华南地方猪连锁不平衡分析及有效群体大小估计
摘要 | 第3-5页 |
abstract | 第5-6页 |
英文缩略词 | 第7-10页 |
1 研究背景 | 第10-18页 |
1.1 连锁不平衡 | 第11-16页 |
1.1.1 连锁不平衡的定义 | 第11页 |
1.1.2 连锁不平衡分析的度量方法 | 第11-13页 |
1.1.3 连锁不平衡的群体特异性 | 第13-14页 |
1.1.4 连锁不平衡的研究进展 | 第14-16页 |
1.2 有效群体大小 | 第16-18页 |
1.2.1 有效群体大小的定义 | 第16页 |
1.2.2 有效群体大小的估计方法 | 第16-17页 |
1.2.3 有效群体大小的研究进展 | 第17-18页 |
2 目的与意义 | 第18页 |
3 材料和方法 | 第18-27页 |
3.1 实验材料 | 第18-23页 |
3.1.1 实验动物 | 第18-22页 |
3.1.2 试剂、溶液与仪器 | 第22页 |
3.1.3 软件 | 第22-23页 |
3.2 试验方法 | 第23-27页 |
3.2.1 技术路线 | 第23页 |
3.2.2 基因组DNA提取 | 第23-24页 |
3.2.3 样品DNA浓度检测与质量控制 | 第24页 |
3.2.4 SNP基因分型 | 第24-25页 |
3.2.5 基因型数据处理与分析 | 第25-27页 |
4 结果与分析 | 第27-43页 |
4.1 基因组DNA检测结果 | 第27页 |
4.2 基因型质量控制结果 | 第27-31页 |
4.3 连锁不平衡分析结果 | 第31-38页 |
4.4 有效群体大小估计 | 第38-43页 |
5 讨论 | 第43-47页 |
5.1 关于连锁不平衡的讨论 | 第43-45页 |
5.1.1 各猪种相邻标记间的连锁不平衡 | 第43-44页 |
5.1.2 各猪种较远标记间距的连锁不平衡 | 第44页 |
5.1.3 各猪种不同标记密度下的连锁不平衡 | 第44-45页 |
5.1.4 各猪种不同染色体之间的连锁不平衡 | 第45页 |
5.1.5 不同物种相邻标记间的连锁不平衡 | 第45页 |
5.2 关于有效群体大小的讨论 | 第45-47页 |
6 结论 | 第47-48页 |
致谢 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-56页 |
附录A | 第56-67页 |
附录B | 第67-77页 |