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基于LSF的高效催化材料预测的高通量自动化计算的研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第1章 绪论第10-15页
    1.1 研究背景和现状第10-11页
    1.2 面临问题第11-12页
    1.3 研究意义第12-13页
    1.4 本文创新第13-14页
    1.5 本文结构第14-15页
第2章 相关背景第15-26页
    2.1 化学背景第15-21页
        2.1.1 分子筛预测第15-16页
        2.1.2 FraGen简介第16-18页
        2.1.3 Kriber简介第18-19页
        2.1.4 Gulp简介第19-20页
        2.1.5 LID规则简介第20-21页
    2.2 计算机背景第21-26页
        2.2.1 高通量计算第21-22页
        2.2.2 Load Sharing Facility (LSF)系统第22-26页
            2.2.2.1 LSF系统简介第22-23页
            2.2.2.2 LSF作业执行流程第23-24页
            2.2.2.3 LSF特点第24-26页
第3章 分子筛预测的高通量和自动化设计第26-38页
    3.1 利用FraGen进行分子筛预测以及筛选过程中的主要问题第26-28页
    3.2 高通量分子筛预测设计第28-29页
    3.3 自动化模块设计第29-30页
    3.4 利用LSF自动化衔接各个过程第30-31页
    3.5 数据库设计第31-34页
        3.5.1 假想分子数据库表结构设计第31-32页
        3.5.2 分子预测流程状态表设计第32-34页
    3.6 分子结构查询界面以及流程状态实时监测设计第34-38页
第4章 分子筛预测的高通量和自动化实现第38-58页
    4.1 架构设计第38-39页
    4.2 自动化模块实现第39-53页
        4.2.1 自动化输入文件构造模块实现第40-43页
            4.2.1.1 countcsq模块实现第40页
            4.2.1.2 Split模块实现第40-42页
            4.2.1.3 cs2cif模块实现第42页
            4.2.1.4 cif2gin模块实现第42-43页
            4.2.1.5 cif2fin模块实现第43页
        4.2.2 自动化参数列表构造模块实现第43-45页
            4.2.2.1 createparameters_cs模块实现第44页
            4.2.2.2 createparameters_sp模块实现第44页
            4.2.2.3 createparameters_kri模块实现第44-45页
        4.2.3 自动化决策模块实现第45-48页
            4.2.3.1 judge模块实现第45-46页
            4.2.3.2 statistic模块实现第46-48页
        4.2.4 自动化分子结构修改模块实现第48页
        4.2.5 自动化数据库录入模块实现第48-50页
            4.2.5.1 合理/不合理分子结构录入模块实现第49页
            4.2.5.2 实时状态检测log模块实现第49-50页
        4.2.6 其他模块第50-53页
            4.2.6.1 孤儿作业检测模块实现第51-52页
            4.2.6.2 不可能完成作业检测模块实现第52-53页
    4.3 流程部署第53-57页
    4.4 作业状态实时查询功能实现第57-58页
第5章 系统测试第58-66页
    5.1 性能测试第58-62页
        5.1.1 测试环境第58页
        5.1.2 大任务并发性能测试第58-60页
        5.1.3 小任务并发性能测试第60-62页
    5.2 用户界面展示第62-66页
        5.2.1 数据查询功能第62-64页
        5.2.2 实时状态检测功能第64-66页
第6章 总结与展望第66-67页
参考文献第67-69页
作者简介及在学期间取得的科研成果第69-70页
致谢第70页

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