| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 鲸类与灵长类脑容量的显著增大 | 第10页 |
| 1.2 古生物学揭示鲸类脑容量增大的进化事件 | 第10-11页 |
| 1.3 脑容量增大的主要假说 | 第11-12页 |
| 1.4 头小畸形(MCPHs)基因研究进展 | 第12-17页 |
| 1.4.1 MCPHs基因的概述 | 第12-17页 |
| 1.4.2 MCPHs基因在野生动物大脑进化中的研究进展 | 第17页 |
| 1.5 本研究探讨的科学问题及意义 | 第17-18页 |
| 第二章 材料与方法 | 第18-31页 |
| 2.1 样本的收集和序列的获得 | 第18-20页 |
| 2.1.1 MCPHs基因的扩增 | 第18-19页 |
| 2.1.2 MCPHs基因的下载 | 第19-20页 |
| 2.2 选择压力分析 | 第20-21页 |
| 2.3 MCPHs基因的三维结构分析 | 第21页 |
| 2.4 MCPHs基因与鲸类表型的相关性分析 | 第21-22页 |
| 2.5 ASPM基因正选择位点的功能验证 | 第22-31页 |
| 2.5.1 前言 | 第22页 |
| 2.5.2 菌种与质粒 | 第22页 |
| 2.5.3 ASPM基因正选择位点定位到具体的IQ motif | 第22页 |
| 2.5.4 RNA的提取与反转录 | 第22-24页 |
| 2.5.5 pET-28a(+)-CaM质粒构建 | 第24-26页 |
| 2.5.6 His-CaM蛋白的表达与纯化 | 第26-28页 |
| 2.5.7 鲸类pGST-4T-1-IQ质粒构建 | 第28-29页 |
| 2.5.8 GST-IQ蛋白的表达与纯化 | 第29-30页 |
| 2.5.9 CaM与IQ蛋白相互作用 | 第30-31页 |
| 第三章 研究结果 | 第31-64页 |
| 3.1 MCPHs基因序列获得情况 | 第31-33页 |
| 3.2 鲸类MCPHs基因的进化分析 | 第33-47页 |
| 3.3 MCPHs基因正选择位点在三维结构的分布 | 第47-49页 |
| 3.4 MCPHs基因进化与鲸类大脑表型的相关性分析 | 第49页 |
| 3.5 MCPHs基因进化与鲸类集群大小的相关性分析 | 第49-55页 |
| 3.6 ASPM基因正选择位点的功能验证 | 第55-64页 |
| 3.6.1 PCR扩增CaM片段 | 第55-56页 |
| 3.6.2 双酶切鉴定重组质粒pET-28a-CaM | 第56页 |
| 3.6.3 Ni-IDA纯化CaM蛋白 | 第56-57页 |
| 3.6.4 Western blotting鉴定CaM蛋白 | 第57页 |
| 3.6.5 确定现生鲸类与最近祖先支不同的正选择位点 | 第57-58页 |
| 3.6.6 PCR扩增柏氏中喙鲸、白鱀豚与小须鲸正选择位点所在IQ motif | 第58-59页 |
| 3.6.7 PCR扩增瓶鼻海豚和条纹原海豚site1684所在IQ区 | 第59-60页 |
| 3.6.8 Western blotting鉴定pGEX-4T-1-IQ重组质粒 | 第60页 |
| 3.6.9 GST-pulldown鉴定ASPM正选择位点所在IQ蛋白与钙调蛋白CaM相互作用 | 第60-61页 |
| 3.6.10 Fortebio Octet进一步鉴定ASPM site 1684所在IQ蛋白与CaM相互作用 | 第61-64页 |
| 第四章 讨论 | 第64-69页 |
| 4.1 MCPHs基因的适应性进化普遍存在于鲸类进化谱系 | 第64-65页 |
| 4.2 鲸类MCPHs基因与大脑表型的相关性 | 第65-66页 |
| 4.3 鲸类脑容量的增大是应对复杂社会环境的结果 | 第66-67页 |
| 4.4 鲸类ASPM基因发生了适应性功能改变 | 第67-69页 |
| 第五章 小结 | 第69-70页 |
| 附录 A | 第70-85页 |
| 附录 B | 第85-87页 |
| 附录 C | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-98页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
