小鼠脂肪合成和存储相关基因的调节 | 第122-124页 |
| 2.2.10 菌株 B29 诱导的肥胖小鼠的内毒素载量同全身以及局部炎症反应水平的检测 | 第124-126页 |
| 2.2.11 菌株 B29 对悉生小鼠肠屏障功能的影响 | 第126-127页 |
| 2.2.12 菌株 B29 的悉生小鼠肠道中菌株 B29 的再分离与鉴定 | 第127-128页 |
| 2.3 讨论 | 第128-131页 |
| 2.4 本章小结与展望 | 第131-132页 |
| 参考文献 | 第132-138页 |
| 第三章 阴沟肠杆菌菌株 B29 在非酒精性脂肪性肝病发展过程中的作用研究 | 第138-167页 |
| 摘要 | 第138-140页 |
| ABSTRACT | 第140-142页 |
| 引言 | 第142-143页 |
| 3.1 材料与方法 | 第143-146页 |
| 3.1.0 动物实验 | 第143页 |
| 3.1.1 小鼠肝脏病理切片检查 | 第143页 |
| 3.1.2 小鼠胰岛素抵抗相关指标及其他血清生化分析 | 第143-144页 |
| 3.1.3 小鼠各个组织的炎性因子相关基因、脂代谢基因以及肠道通透性基因的实时定量表达分析 | 第144页 |
| 3.1.4 小鼠全基因组表达谱芯片检测 | 第144-146页 |
| 3.1.5 数据统计分析 | 第146页 |
| 3.2 实验结果 | 第146-159页 |
| 3.2.1 菌株 B29 的悉生小鼠肝脏病理切片的分析结果 | 第146-149页 |
| 3.2.2 菌株 B29 的悉生小鼠血清肝功指标的检测 | 第149-150页 |
| 3.2.3 菌株 B29 对悉生小鼠出现肥胖和胰岛素抵抗症状的影响 | 第150-151页 |
| 3.2.4 菌株 B29 对悉生小鼠血脂、脂肪合成以及存储相关基因的调节 | 第151-152页 |
| 3.2.5 菌株 B29 诱导的非酒精性脂肪性肝病小鼠的内毒素载量水平、全身以及局部炎症反应水平的检测 | 第152页 |
| 3.2.6 菌株 B29 对无菌小鼠基因表达的全基因表达谱分析 | 第152-159页 |
| 3.3 讨论 | 第159-162页 |
| 3.4 本章小结与展望 | 第162-163页 |
| 参考文献 | 第163-167页 |
| 论文创新点 | 第167-168页 |
| 附录 1 Metagenomic sequencing DNA 提取方法的建立 | 第168-179页 |
| 附录 2 缩写及全名 | 第179-181页 |
| 附录 3 通用溶液及培养基配方 | 第181-183页 |
| 附录 4 仪器设备 | 第183-184页 |
| 致谢 | 第184-186页 |
| 已（待）发表的学术文章及参加的科研课题 | 第186-187页 |
