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转录因子Sal-like protein 2调控p16INK4A表达机制的研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
符号说明第14-15页
第一章 综述第15-43页
    1. 研究现状第15页
    2. 肿瘤抑制因子Sall2及其相关癌症第15-21页
        2.1 SALL家族的成员第15-16页
        2.2 多瘤病毒大T抗原结合蛋白第16-17页
        2.3 SALL2的下游靶基因第17-18页
        2.4 SALL2与癌基因第18-19页
        2.5 SALL2和人类卵巢癌第19-21页
    3. 肿瘤抑制因子p16的调节机制及其相关癌症第21-37页
        3.1 p16的基本生化特性第22-25页
        3.2 p16 DNA水平的调控第25-28页
        3.3 p16转录水平的调节第28-32页
        3.4 转录后调控第32-36页
        3.5 p16调控和肿瘤第36-37页
    4.Sp转录因子及其功能第37-39页
        4.1 Sp转录因子家族第37-38页
        4.2 sp1转录因子第38-39页
    5.肿瘤相关蛋白AGR2及其相关癌症第39-40页
        5.1 AGR2的简介第39-40页
        5.2 AGR2促进肿瘤的生长其机制与p16相关第40页
    6.研究内容和意义第40-41页
    7.项目研究路线第41-43页
第二章 实验材料第43-54页
    1. 材料第43-54页
        1.1 细胞、质粒、菌株和蛋白第43-44页
            1.1.1 细胞均购自美国ATCC第43页
            1.1.2 质粒第43页
            1.1.3 菌株第43页
            1.1.4 蛋白第43-44页
        1.2 实验试剂第44-47页
        1.3 实验仪器第47-48页
        1.4 试剂配制第48-54页
第三章 实验方法和结果第54-96页
    第一部分 下游靶基因的发现和确认第54-75页
        1. 方法第54-61页
            1.1 Lipofectamine2000介导的瞬时转染第54页
            1.2 Trizol提取细胞中RNA第54-55页
            1.3 基因组DNA的提取第55页
            1.4 切胶回收第55-56页
            1.5 Promega双荧光素酶系统操作步骤第56-57页
            1.6 提取细胞蛋白第57页
            1.7 Western blot实验第57-58页
            1.8 Sall2靶基因启动子质粒构建所需引物第58-59页
            1.9 扩增p16 gene region, p16 exon 1 和p16 promoter region的引物第59-61页
        2. 实验结果第61-74页
            2.1 Sall2能够上调p16的表达第61-65页
                2.1.1 分析SKOV3细胞中Sall2影响基因的表达情况第61-62页
                2.1.2 Sall2影响基因的GO(Gene Ontology)分类分析第62-65页
            2.2.进一步确认Sall2的下游靶基因第65-68页
                2.2.1 Sall2的部分下游靶基因第65-66页
                2.2.2 靶基因启动子质粒构建第66页
                2.2.3 Sall2的两个亚型都能通过调节启动子活性来调控下游靶基因的表达第66-68页
            2.3 验证SKOV3细胞中p16的转录情况第68-73页
                2.3.1 p16 gene region,p16 exon 1 和p16 promoter region PCR扩增结果第69页
                2.3.2 扩增p16 gene region,exon1和promoter region结果分析第69-70页
                2.3.3 不同细胞系中p16序列比对第70-73页
            2.4 Sall2上调p16的表达并呈剂量依赖性第73-74页
                2.4.1 Sall2上调p16的表达第73-74页
                2.4.2 Sall2对p16的上调呈剂量依赖性第74页
        3. 小结第74-75页
    第二部分 Sall2调节p16启动子的研究第75-88页
        1. 方法第75-80页
            1.1 Lipofectamine2000介导的瞬时转染第75页
            1.2 切胶回收第75页
            1.3 突变第75-77页
                1.3.1 Inverse PCR第75-76页
                1.3.2 Dpn I消化模版第76页
                1.3.3 连接第76-77页
                1.3.4 转化第77页
            1.4 Promega双荧光素酶系统操作步骤第77页
            1.5 扩增入p16启动子(p16-pr)的巢氏PCR引物和条件第77-78页
            1.6 p GL3-Basic-p16-pr质粒构建第78-79页
            1.7 p16-Luc缺失突变质粒构建引物第79-80页
            1.8 Sall2缺失突变质粒构建引物第80页
        2. 实验结果第80-87页
            2.1 Sall2可结合于p16的启动子近端位点并诱导p16启动子的活性第80-86页
                2.1.1 p16-Luc质粒构建第80-82页
                2.1.2 p16-Luc缺失突变质粒构建第82-83页
                2.1.3 结合位点初步分析第83-84页
                2.1.4 p16-Luc进一步缺失突变第84-85页
                2.1.5 Sall2结合于p16的启动子近端位点的确定第85-86页
            2.2 Sall2的第3个锌指结构对p16启动子活性起到决定性作用第86-87页
                2.2.1 Sall2缺失突变质粒构建第86-87页
                2.2.2 Sall2的第3个锌指结构对上调p16启动子活性起到决定性作用第87页
        3. 小结第87-88页
    第三部分:Sall2对p16调节的生物学功能第88-95页
        1. 方法第88-91页
            1.1 p16 minigene的构建第88页
            1.2 Lipofectamine2000介导的瞬时转染第88页
            1.3 p16的si RNA第88-89页
            1.4 Lipofectamine RNAi MAX介导的瞬时转染第89页
            1.5 提取细胞蛋白第89页
            1.6 Western blot实验第89-90页
            1.7 流式细胞检测第90-91页
        2. 实验结果第91-95页
            2.1 Sall2对p16的诱导表达可引起细胞周期的阻滞第91-93页
                2.1.1 p16 minigene的构建第91页
                2.1.2 Sall2通过诱导p16表达抑制细胞周期第91-93页
            2.2 敲降p16后Sall2抑制细胞周期作用显著减弱第93-95页
                2.2.1 p16RNAi第93页
                2.2.2 敲降p16后Sall2抑制细胞周期的能力降低第93-95页
        3. 小结第95页
    第四部分 实验结果总结第95-96页
第四章 讨论和展望第96-100页
参考文献第100-116页
附录1 英文缩略语第116-118页
附录2 质粒序列第118-128页
    1. pGL3 Basic p16 promoter Vector第118-123页
    2. p16 minigene第123-128页
致谢第128-129页
攻读博士学位期间发表或待发表的学术论文及专利第129-130页

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