| 摘要 | 第7-12页 |
| Abstract | 第12-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-32页 |
| 1.1 家蚕丝蛋白表达 | 第18-19页 |
| 1.2 家蚕丝蛋白高量表达的细胞生理学基础 | 第19-20页 |
| 1.3 家蚕丝蛋白表达的转录调控 | 第20-21页 |
| 1.3.1 Fib-H基因的正转录调控 | 第21页 |
| 1.3.2 Fib-H基因的负转录调控 | 第21页 |
| 1.4 染色体的构象变化对基因表达的调控 | 第21-26页 |
| 1.4.1 单基因或基因簇区域染色体结构变化对基因表达的调控 | 第22-23页 |
| 1.4.2 细胞核内染色体的结构 | 第23-25页 |
| 1.4.3 细胞核内维持染色体构象的蛋白 | 第25-26页 |
| 1.4.4 家蚕不同组织样品中Fib-H基因区域的染色体构象变化 | 第26页 |
| 1.5 染色体构象的观察与分子检测 | 第26-30页 |
| 1.5.1 染色体结构的可视化 | 第27页 |
| 1.5.2 染色体构象捕获方法的发明与发展 | 第27-30页 |
| 1.6 染色体构象变化引发多种疾病 | 第30页 |
| 1.7 家蚕中编辑重要基因改变染色体构象的技术平台 | 第30-32页 |
| 第二章 引言 | 第32-34页 |
| 2.1 立题依据与研究意义 | 第32-33页 |
| 2.2 关键研究的技术路线 | 第33-34页 |
| 第三章 家蚕细胞系BmE染色体构象捕获 | 第34-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-45页 |
| 3.1.1 材料 | 第34页 |
| 3.1.2 主要试剂及配制 | 第34-36页 |
| 3.1.3 方法 | 第36-45页 |
| 3.2 结果与分析 | 第45-54页 |
| 3.2.1 BmE细胞系的HiC文库构建与测序质量控制 | 第45-46页 |
| 3.2.2 BmE细胞系HiC测序数据基础分析 | 第46页 |
| 3.2.3 MboI酶切片段的理论与实际分布 | 第46-47页 |
| 3.2.4 染色体互作数据的评估 | 第47-49页 |
| 3.2.5 迭代矫正法标准化数据 | 第49页 |
| 3.2.6 BmE细胞系全基因组互作热图 | 第49-50页 |
| 3.2.7 顺、反式相互作用 | 第50-52页 |
| 3.2.8 BmE染色体区室化分析 | 第52页 |
| 3.2.9 BmE细胞系染色体内拓扑相关区域（TAD） | 第52-54页 |
| 3.2.10 BmE细胞核三维模型的构建 | 第54页 |
| 3.3 讨论 | 第54-56页 |
| 第四章 不同时期丝腺细胞内染色体构象捕获 | 第56-70页 |
| 4.1 材料与方法 | 第56-57页 |
| 4.1.1 材料 | 第56页 |
| 4.1.2 主要试剂及配制 | 第56-57页 |
| 4.1.3 方法 | 第57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-67页 |
| 4.2.1 五个丝腺组织样品质量控制 | 第57-58页 |
| 4.2.2 五个丝腺组织样品测序数据分析 | 第58页 |
| 4.2.3 MboI酶切片段的理论与实际分布 | 第58-60页 |
| 4.2.4 丝腺5个样品的全基因组互作图谱 | 第60-62页 |
| 4.2.5 丝腺组织中顺、反式相互作用及三维结构模型 | 第62-64页 |
| 4.2.6 5L3-PSG中出现特殊的染色体互作模式 | 第64-66页 |
| 4.2.7 Chr25特殊的染色体互作模式的出现具有组织时期特异性 | 第66-67页 |
| 4.3 讨论 | 第67-70页 |
| 第五章 利用CRISPR/Cas9系统初步探索 3D基因组结构在丝腺中的功能 | 第70-100页 |
| 5.1 材料与方法 | 第70-81页 |
| 5.1.1 材料 | 第70页 |
| 5.1.2 主要试剂及配制 | 第70-72页 |
| 5.1.3 方法 | 第72-81页 |
| 5.2 结果与分析 | 第81-97页 |
| 5.2.1 家蚕BmLaminA/C基因的鉴定及表达谱分析 | 第81-82页 |
| 5.2.2 家蚕BmNs细胞系筛选高效gRNA靶位点系统的建立 | 第82-84页 |
| 5.2.3 利用靶位点筛选系统检测BmLMN基因的高效gRNA靶位点 | 第84页 |
| 5.2.4 构建后部丝腺特异的CRISPR/Cas9编辑系统 | 第84-86页 |
| 5.2.5 分析靶向编辑的F1代中BmLMN基因的突变 | 第86-90页 |
| 5.2.6 后部丝腺特异性编辑BmLMN基因的转基因个体的组织形态学观察 | 第90-92页 |
| 5.2.7 定量检测M1与M2中基因表达变化 | 第92-93页 |
| 5.2.8 转基因品系5龄 3 天PSG材料转录组差异分析 | 第93-97页 |
| 5.3 讨论 | 第97-100页 |
| 第六章 综合与结论 | 第100-104页 |
| 论文创新点 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-124页 |
| 申请专利、发表文章和参研课题 | 第124-126页 |
| 附录 | 第126-134页 |
| 致谢 | 第134-135页 |
