摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 绪论 | 第10-15页 |
1.1 研究背景和现状 | 第10-11页 |
1.2 面临问题 | 第11-12页 |
1.3 研究意义 | 第12-13页 |
1.4 本文创新 | 第13-14页 |
1.5 本文结构 | 第14-15页 |
第2章 相关背景 | 第15-26页 |
2.1 化学背景 | 第15-21页 |
2.1.1 分子筛预测 | 第15-16页 |
2.1.2 FraGen简介 | 第16-18页 |
2.1.3 Kriber简介 | 第18-19页 |
2.1.4 Gulp简介 | 第19-20页 |
2.1.5 LID规则简介 | 第20-21页 |
2.2 计算机背景 | 第21-26页 |
2.2.1 高通量计算 | 第21-22页 |
2.2.2 Load Sharing Facility (LSF)系统 | 第22-26页 |
2.2.2.1 LSF系统简介 | 第22-23页 |
2.2.2.2 LSF作业执行流程 | 第23-24页 |
2.2.2.3 LSF特点 | 第24-26页 |
第3章 分子筛预测的高通量和自动化设计 | 第26-38页 |
3.1 利用FraGen进行分子筛预测以及筛选过程中的主要问题 | 第26-28页 |
3.2 高通量分子筛预测设计 | 第28-29页 |
3.3 自动化模块设计 | 第29-30页 |
3.4 利用LSF自动化衔接各个过程 | 第30-31页 |
3.5 数据库设计 | 第31-34页 |
3.5.1 假想分子数据库表结构设计 | 第31-32页 |
3.5.2 分子预测流程状态表设计 | 第32-34页 |
3.6 分子结构查询界面以及流程状态实时监测设计 | 第34-38页 |
第4章 分子筛预测的高通量和自动化实现 | 第38-58页 |
4.1 架构设计 | 第38-39页 |
4.2 自动化模块实现 | 第39-53页 |
4.2.1 自动化输入文件构造模块实现 | 第40-43页 |
4.2.1.1 countcsq模块实现 | 第40页 |
4.2.1.2 Split模块实现 | 第40-42页 |
4.2.1.3 cs2cif模块实现 | 第42页 |
4.2.1.4 cif2gin模块实现 | 第42-43页 |
4.2.1.5 cif2fin模块实现 | 第43页 |
4.2.2 自动化参数列表构造模块实现 | 第43-45页 |
4.2.2.1 createparameters_cs模块实现 | 第44页 |
4.2.2.2 createparameters_sp模块实现 | 第44页 |
4.2.2.3 createparameters_kri模块实现 | 第44-45页 |
4.2.3 自动化决策模块实现 | 第45-48页 |
4.2.3.1 judge模块实现 | 第45-46页 |
4.2.3.2 statistic模块实现 | 第46-48页 |
4.2.4 自动化分子结构修改模块实现 | 第48页 |
4.2.5 自动化数据库录入模块实现 | 第48-50页 |
4.2.5.1 合理/不合理分子结构录入模块实现 | 第49页 |
4.2.5.2 实时状态检测log模块实现 | 第49-50页 |
4.2.6 其他模块 | 第50-53页 |
4.2.6.1 孤儿作业检测模块实现 | 第51-52页 |
4.2.6.2 不可能完成作业检测模块实现 | 第52-53页 |
4.3 流程部署 | 第53-57页 |
4.4 作业状态实时查询功能实现 | 第57-58页 |
第5章 系统测试 | 第58-66页 |
5.1 性能测试 | 第58-62页 |
5.1.1 测试环境 | 第58页 |
5.1.2 大任务并发性能测试 | 第58-60页 |
5.1.3 小任务并发性能测试 | 第60-62页 |
5.2 用户界面展示 | 第62-66页 |
5.2.1 数据查询功能 | 第62-64页 |
5.2.2 实时状态检测功能 | 第64-66页 |
第6章 总结与展望 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-69页 |
作者简介及在学期间取得的科研成果 | 第69-70页 |
致谢 | 第70页 |